More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1576 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1576  putative hydrolase  100 
 
 		 182 aa  371  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.031095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1209  histidine triad (HIT) protein  58.91 
 
 		 131 aa  169  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.818472  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4872  histidine triad (HIT) protein  56.92 
 
 		 133 aa  166  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1004  histidine triad (HIT) protein  55.74 
 
 		 125 aa  157  7e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4565  histidine triad (HIT) protein  57.26 
 
 		 130 aa  156  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  53.28 
 
 		 1077 aa  136  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1000  hypothetical protein  50.82 
 
 		 122 aa  133  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04560  histidine triad (HIT) protein  47.5 
 
 		 122 aa  131  3.9999999999999996e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1435  histidine triad (HIT) protein  53.33 
 
 		 126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1659  histidine triad (HIT) protein  49.15 
 
 		 125 aa  127  8.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.490499  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0365  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 		 121 aa  124  5e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.5377  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2227  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  46.72 
 
 		 122 aa  123  1e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1483  hypothetical protein  46.02 
 
 		 142 aa  122  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0651  histidine triad (HIT) protein  46.67 
 
 		 120 aa  120  8e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0007662  unclonable  0.000000000136009 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0142  histidine triad (HIT) protein  47.83 
 
 		 130 aa  120  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3984  type III restriction protein res subunit  47.46 
 
 		 1418 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07720  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  47.15 
 
 		 131 aa  111  7.000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0929  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  44.74 
 
 		 126 aa  108  3e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.685079  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0450  hypothetical protein  44.17 
 
 		 124 aa  106  2e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4049  histidine triad (HIT) protein  33.14 
 
 		 289 aa  104  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0398  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 		 284 aa  102  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0296  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  45.74 
 
 		 127 aa  102  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0432  histidine triad (HIT) protein  43.1 
 
 		 149 aa  102  4e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0920  histidine triad (HIT) protein  35.5 
 
 		 174 aa  99.8  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.675581  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4113  histidine triad (HIT) protein  39.83 
 
 		 289 aa  99.4  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.489073 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1488  histidine triad (HIT) protein  57.61 
 
 		 109 aa  99  4e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000559646  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1420  histidine triad (HIT) protein  36.75 
 
 		 179 aa  94.7  6e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0077  histidine triad (HIT) protein  38.17 
 
 		 138 aa  92.8  3e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1740  histidine triad protein  36.51 
 
 		 139 aa  92  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0596  histidine triad (HIT) protein  35.78 
 
 		 131 aa  80.1  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1531  histidine triad (HIT) protein  34.58 
 
 		 136 aa  79.7  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3993  type III restriction protein res subunit  59.09 
 
 		 1348 aa  79.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3642  histidine triad (HIT) protein  38.32 
 
 		 145 aa  77.8  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0807517  normal  0.0488836 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3726  histidine triad (HIT) protein  38.89 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1333  histidine triad (HIT) protein  36.79 
 
 		 130 aa  77.4  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0568524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1342  histidine triad (HIT) protein  36.79 
 
 		 130 aa  77.4  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0074  histidine triad (HIT) protein  35.71 
 
 		 180 aa  76.6  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2145  histidine triad (HIT) protein  34.75 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1342  histidine triad (HIT) protein  38.89 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2944  histidine triad (HIT) protein  33.09 
 
 		 179 aa  75.9  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.173088  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2454  histidine triad (HIT) protein  35.59 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.832288  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3108  histidine triad (HIT) protein  36.61 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0620  histidine triad (HIT) protein  34.91 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.693859  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1701  HIT family protein  34.56 
 
 		 162 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.652784  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12632  hypothetical protein  31.1 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0100073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0254  histidine triad (HIT) protein  37.86 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1658  histidine triad (HIT) protein  31.34 
 
 		 164 aa  72.4  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0075  histidine triad (HIT) protein  36.22 
 
 		 143 aa  72  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1657  histidine triad (HIT) protein  31.53 
 
