More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3954 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3954  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 
143 aa  290  6e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4028  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 
143 aa  290  6e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3968  histidine triad (HIT) protein  99.3 
 
 
143 aa  288  2e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.777319  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2239  histidine triad (HIT) protein  80.28 
 
 
145 aa  237  4e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.640796  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4456  histidine triad (HIT) protein  76.76 
 
 
145 aa  237  5e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11288  HIT family protein  70.9 
 
 
144 aa  200  4e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.750453  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1993  histidine triad (HIT) protein  58.68 
 
 
140 aa  147  6e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6201  histidine triad (HIT) protein  42.65 
 
 
141 aa  118  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.488321  normal  0.398749 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0327  histidine triad (HIT) protein  41.79 
 
 
144 aa  117  4.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0007671  normal  0.0222978 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1664  histidine triad (HIT) protein  45.8 
 
 
145 aa  114  5e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.147901  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0711  histidine triad (HIT) protein  47.06 
 
 
142 aa  112  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0363676  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1805  histidine triad (HIT) protein  41.73 
 
 
141 aa  110  9e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.496797 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1614  histidine triad (HIT) protein  49.54 
 
 
139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0531  histidine triad (HIT) protein  46.02 
 
 
137 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.406416  normal  0.0183035 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6595  histidine triad (HIT) protein  40.29 
 
 
148 aa  107  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1740  histidine triad protein  41.8 
 
 
139 aa  106  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0781  histidine triad (HIT) protein  47.27 
 
 
135 aa  102  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0075  histidine triad (HIT) protein  46.85 
 
 
138 aa  100  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  0.167835 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0006  histidine triad (HIT) protein  45.95 
 
 
142 aa  100  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0070148  unclonable  0.000000000279381 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3642  histidine triad (HIT) protein  44 
 
 
145 aa  100  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0807517  normal  0.0488836 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3726  histidine triad (HIT) protein  39.64 
 
 
138 aa  99.8  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1531  histidine triad (HIT) protein  37.78 
 
 
136 aa  99  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4085  putative HIT family protein  42.2 
 
 
153 aa  99  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47340  putative HIT family protein  42.2 
 
 
153 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1891  histidine triad (HIT) protein  43.9 
 
 
137 aa  98.2  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0004  histidine triad (HIT) protein  40.6 
 
 
149 aa  98.2  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0275782 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1783  histidine triad (HIT) protein  39.84 
 
 
148 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.344857  normal  0.911997 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1284  histidine triad (HIT) protein  42.66 
 
 
142 aa  97.8  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3349  histidine triad (HIT) protein  45.87 
 
 
148 aa  96.7  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425203 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3451  histidine triad (HIT) protein  41.96 
 
 
149 aa  95.5  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.923698  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2145  histidine triad (HIT) protein  37.41 
 
 
146 aa  95.5  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538577  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2237  histidine triad (HIT) protein  36.57 
 
 
138 aa  94.7  4e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1263  histidine triad (HIT) protein  37.14 
 
 
144 aa  94.4  5e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000437908  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0579  histidine triad domain-containing protein  32.81 
 
 
140 aa  94.4  5e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0235717  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2280  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  42.31 
 
 
132 aa  94.4  5e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1376  histidine triad (HIT) protein  40.19 
 
 
151 aa  94  7e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.341423  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1461  histidine triad (HIT) protein  45.63 
 
 
143 aa  93.6  8e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0862  histidine triad (HIT) protein  41.01 
 
 
140 aa  93.6  9e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.379989  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0644  histidine triad (HIT) protein  43.27 
 
 
140 aa  93.2  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2848  histidine triad (HIT) protein  38.13 
 
 
136 aa  92.8  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4827  histidine triad (HIT) protein  42.61 
 
 
143 aa  93.2  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.487703  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00190  hydrolase, putative  30 
 
 
140 aa  92.4  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1573  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  40.74 
 
 
139 aa  92  2e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1373  HIT family protein  32.12 
 
 
141 aa  91.3  4e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00295303  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0370  HIT family protein  36.11 
 
 
139 aa  91.3  4e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2024  histidine triad (HIT) protein  40.74 
 
 
140 aa  91.7  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1342  histidine triad (HIT) protein  39.25 
 
 
130 aa  91.3  4e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1444  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  38.32 
 
 
144 aa  91.3  4e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000339612  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1342  histidine triad (HIT) protein  38.32 
 
 
130 aa  90.9  5e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1333  histidine triad (HIT) protein  38.32 
 
