More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0711 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0711  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 		 142 aa  278  1e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0363676  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1993  histidine triad (HIT) protein  55.56 
 
 		 140 aa  143  6e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4456  histidine triad (HIT) protein  50.37 
 
 		 145 aa  135  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2239  histidine triad (HIT) protein  48.15 
 
 		 145 aa  130  6.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.640796  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0327  histidine triad (HIT) protein  47.79 
 
 		 144 aa  130  7.999999999999999e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0007671  normal  0.0222978 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3954  histidine triad (HIT) protein  47.06 
 
 		 143 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4028  histidine triad (HIT) protein  47.06 
 
 		 143 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3968  histidine triad (HIT) protein  47.06 
 
 		 143 aa  128  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.777319  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6595  histidine triad (HIT) protein  48.51 
 
 		 148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6201  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 		 141 aa  123  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.488321  normal  0.398749 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11288  HIT family protein  49.59 
 
 		 144 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.750453  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3349  histidine triad (HIT) protein  50.46 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425203 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0075  histidine triad (HIT) protein  47.2 
 
 		 143 aa  111  3e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2169  histidine triad (HIT) protein  43.31 
 
 		 140 aa  106  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2237  histidine triad (HIT) protein  46.36 
 
 		 138 aa  106  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1263  histidine triad (HIT) protein  40.74 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000437908  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1050  histidine triad (HIT) protein  36.5 
 
 		 139 aa  101  4e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.265499  normal  0.307581 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1783  histidine triad (HIT) protein  43.22 
 
 		 148 aa  100  7e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.344857  normal  0.911997 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1891  histidine triad (HIT) protein  47.66 
 
 		 137 aa  100  9e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0370  HIT family protein  40.19 
 
 		 139 aa  99.8  1e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1664  histidine triad (HIT) protein  46.79 
 
 		 145 aa  99  2e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.147901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3726  histidine triad (HIT) protein  42.2 
 
 		 138 aa  98.6  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1333  histidine triad (HIT) protein  39.25 
 
 		 130 aa  98.2  3e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0568524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1342  histidine triad (HIT) protein  39.25 
 
 		 130 aa  98.6  3e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4085  putative HIT family protein  44.92 
 
 		 153 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47340  putative HIT family protein  44.92 
 
 		 153 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1573  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  39.09 
 
 		 139 aa  97.4  5e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00190  hydrolase, putative  36.76 
 
 		 140 aa  97.4  6e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1805  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 		 141 aa  97.1  8e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.496797 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0644  histidine triad (HIT) protein  42.06 
 
 		 140 aa  95.5  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1740  histidine triad protein  37.4 
 
 		 139 aa  95.5  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0620  histidine triad (HIT) protein  39.25 
 
 		 130 aa  95.9  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.693859  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1342  histidine triad (HIT) protein  36.45 
 
 		 130 aa  95.5  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4827  histidine triad (HIT) protein  47.06 
 
 		 143 aa  95.9  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.487703  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1376  histidine triad (HIT) protein  44.25 
 
 		 151 aa  94.7  3e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.341423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2848  histidine triad (HIT) protein  38.69 
 
 		 136 aa  94  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2539  histidine triad (HIT) protein  39.47 
 
 		 139 aa  92  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1373  HIT family protein  39.29 
 
 		 141 aa  92  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00295303  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0096  histidine triad (HIT) protein  40.74 
 
 		 139 aa  91.7  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1749  histidine triad (HIT) protein  32.37 
 
 		 139 aa  91.3  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1461  histidine triad (HIT) protein  43.27 
 
 		 143 aa  91.3  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3642  histidine triad (HIT) protein  45.05 
 
 		 145 aa  90.9  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0807517  normal  0.0488836 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0531  histidine triad (HIT) protein  46.23 
 
 		 137 aa  90.9  6e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.406416  normal  0.0183035 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03708  HIT domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G12680)  38.68 
 
 		 133 aa  90.5  7e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.117728  normal  0.7439 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0381  protein kinase C1 inhibitor  36.94 
 
 		 139 aa  90.5  7e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1614  histidine triad (HIT) protein  43.93 
 
 		 139 aa  90.1  8e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0596  histidine triad (HIT) protein  32.74 
 
 		 131 aa  89.7  1e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2280  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  37.38 
 
 		 132 aa  89.7  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1561  histidine triad (HIT) protein  38.39 
 