 		 190 aa  71.6  0.000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.411198  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1638  histidine triad (HIT) protein  29.85 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000357011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2525  histidine triad (HIT) protein  42.5 
 
 		 181 aa  71.6  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.271713  normal  0.184582 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0187  histidine triad (HIT) protein  31.34 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.414611  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1376  histidine triad (HIT) protein  40.78 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2074  histidine triad (HIT) protein  30.6 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165381  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1390  protein kinase C inhibitor  42.7 
 
 		 114 aa  71.2  0.000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0562  histidine triad (HIT) protein  31.19 
 
 		 167 aa  71.2  0.000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1325  histidine triad (HIT) protein  37.5 
 
 		 160 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0365255  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4014  histidine triad (HIT) protein  38.46 
 
 		 137 aa  70.9  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2400  histidine triad (HIT) protein  34.26 
 
 		 183 aa  70.9  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  hitchhiker  0.0085284 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0472  HIT family protein  30.84 
 
 		 131 aa  70.9  0.00000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.974422  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1749  histidine triad (HIT) protein  33.03 
 
 		 139 aa  70.5  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0449  diadenosine tetraphosphate hydrolase  36.36 
 
 		 194 aa  70.5  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2372  histidine triad (HIT) protein  34.35 
 
 		 174 aa  70.9  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1025  histidine triad (HIT) protein  30.19 
 
 		 135 aa  70.1  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0096  histidine triad (HIT) protein  33.68 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4476  putative histidine triad (HIT) protein  38.89 
 
 		 141 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000626279 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2958  histidine triad (HIT) protein  37.5 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3968  histidine triad (HIT) protein  37.78 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2053  histidine triad (HIT) protein  38.52 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.109814 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2559  histidine triad (HIT) protein  33.94 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1522  histidine triad (HIT) protein  32.39 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.311815  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0010  histidine triad (HIT) protein  31.75 
 
 		 169 aa  69.3  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0387329  normal  0.117285 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0927  HIT family hydrolase  31.34 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1891  histidine triad (HIT) protein  37.74 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1783  histidine triad (HIT) protein  39.81 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.344857  normal  0.911997 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2282  histidine triad (HIT) protein  33.03 
 
 		 244 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.983913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2243  histidine triad (HIT) protein  33.03 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.118301  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2290  histidine triad (HIT) protein  33.03 
 
 		 244 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.358271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1376  histidine triad (HIT) protein  34.26 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.341423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0472  histidine triad (HIT) protein  34 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0711  histidine triad (HIT) protein  37.84 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0363676  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2098  histidine triad (HIT) protein  32.76 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00118589  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1357  histidine triad (HIT) protein  32.73 
 
 		 250 aa  68.2  0.00000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.474283 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0004  histidine triad (HIT) protein  36.13 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0275782 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1920  histidine triad (HIT) protein  35.24 
 
 		 182 aa  67.8  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.629691  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3837  histidine triad (HIT) protein  33.03 
 
 		 182 aa  67.8  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.868089  normal  0.143653 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2542  histidine triad (HIT) protein  34.58 
 
 		 174 aa  67.8  0.00000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0141  histidine triad (HIT) protein  34.91 
 
 		 144 aa  67  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1225  histidine triad (HIT) protein  28.03 
 
 		 171 aa  66.6  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2890  histidine triad (HIT) protein  32.08 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3327  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.036152 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2042  histidine triad (HIT) protein  36.94 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000192809 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1980  histidine triad (HIT) protein  35.04 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000948071 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5333  histidine triad (HIT) protein  41.11 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2064  histidine triad (HIT) protein  32.37 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.225025 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5415  histidine triad (HIT) protein  41.11 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.269942  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4791  histidine triad (HIT) protein  41.11 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1342  histidine triad (HIT) protein  31.19 
 
 		 163 aa  66.6  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.187699  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5446  histidine triad (HIT) protein  41.11 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.311796 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2345  histidine triad (HIT) protein  31.69 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>