More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1376 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1376  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 
145 aa  300  6.000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1771  histidine triad (HIT) protein  62.5 
 
 
143 aa  184  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123943  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1574  histidine triad (HIT) protein  61.03 
 
 
141 aa  180  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.650242  normal  0.227098 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1125  HIT family protein  59.12 
 
 
140 aa  180  7e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.20711  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1168  HIT family protein  59.12 
 
 
140 aa  179  9.000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.247304  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2024  histidine triad (HIT) protein  56.93 
 
 
140 aa  174  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2534  HIT family protein  64 
 
 
141 aa  169  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.91947  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4689  histidine triad (HIT) protein  57.66 
 
 
142 aa  167  5e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0956525  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4320  histidine triad (HIT) protein  56.93 
 
 
142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0862778  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4837  histidine triad (HIT) protein  57.66 
 
 
140 aa  164  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0161096  normal  0.332557 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0579  histidine triad domain-containing protein  54.01 
 
 
140 aa  163  8e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0235717  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2290  histidine triad (HIT) protein  60.14 
 
 
139 aa  163  8e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2926  histidine triad (HIT) protein  54.61 
 
 
149 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3753  histidine triad (HIT) protein  56.52 
 
 
145 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1120  histidine triad (HIT) protein  58.09 
 
 
139 aa  160  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636565  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0746  histidine triad (HIT) protein  53.85 
 
 
145 aa  159  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00337572 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3536  histidine triad (HIT) protein  57.35 
 
 
144 aa  154  6e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.806394 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2451  histidine triad (HIT) protein  52.21 
 
 
142 aa  147  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.94056  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0254  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 
145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3046  histidine triad (HIT) protein  50.36 
 
 
142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2405  histidine triad (HIT) protein  51.47 
 
 
142 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.112602  normal  0.457991 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2416  histidine triad (HIT) protein  50.74 
 
 
146 aa  143  7.0000000000000006e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0525465  normal  0.0378675 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1666  histidine triad (HIT) protein  55.15 
 
 
142 aa  143  7.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.225024  normal  0.108561 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3549  histidine triad (HIT) protein  52.34 
 
 
142 aa  142  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276085  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2807  histidine triad (HIT) protein  51.47 
 
 
145 aa  140  4e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4665  histidine triad (HIT) protein  53.62 
 
 
146 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0394805  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3139  histidine triad (HIT) protein  49.28 
 
 
143 aa  137  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0448341 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2801  histidine triad (HIT) protein  48.92 
 
 
139 aa  137  6e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.106273  normal  0.788809 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3316  histidine triad (HIT) protein  48.55 
 
 
142 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.33287  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1829  putative HIT family protein  46.04 
 
 
145 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4754  hypothetical protein  51.45 
 
 
141 aa  135  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.419636  normal  0.737034 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1292  histidine triad (HIT) protein  48.48 
 
 
145 aa  135  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.268815  normal  0.885199 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21440  putative HIT family protein  44.29 
 
 
145 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.117632  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3136  histidine triad (HIT) protein  52.21 
 
 
145 aa  131  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.186474  normal  0.519956 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1532  histidine triad (HIT) protein  53.04 
 
 
145 aa  127  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.77898  normal  0.453293 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4476  putative histidine triad (HIT) protein  47.14 
 
 
141 aa  127  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000626279 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4702  histidine triad (HIT) protein  48.2 
 
 
144 aa  127  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557305 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3968  histidine triad (HIT) protein  45.71 
 
 
141 aa  124  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0494  putative HIT-like protein  46.76 
 
 
144 aa  120  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3327  histidine triad (HIT) protein  46.67 
 
 
139 aa  120  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.036152 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0211  histidine triad (HIT) protein  44.12 
 
 
145 aa  120  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0206  histidine triad (HIT) protein  47.41 
 
 
143 aa  117  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.577034 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5333  histidine triad (HIT) protein  47.06 
 
 
139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4791  histidine triad (HIT) protein  47.06 
 
 
139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5415  histidine triad (HIT) protein  46.67 
 
 
139 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.269942  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4823  histidine triad (HIT) protein  46.67 
 
 
139 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.784878 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5446  histidine triad (HIT) protein  46.67 
 
 
139 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.311796 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1076  histidine triad (HIT) protein  47.66 
 
 
146 aa  114  5e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.179252 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2145  histidine triad (HIT) protein  42.42 
 
