More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4565 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4565  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 		 130 aa  270  7e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1209  histidine triad (HIT) protein  71.09 
 
 		 131 aa  194  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.818472  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4872  histidine triad (HIT) protein  71.43 
 
 		 133 aa  194  4.0000000000000005e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1004  histidine triad (HIT) protein  64.23 
 
 		 125 aa  174  4e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1576  putative hydrolase  57.26 
 
 		 182 aa  161  3e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.031095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04560  histidine triad (HIT) protein  50.83 
 
 		 122 aa  141  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  54.33 
 
 		 1077 aa  139  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1483  hypothetical protein  50 
 
 		 142 aa  135  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1000  hypothetical protein  53.23 
 
 		 122 aa  135  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1435  histidine triad (HIT) protein  56.56 
 
 		 126 aa  133  7.000000000000001e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2227  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  49.18 
 
 		 122 aa  127  5.0000000000000004e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0651  histidine triad (HIT) protein  50.83 
 
 		 120 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0007662  unclonable  0.000000000136009 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0142  histidine triad (HIT) protein  49.56 
 
 		 130 aa  120  6e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0365  histidine triad (HIT) protein  48.31 
 
 		 121 aa  117  6e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.5377  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07720  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  46.4 
 
 		 131 aa  116  9e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0450  hypothetical protein  48.33 
 
 		 124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1659  histidine triad (HIT) protein  44.92 
 
 		 125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.490499  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0398  histidine triad (HIT) protein  44.92 
 
 		 284 aa  110  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0077  histidine triad (HIT) protein  45.67 
 
 		 138 aa  110  7.000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4049  histidine triad (HIT) protein  42.98 
 
 		 289 aa  110  9e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3984  type III restriction protein res subunit  44.92 
 
 		 1418 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0296  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  44.88 
 
 		 127 aa  107  5e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0432  histidine triad (HIT) protein  43.9 
 
 		 149 aa  104  5e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4113  histidine triad (HIT) protein  38.21 
 
 		 289 aa  100  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.489073 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0929  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  42.02 
 
 		 126 aa  100  6e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.685079  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1488  histidine triad (HIT) protein  55.43 
 
 		 109 aa  98.6  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000559646  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1740  histidine triad protein  40.31 
 
 		 139 aa  95.1  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0920  histidine triad (HIT) protein  32.73 
 
 		 174 aa  90.9  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.675581  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1420  histidine triad (HIT) protein  32.08 
 
 		 179 aa  89.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0074  histidine triad (HIT) protein  35.71 
 
 		 180 aa  80.5  0.000000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2345  histidine triad (HIT) protein  37.82 
 
 		 165 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2433  histidine triad (HIT) protein  37.82 
 
 		 165 aa  79.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106121  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1151  HIT family protein  37.82 
 
 		 165 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0978  HIT family protein  37.29 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0966  HIT family protein  37.82 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0957  HIT family protein  37.82 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1047  HIT family protein  37.29 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0962  histidine triad (HIT) protein  37.82 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1212  HIT family protein  37.82 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1124  HIT family protein  37.82 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4221  HIT family protein  38.89 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.071329  normal  0.0179678 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1083  HIT family protein  38.89 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2944  histidine triad (HIT) protein  34.23 
 
 		 179 aa  77.8  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.173088  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2598  histidine triad (HIT) protein  38.53 
 
 		 169 aa  77.8  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0814  histidine triad (HIT) protein  38.74 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1522  histidine triad (HIT) protein  36.97 
 
 		 165 aa  77  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.311815  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2525  histidine triad (HIT) protein  35.78 
 
 		 181 aa  77  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.271713  normal  0.184582 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3726  histidine triad (HIT) protein  37.84 
 
 		 138 aa  77  0.00000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2454  histidine triad (HIT) protein  37.74 
 
 		 145 aa  77  0.00000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.832288  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3108  histidine triad (HIT) protein  37.74 
 
 		 143 aa  77  0.00000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0075  histidine triad (HIT) protein  39.84 
 
 		 143 aa  76.3  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0644  histidine triad (HIT) protein  39.42 
 
 		 140 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0187  histidine triad (HIT) protein  37.6 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.414611  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0254  histidine triad (HIT) protein  39.58 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0010  histidine triad (HIT) protein  31.58 
 
 		 169 aa  74.3  0.0000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0387329  normal  0.117285 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1025  histidine triad (HIT) protein  34.26 
 
 		 135 aa  73.9  0.0000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3993  type III restriction protein res subunit  64.71 
 
 		 1348 aa  74.3  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1342  histidine triad (HIT) protein  35.58 
 
 		 130 aa  73.9  0.0000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3954  histidine triad (HIT) protein  42.73 
 
 		 143 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4028  histidine triad (HIT) protein  42.73 
 
 		 143 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1524  histidine triad (HIT) protein  34.55 
 
 		 166 aa  73.6  0.0000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3968  histidine triad (HIT) protein  42.73 
 
 		 143 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.777319  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0230  histidine triad (HIT) protein  37.74 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1376  histidine triad (HIT) protein  39.42 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1228  histidine triad (HIT) protein  31.53 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1444  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  38.32 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000339612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1658  histidine triad (HIT) protein  33.63 
 
 		 164 aa  72.4  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1333  histidine triad (HIT) protein  35.58 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0568524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1531  histidine triad (HIT) protein  31.78 
 
 		 136 aa  72  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0357  histidine triad (HIT) protein  36.61 
 
 		 298 aa  71.6  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0469904 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0492  HIT family protein  39.56 
 
 		 138 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1461  histidine triad (HIT) protein  38.89 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1342  histidine triad (HIT) protein  35.71 
 
 		 163 aa  71.2  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.187699  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0551  histidine triad (HIT) protein  32.74 
 
 		 181 aa  71.2  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1342  histidine triad (HIT) protein  35.58 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0207  HIT family protein  39.56 
 
 		 138 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0979  HIT family protein  39.56 
 
 		 138 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.721312  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2239  histidine triad (HIT) protein  39.66 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.640796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0238  HIT family protein  39.56 
 
 		 138 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2559  HIT family protein  39.56 
 
 		 138 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.609142  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2703  HIT family protein  39.56 
 
 		 138 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1382  HIT family protein  39.56 
 
 		 138 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1579  HIT family protein  39.56 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.380866  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4456  histidine triad (HIT) protein  38.53 
 
 		 145 aa  70.1  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1980  histidine triad (HIT) protein  34.55 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000948071 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1462  histidine triad (HIT) protein  34.23 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1183  histidine triad (HIT) protein  35.71 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.970277  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4476  putative histidine triad (HIT) protein  41.49 
 
 		 141 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000626279 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1225  histidine triad (HIT) protein  33.62 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1102  hypothetical protein  29.66 
 
 		 176 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.545015 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1497  histidine triad (HIT) protein  35.14 
 
 		 163 aa  68.9  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0842593  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0269  histidine triad protein HIT  33.6 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0663739  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11288  HIT family protein  38.4 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.750453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2280  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  33.94 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0620  histidine triad (HIT) protein  34.95 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.693859  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3327  histidine triad (HIT) protein  43.01 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.036152 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1377  histidine triad (HIT) protein  32.14 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0235527  normal  0.0272856 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1376  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.341423  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1373  HIT family protein  36.11 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00295303  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1504  HIT (HINT, histidine triad) family protein  32.43 
 
 		 165 aa  68.6  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000163027  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>