More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1025 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1025  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 
135 aa  273  5e-73  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1050  histidine triad (HIT) protein  47.69 
 
 
139 aa  132  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.265499  normal  0.307581 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2169  histidine triad (HIT) protein  40.77 
 
 
140 aa  124  5e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0096  histidine triad (HIT) protein  40.44 
 
 
139 aa  123  9e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1749  histidine triad (HIT) protein  40.46 
 
 
139 aa  113  7.999999999999999e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1740  histidine triad protein  40 
 
 
139 aa  99  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0075  histidine triad (HIT) protein  42.06 
 
 
143 aa  99  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0596  histidine triad (HIT) protein  40.91 
 
 
131 aa  97.1  8e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1333  histidine triad (HIT) protein  34.09 
 
 
130 aa  94  7e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0568524  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1342  histidine triad (HIT) protein  34.09 
 
 
130 aa  93.6  9e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3399  histidine triad (HIT) protein  34.07 
 
 
149 aa  92.8  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.163397  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0620  histidine triad (HIT) protein  34.09 
 
 
130 aa  92  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.693859  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1531  histidine triad (HIT) protein  33.81 
 
 
136 aa  91.7  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1342  histidine triad (HIT) protein  35.85 
 
 
130 aa  89.4  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2539  histidine triad (HIT) protein  36.57 
 
 
139 aa  87.8  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2280  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  42.2 
 
 
132 aa  87.4  6e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1573  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  45.3 
 
 
139 aa  87.4  6e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00190  hydrolase, putative  37.78 
 
 
140 aa  82.4  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0919  histidine triad (HIT) protein  29.85 
 
 
140 aa  80.5  0.000000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.420438  normal  0.191843 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1891  histidine triad (HIT) protein  40.91 
 
 
137 aa  80.1  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03708  HIT domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G12680)  38.74 
 
 
133 aa  79.7  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.117728  normal  0.7439 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0381  protein kinase C1 inhibitor  39.09 
 
 
139 aa  79.7  0.00000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1163  histidine triad (HIT) protein  44.23 
 
 
113 aa  79.3  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1151  HIT family protein  39.81 
 
 
165 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1805  histidine triad (HIT) protein  34.07 
 
 
141 aa  78.2  0.00000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.496797 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1212  HIT family protein  39.81 
 
 
144 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0966  HIT family protein  39.81 
 
 
144 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0957  HIT family protein  39.81 
 
 
144 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1124  HIT family protein  39.81 
 
 
144 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4584  histidine triad (HIT) protein  34.33 
 
 
129 aa  78.2  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000842385  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0862  histidine triad (HIT) protein  29.1 
 
 
140 aa  77.8  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.379989  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0788  histidine triad (HIT) protein  36.89 
 
 
113 aa  77.8  0.00000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.927193  normal  0.0285897 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1561  histidine triad (HIT) protein  37.04 
 
 
139 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1614  histidine triad (HIT) protein  32.59 
 
 
139 aa  77.8  0.00000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2848  histidine triad (HIT) protein  35.78 
 
 
136 aa  77.4  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1083  HIT family protein  40.19 
 
 
144 aa  77  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4702  histidine triad (HIT) protein  41.35 
 
 
144 aa  77.4  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557305 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4221  HIT family protein  40.19 
 
 
144 aa  77  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.071329  normal  0.0179678 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0962  histidine triad (HIT) protein  40.37 
 
 
144 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0814  histidine triad (HIT) protein  39.45 
 
 
144 aa  77  0.00000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0492  HIT family protein  37.61 
 
 
138 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0207  HIT family protein  36.7 
 
 
138 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0258  histidine triad (HIT) protein  38.24 
 
 
117 aa  75.5  0.0000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0979  HIT family protein  36.7 
 
 
138 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.721312  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3968  histidine triad (HIT) protein  35 
 
 
141 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0238  HIT family protein  36.7 
 
 
138 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1579  HIT family protein  36.7 
 
 
139 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.380866  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6201  histidine triad (HIT) protein  31.53 
 
 
141 aa  75.5  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.488321  normal  0.398749 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1632  HIT family protein  35.82 
 
 
130 aa  75.9  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0437202  hitchhiker  0.00568101 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0644  histidine triad (HIT) protein  41.35 
 
 
140 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2703  HIT family protein  36.7 
 
 
138 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2559  HIT family protein  36.7 
 