 
146 aa  111  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538577  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0006  histidine triad (HIT) protein  44.53 
 
 
142 aa  111  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0070148  unclonable  0.000000000279381 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0952  histidine triad (HIT) protein  47.62 
 
 
143 aa  110  6e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000117681  hitchhiker  0.00115812 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1302  histidine triad (HIT) protein  46.23 
 
 
146 aa  110  8.000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3878  histidine triad (HIT) protein  45.19 
 
 
142 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000287053  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0788  histidine triad (HIT) protein  43.88 
 
 
455 aa  107  8.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.864692  normal  0.369294 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0075  histidine triad (HIT) protein  44.7 
 
 
138 aa  106  9.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  0.167835 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4014  histidine triad (HIT) protein  45.63 
 
 
137 aa  106  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0781  histidine triad (HIT) protein  48.54 
 
 
135 aa  104  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0370  HIT family protein  39.1 
 
 
139 aa  102  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3451  histidine triad (HIT) protein  41.3 
 
 
149 aa  103  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.923698  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0207  HIT family protein  40.58 
 
 
138 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1376  histidine triad (HIT) protein  38.35 
 
 
151 aa  102  2e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.341423  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0979  HIT family protein  40.58 
 
 
138 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.721312  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1579  HIT family protein  40.58 
 
 
139 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.380866  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0492  HIT family protein  40.58 
 
 
138 aa  102  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2559  HIT family protein  40.58 
 
 
138 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.609142  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0238  HIT family protein  40.58 
 
 
138 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2703  HIT family protein  40.58 
 
 
138 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1382  HIT family protein  40.58 
 
 
138 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3108  histidine triad (HIT) protein  41.98 
 
 
143 aa  99.4  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2454  histidine triad (HIT) protein  41.98 
 
 
145 aa  99  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.832288  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1740  histidine triad protein  39.71 
 
 
139 aa  98.2  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2539  histidine triad (HIT) protein  41.04 
 
 
139 aa  97.4  5e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1561  histidine triad (HIT) protein  38.13 
 
 
139 aa  97.1  6e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1573  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  42.72 
 
 
139 aa  96.3  1e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0004  histidine triad (HIT) protein  44.44 
 
 
149 aa  94.4  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0275782 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1373  HIT family protein  41.58 
 
 
141 aa  94  7e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00295303  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1891  histidine triad (HIT) protein  37.9 
 
 
140 aa  93.2  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.472953  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1925  histidine triad (HIT) protein  37.9 
 
 
140 aa  93.2  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1891  histidine triad (HIT) protein  39.26 
 
 
137 aa  92.8  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2280  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  42.16 
 
 
132 aa  92.4  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1531  histidine triad (HIT) protein  35.82 
 
 
136 aa  90.5  6e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0644  histidine triad (HIT) protein  39.81 
 
 
140 aa  90.1  9e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1805  histidine triad (HIT) protein  42.11 
 
 
141 aa  89.7  1e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.496797 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1461  histidine triad (HIT) protein  40.91 
 
 
143 aa  89.4  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf126  HINT (histidine triad nucleotide-binding protein) family member  39.81 
 
 
107 aa  88.2  4e-17  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1749  histidine triad (HIT) protein  40.74 
 
 
139 aa  87.8  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3726  histidine triad (HIT) protein  38.46 
 
 
138 aa  87.8  5e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4827  histidine triad (HIT) protein  41.9 
 
 
143 aa  87  7e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.487703  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0096  histidine triad (HIT) protein  40.74 
 
 
139 aa  87  7e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0966  HIT family protein  37.96 
 
 
144 aa  87  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0957  HIT family protein  37.96 
 
 
144 aa  87  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4221  HIT family protein  37.96 
 
 
144 aa  87  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.071329  normal  0.0179678 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1212  HIT family protein  37.96 
 
 
144 aa  87  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1083  HIT family protein  37.96 
 
 
144 aa  87  8e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11288  HIT family protein  39.32 
 
 
144 aa  87  8e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.750453  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3533  histidine triad (HIT) protein  41.88 
 
 
116 aa  87  8e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1124  HIT family protein  37.96 
 
 
144 aa  87  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1151  HIT family protein  37.96 
 
 
165 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2239  histidine triad (HIT) protein  38.64 
 
 
145 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.640796  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0531  histidine triad (HIT) protein  42.99 
 
 
137 aa  86.7  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.406416  normal  0.0183035 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>