More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1228 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1228  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  100 
 
 
140 aa  284  2.9999999999999996e-76  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0892724  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1275  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  66.19 
 
 
139 aa  189  9e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1444  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  52.9 
 
 
144 aa  149  2e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000339612  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1263  histidine triad (HIT) protein  55.4 
 
 
144 aa  147  6e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000437908  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0370  HIT family protein  56.19 
 
 
139 aa  129  1.0000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1573  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  57.94 
 
 
139 aa  127  5.0000000000000004e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1461  histidine triad (HIT) protein  48.2 
 
 
143 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1151  HIT family protein  50 
 
 
165 aa  122  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0814  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 
144 aa  122  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0966  HIT family protein  50 
 
 
144 aa  122  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0957  HIT family protein  50 
 
 
144 aa  122  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1124  HIT family protein  50 
 
 
144 aa  122  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1891  histidine triad (HIT) protein  58.49 
 
 
140 aa  122  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.472953  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1925  histidine triad (HIT) protein  58.49 
 
 
140 aa  122  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1212  HIT family protein  50 
 
 
144 aa  122  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4221  HIT family protein  50 
 
 
144 aa  121  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.071329  normal  0.0179678 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1083  HIT family protein  50 
 
 
144 aa  121  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1373  HIT family protein  57.55 
 
 
141 aa  120  5e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00295303  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0962  histidine triad (HIT) protein  48.53 
 
 
144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0978  HIT family protein  49.26 
 
 
144 aa  118  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1047  HIT family protein  49.26 
 
 
144 aa  118  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0644  histidine triad (HIT) protein  49.63 
 
 
140 aa  117  7e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2280  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  55.96 
 
 
132 aa  116  7.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0381  protein kinase C1 inhibitor  40.44 
 
 
139 aa  105  1e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2539  histidine triad (HIT) protein  45.87 
 
 
139 aa  104  4e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0254  histidine triad (HIT) protein  44.14 
 
 
145 aa  103  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4498  histidine triad (HIT) protein  41.18 
 
 
140 aa  102  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21440  putative HIT family protein  46.85 
 
 
145 aa  101  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.117632  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3108  histidine triad (HIT) protein  43.12 
 
 
143 aa  100  6e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2454  histidine triad (HIT) protein  43.12 
 
 
145 aa  100  6e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.832288  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4837  histidine triad (HIT) protein  41.67 
 
 
140 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0161096  normal  0.332557 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0781  histidine triad (HIT) protein  39.13 
 
 
135 aa  99.4  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1829  putative HIT family protein  45.05 
 
 
145 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4689  histidine triad (HIT) protein  45.71 
 
 
142 aa  99  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0956525  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2534  HIT family protein  45.45 
 
 
141 aa  99.4  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.91947  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4320  histidine triad (HIT) protein  45.71 
 
 
142 aa  99  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0862778  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0004  histidine triad (HIT) protein  44.44 
 
 
149 aa  97.8  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0275782 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2145  histidine triad (HIT) protein  40.37 
 
 
146 aa  97.8  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538577  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1574  histidine triad (HIT) protein  44.55 
 
 
141 aa  97.1  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.650242  normal  0.227098 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0006  histidine triad (HIT) protein  42.54 
 
 
142 aa  96.7  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0070148  unclonable  0.000000000279381 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1532  histidine triad (HIT) protein  43.24 
 
 
145 aa  95.9  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.77898  normal  0.453293 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3316  histidine triad (HIT) protein  47.71 
 
 
142 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.33287  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1292  histidine triad (HIT) protein  44.14 
 
 
145 aa  96.7  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.268815  normal  0.885199 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2024  histidine triad (HIT) protein  45.71 
 
 
140 aa  95.5  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0472  HIT family protein  42.45 
 
 
131 aa  95.5  2e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.974422  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2237  histidine triad (HIT) protein  37.96 
 
 
138 aa  95.1  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0579  histidine triad domain-containing protein  41.18 
 
 
140 aa  94.7  4e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0235717  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4702  histidine triad (HIT) protein  43.64 
 
 
144 aa  94.4  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557305 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2451  histidine triad (HIT) protein  49.06 
 
 
142 aa  94.4  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.94056  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4014  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 
137 aa  94  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1561  histidine triad (HIT) protein  34.78 
 
 
139 aa  93.6  7e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0075  histidine triad (HIT) protein  41.04 
 