 
138 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.609142  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0077  histidine triad (HIT) protein  33.96 
 
 
138 aa  75.9  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1382  HIT family protein  36.7 
 
 
138 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2237  histidine triad (HIT) protein  35.78 
 
 
138 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1461  histidine triad (HIT) protein  40.38 
 
 
143 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0711  histidine triad (HIT) protein  30.37 
 
 
142 aa  75.1  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0363676  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42119  protein kinase C inhibitor-I, histidine triad nucleotide-binding protein-like protein  37.59 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.149088 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2281  HIT family protein  40.78 
 
 
114 aa  75.5  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0312  histidine triad (HIT) protein  36.27 
 
 
110 aa  75.1  0.0000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0762523  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0370  HIT family protein  34.81 
 
 
139 aa  74.7  0.0000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0865  histidine triad domain protein  39.6 
 
 
120 aa  74.7  0.0000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1444  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  38.89 
 
 
144 aa  74.7  0.0000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000339612  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1376  histidine triad (HIT) protein  33.82 
 
 
151 aa  74.3  0.0000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.341423  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4476  putative histidine triad (HIT) protein  36 
 
 
141 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000626279 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0978  HIT family protein  38.89 
 
 
144 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1047  HIT family protein  38.89 
 
 
144 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2135  histidine triad (HIT) protein  32.06 
 
 
148 aa  73.9  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.605825  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4498  histidine triad (HIT) protein  34.26 
 
 
140 aa  73.9  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11288  HIT family protein  31.62 
 
 
144 aa  73.6  0.0000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.750453  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1996  HIT family protein  39.81 
 
 
114 aa  73.6  0.0000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0832  histidine triad (HIT) protein  30.43 
 
 
141 aa  72.8  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1284  histidine triad (HIT) protein  28.36 
 
 
142 aa  72.8  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3108  histidine triad (HIT) protein  37.04 
 
 
143 aa  72  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2801  histidine triad (HIT) protein  40.78 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.106273  normal  0.788809 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2454  histidine triad (HIT) protein  36.7 
 
 
145 aa  72  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.832288  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0597  diadenosine tetraphosphate hydrolase  39 
 
 
112 aa  72  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6333  histidine triad (HIT) protein  36.11 
 
 
142 aa  72  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303729  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0197  histidine triad (HIT) protein  36.27 
 
 
114 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.54784  normal  0.0954658 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3248  histidine triad (HIT) protein  38.83 
 
 
116 aa  72  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00763147  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0629  histidine triad (HIT) protein  32.67 
 
 
112 aa  71.6  0.000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.17683  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4827  histidine triad (HIT) protein  32.41 
 
 
143 aa  72  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.487703  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4565  histidine triad (HIT) protein  34.26 
 
 
130 aa  71.6  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1190  histidine triad (HIT) protein  35.85 
 
 
114 aa  71.2  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.225426  normal  0.102712 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2448  histidine triad (HIT) protein  37.74 
 
 
112 aa  71.2  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5451  histidine triad (HIT) protein  37.14 
 
 
115 aa  71.2  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13570  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  35.29 
 
 
130 aa  71.6  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2991  histidine triad (HIT) protein  39.81 
 
 
113 aa  71.2  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.337185  normal  0.959668 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3349  histidine triad (HIT) protein  31.19 
 
 
148 aa  71.2  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425203 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3833  histidine triad (HIT) protein  37.86 
 
 
120 aa  70.9  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12220  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  39.64 
 
 
130 aa  70.9  0.000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0531  histidine triad (HIT) protein  35.85 
 
 
137 aa  70.9  0.000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.406416  normal  0.0183035 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1102  hypothetical protein  35.54 
 
 
176 aa  70.5  0.000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.545015 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3642  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 
145 aa  70.5  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0807517  normal  0.0488836 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1499  histidine triad (HIT) protein  36.54 
 
 
116 aa  70.5  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000936763  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1310  histidine triad (HIT) protein  41.35 
 
 
114 aa  70.5  0.000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0952  histidine triad (HIT) protein  39.05 
 
 
143 aa  70.1  0.000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000117681  hitchhiker  0.00115812 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3327  histidine triad (HIT) protein  33.66 
 
 
139 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.036152 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4872  histidine triad (HIT) protein  33.64 
 
 
133 aa  70.1  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1576  putative hydrolase  30.19 
 
 
182 aa  70.1  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.031095  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>