 
130 aa  90.5  6e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0568524  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4498  histidine triad (HIT) protein  36.64 
 
 
140 aa  89.7  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2801  histidine triad (HIT) protein  43.64 
 
 
139 aa  89  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.106273  normal  0.788809 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2451  histidine triad (HIT) protein  39.71 
 
 
142 aa  89  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.94056  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21440  putative HIT family protein  44.04 
 
 
145 aa  89  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.117632  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2539  histidine triad (HIT) protein  36.84 
 
 
139 aa  89  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03708  HIT domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G12680)  36.54 
 
 
133 aa  88.2  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.117728  normal  0.7439 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1891  histidine triad (HIT) protein  34.71 
 
 
140 aa  88.6  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.472953  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0919  histidine triad (HIT) protein  42.73 
 
 
140 aa  88.6  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.420438  normal  0.191843 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1050  histidine triad (HIT) protein  42.99 
 
 
139 aa  88.2  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.265499  normal  0.307581 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0620  histidine triad (HIT) protein  39.25 
 
 
130 aa  88.6  3e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.693859  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1925  histidine triad (HIT) protein  34.71 
 
 
140 aa  88.6  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0141  histidine triad (HIT) protein  38.03 
 
 
144 aa  88.2  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1705  HIT family protein  47.12 
 
 
112 aa  87.8  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2534  HIT family protein  43.52 
 
 
141 aa  88.2  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.91947  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3399  histidine triad (HIT) protein  37.32 
 
 
149 aa  88.2  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.163397  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2454  histidine triad (HIT) protein  38.39 
 
 
145 aa  87  7e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.832288  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3108  histidine triad (HIT) protein  38.39 
 
 
143 aa  87  8e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2281  HIT family protein  42.86 
 
 
114 aa  87  8e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2991  histidine triad (HIT) protein  42.06 
 
 
113 aa  86.7  9e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.337185  normal  0.959668 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2169  histidine triad (HIT) protein  37.31 
 
 
140 aa  86.7  9e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2890  histidine triad (HIT) protein  33.81 
 
 
139 aa  86.3  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1423  HIT family protein  43.81 
 
 
114 aa  86.7  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.465509  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1561  histidine triad (HIT) protein  39.82 
 
 
139 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0096  histidine triad (HIT) protein  42.2 
 
 
139 aa  86.7  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1155  hemolysin A  40.57 
 
 
367 aa  86.3  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0254  histidine triad (HIT) protein  40.16 
 
 
145 aa  85.9  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0075  histidine triad (HIT) protein  45.05 
 
 
143 aa  85.9  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4221  HIT family protein  38.94 
 
 
144 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.071329  normal  0.0179678 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1083  HIT family protein  38.94 
 
 
144 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1829  putative HIT family protein  42.2 
 
 
145 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0381  protein kinase C1 inhibitor  35.2 
 
 
139 aa  85.5  2e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1609  histidine triad (HIT) protein  44.12 
 
 
115 aa  85.5  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4014  histidine triad (HIT) protein  42.2 
 
 
137 aa  85.9  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1168  HIT family protein  38.89 
 
 
140 aa  85.1  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.247304  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2682  hypothetical protein  41.12 
 
 
113 aa  85.1  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1076  histidine triad (HIT) protein  43.4 
 
 
114 aa  85.1  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1125  HIT family protein  38.89 
 
 
140 aa  85.1  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.20711  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1151  HIT family protein  39.42 
 
 
165 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0966  HIT family protein  39.42 
 
 
144 aa  84.7  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl245  putative nucleotidyl hydrolase/transferase  35.19 
 
 
135 aa  84.7  4e-16  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0957  HIT family protein  39.42 
 
 
144 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1212  HIT family protein  39.42 
 
 
144 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1124  HIT family protein  39.42 
 
 
144 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2290  histidine triad (HIT) protein  40.35 
 
 
139 aa  84.7  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1996  HIT family protein  41.9 
 
 
114 aa  84.7  4e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2210  histidine triad (HIT) protein  41.75 
 
 
115 aa  84.7  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.544525  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0962  histidine triad (HIT) protein  39.42 
 
 
144 aa  84.7  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1852  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 
114 aa  84.3  5e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.279518 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42119  protein kinase C inhibitor-I, histidine triad nucleotide-binding protein-like protein  36.11 
 
 
156 aa  84  6e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.149088 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0814  histidine triad (HIT) protein  33.57 
 
 
144 aa  84.3  6e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>