 
138 aa  93.2  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  0.167835 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1771  histidine triad (HIT) protein  43.12 
 
 
143 aa  92.8  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123943  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0211  histidine triad (HIT) protein  39.64 
 
 
145 aa  92.8  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3726  histidine triad (HIT) protein  42.59 
 
 
138 aa  92.8  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1168  HIT family protein  44.76 
 
 
140 aa  92  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.247304  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2801  histidine triad (HIT) protein  45.63 
 
 
139 aa  92  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.106273  normal  0.788809 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3753  histidine triad (HIT) protein  36.96 
 
 
145 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0746  histidine triad (HIT) protein  42.73 
 
 
145 aa  91.7  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00337572 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1125  HIT family protein  43.81 
 
 
140 aa  91.7  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.20711  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2290  histidine triad (HIT) protein  40.54 
 
 
139 aa  91.3  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0096  histidine triad (HIT) protein  37.23 
 
 
139 aa  90.1  8e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1993  histidine triad (HIT) protein  37.19 
 
 
140 aa  90.1  9e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2405  histidine triad (HIT) protein  47.17 
 
 
142 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.112602  normal  0.457991 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1531  histidine triad (HIT) protein  42.48 
 
 
136 aa  89.4  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0494  putative HIT-like protein  43.64 
 
 
144 aa  89  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2926  histidine triad (HIT) protein  40.91 
 
 
149 aa  89  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1376  histidine triad (HIT) protein  44.66 
 
 
151 aa  88.2  3e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.341423  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3349  histidine triad (HIT) protein  37.61 
 
 
148 aa  88.2  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425203 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3046  histidine triad (HIT) protein  46.67 
 
 
142 aa  88.2  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01700  HIT family protein  40.15 
 
 
129 aa  87.8  5e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127711  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3549  histidine triad (HIT) protein  46.23 
 
 
142 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276085  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3139  histidine triad (HIT) protein  40.54 
 
 
143 aa  86.7  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0448341 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl245  putative nucleotidyl hydrolase/transferase  41.51 
 
 
135 aa  84.7  3e-16  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1740  histidine triad protein  42.98 
 
 
139 aa  84.7  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3451  histidine triad (HIT) protein  37.41 
 
 
149 aa  85.1  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.923698  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1376  histidine triad (HIT) protein  36.28 
 
 
145 aa  85.1  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3101  histidine triad (HIT) protein  41.67 
 
 
118 aa  84.7  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3642  histidine triad (HIT) protein  37.61 
 
 
145 aa  84.3  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0807517  normal  0.0488836 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2848  histidine triad (HIT) protein  41.44 
 
 
136 aa  84.3  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2169  histidine triad (HIT) protein  37.88 
 
 
140 aa  83.6  8e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2239  histidine triad (HIT) protein  40.37 
 
 
145 aa  83.6  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.640796  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1891  histidine triad (HIT) protein  38.26 
 
 
137 aa  83.2  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1591  histidine triad (HIT) protein  36.23 
 
 
129 aa  82  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0952  histidine triad (HIT) protein  41.9 
 
 
143 aa  82  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000117681  hitchhiker  0.00115812 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0492  HIT family protein  36.36 
 
 
138 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4028  histidine triad (HIT) protein  40.37 
 
 
143 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3954  histidine triad (HIT) protein  40.37 
 
 
143 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4754  hypothetical protein  40.71 
 
 
141 aa  82.4  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.419636  normal  0.737034 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0238  HIT family protein  36.36 
 
 
138 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1687  HIT family protein  41.07 
 
 
129 aa  81.6  0.000000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.833443 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2559  HIT family protein  36.36 
 
 
138 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.609142  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0207  HIT family protein  36.36 
 
 
138 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1382  HIT family protein  36.36 
 
 
138 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2703  HIT family protein  36.36 
 
 
138 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0979  HIT family protein  36.36 
 
 
138 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.721312  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1579  HIT family protein  36.36 
 
 
139 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.380866  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1342  histidine triad (HIT) protein  39.09 
 
 
130 aa  81.6  0.000000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1241  histidine triad (HIT) protein  38.81 
 
 
131 aa  81.3  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0519  histidine triad nucleotide-binding protein 2 (hint-2)(hint-3)  42.16 
 
 
117 aa  81.3  0.000000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>