 		 139 aa  89.4  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1151  HIT family protein  37.96 
 
 		 165 aa  89  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0966  HIT family protein  39.05 
 
 		 144 aa  88.6  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0957  HIT family protein  39.05 
 
 		 144 aa  88.6  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1212  HIT family protein  39.05 
 
 		 144 aa  88.6  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1124  HIT family protein  39.05 
 
 		 144 aa  88.6  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1083  HIT family protein  39.05 
 
 		 144 aa  88.6  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4221  HIT family protein  39.05 
 
 		 144 aa  88.6  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.071329  normal  0.0179678 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1925  histidine triad (HIT) protein  39.29 
 
 		 140 aa  88.6  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1852  histidine triad (HIT) protein  42.31 
 
 		 114 aa  88.2  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.279518 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1891  histidine triad (HIT) protein  39.29 
 
 		 140 aa  88.6  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.472953  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1531  histidine triad (HIT) protein  37.93 
 
 		 136 aa  87.8  4e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2145  histidine triad (HIT) protein  42.99 
 
 		 146 aa  86.3  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3451  histidine triad (HIT) protein  38.41 
 
 		 149 aa  86.7  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.923698  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0962  histidine triad (HIT) protein  39.05 
 
 		 144 aa  86.7  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1284  histidine triad (HIT) protein  43.52 
 
 		 142 aa  86.7  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2890  histidine triad (HIT) protein  30.88 
 
 		 139 aa  85.9  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0814  histidine triad (HIT) protein  38.89 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4872  histidine triad (HIT) protein  41.46 
 
 		 133 aa  85.9  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1228  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  37.38 
 
 		 140 aa  85.9  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0892724  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0919  histidine triad (HIT) protein  41.98 
 
 		 140 aa  84.7  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.420438  normal  0.191843 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1209  histidine triad (HIT) protein  42.2 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.818472  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0978  HIT family protein  38.1 
 
 		 144 aa  84.7  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_397  HIT domain protein  41.58 
 
 		 113 aa  84.7  4e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.647527  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1047  HIT family protein  38.1 
 
 		 144 aa  84.7  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3399  histidine triad (HIT) protein  44.86 
 
 		 149 aa  84.7  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.163397  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0455  HIT domain-containing protein  41.58 
 
 		 113 aa  84.3  5e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.378719  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0257  histidine triad (HIT) protein  48.04 
 
 		 114 aa  84.3  5e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.076092  hitchhiker  0.00409466 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1996  HIT family protein  35.58 
 
 		 114 aa  83.6  9e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0432  histidine triad (HIT) protein  42.57 
 
 		 113 aa  83.6  9e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0312734  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0004  histidine triad (HIT) protein  38.32 
 
 		 149 aa  82.8  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0275782 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0862  histidine triad (HIT) protein  41.22 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.379989  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0254  histidine triad (HIT) protein  43.27 
 
 		 145 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4498  histidine triad (HIT) protein  41.07 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2281  HIT family protein  35.58 
 
 		 114 aa  82.8  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1009  histidine triad (HIT) protein  43.22 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1532  histidine triad (HIT) protein  41.67 
 
 		 145 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.77898  normal  0.453293 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0781  histidine triad (HIT) protein  42.11 
 
 		 135 aa  81.3  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1829  putative HIT family protein  40.74 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0472  HIT family protein  29.2 
 
 		 131 aa  80.9  0.000000000000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.974422  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1444  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  33.33 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000339612  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl245  putative nucleotidyl hydrolase/transferase  31.01 
 
 		 135 aa  80.9  0.000000000000006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2991  histidine triad (HIT) protein  38.61 
 
 		 113 aa  80.5  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.337185  normal  0.959668 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12200  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  37.5 
 
 		 114 aa  80.5  0.000000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1004  histidine triad (HIT) protein  39.29 
 
 		 125 aa  80.5  0.000000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1076  histidine triad (HIT) protein  42.45 
 
 		 114 aa  80.5  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1730  histidine triad (HIT) protein  35.71 
 
 		 117 aa  80.1  0.000000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.020903 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21440  putative HIT family protein  39.81 
 
 		 145 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.117632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0269  histidine triad protein HIT  31.36 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0663739  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1025  histidine triad (HIT) protein  31.11 
 
 		 135 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3248  histidine triad (HIT) protein  41.58 
 
 		 116 aa  79.7  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00763147  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2454  histidine triad (HIT) protein  41.12 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.832288  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>