More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2145 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_2145  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 
146 aa  299  8.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538577  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0004  histidine triad (HIT) protein  73.79 
 
 
149 aa  235  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0275782 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2454  histidine triad (HIT) protein  74.48 
 
 
145 aa  228  3e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.832288  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3108  histidine triad (HIT) protein  74.13 
 
 
143 aa  223  7e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3451  histidine triad (HIT) protein  53.15 
 
 
149 aa  154  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.923698  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1151  HIT family protein  42.34 
 
 
165 aa  130  6e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0966  HIT family protein  42.34 
 
 
144 aa  130  6e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0957  HIT family protein  42.34 
 
 
144 aa  130  6e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1124  HIT family protein  42.34 
 
 
144 aa  130  6e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1212  HIT family protein  42.34 
 
 
144 aa  130  6e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4221  HIT family protein  42.34 
 
 
144 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.071329  normal  0.0179678 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1083  HIT family protein  42.34 
 
 
144 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0644  histidine triad (HIT) protein  42.03 
 
 
140 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0814  histidine triad (HIT) protein  40.88 
 
 
144 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0978  HIT family protein  41.61 
 
 
144 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1047  HIT family protein  41.61 
 
 
144 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0962  histidine triad (HIT) protein  41.61 
 
 
144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0075  histidine triad (HIT) protein  45.86 
 
 
138 aa  124  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  0.167835 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2290  histidine triad (HIT) protein  46.43 
 
 
139 aa  123  8.000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1461  histidine triad (HIT) protein  42.65 
 
 
143 aa  123  9e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0370  HIT family protein  38.52 
 
 
139 aa  120  7e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0006  histidine triad (HIT) protein  45.86 
 
 
142 aa  120  8e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0070148  unclonable  0.000000000279381 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4837  histidine triad (HIT) protein  49.63 
 
 
140 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0161096  normal  0.332557 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0254  histidine triad (HIT) protein  49.24 
 
 
145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1573  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  37.78 
 
 
139 aa  118  1.9999999999999998e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3726  histidine triad (HIT) protein  42.98 
 
 
138 aa  117  3.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4689  histidine triad (HIT) protein  49.63 
 
 
142 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0956525  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3753  histidine triad (HIT) protein  47.41 
 
 
145 aa  117  6e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0781  histidine triad (HIT) protein  47.58 
 
 
135 aa  117  7e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4320  histidine triad (HIT) protein  49.63 
 
 
142 aa  116  9e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0862778  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2539  histidine triad (HIT) protein  41.79 
 
 
139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4702  histidine triad (HIT) protein  45 
 
 
144 aa  115  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557305 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1574  histidine triad (HIT) protein  42.86 
 
 
141 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.650242  normal  0.227098 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1771  histidine triad (HIT) protein  43.36 
 
 
143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123943  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3139  histidine triad (HIT) protein  42.86 
 
 
143 aa  111  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0448341 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4014  histidine triad (HIT) protein  43.41 
 
 
137 aa  111  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1561  histidine triad (HIT) protein  40.3 
 
 
139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1891  histidine triad (HIT) protein  46.49 
 
 
137 aa  109  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2848  histidine triad (HIT) protein  40.87 
 
 
136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0579  histidine triad domain-containing protein  39.26 
 
 
140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0235717  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1376  histidine triad (HIT) protein  41.86 
 
 
145 aa  107  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3878  histidine triad (HIT) protein  44.44 
 
 
142 aa  107  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000287053  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1740  histidine triad protein  37.68 
 
 
139 aa  107  7.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1076  histidine triad (HIT) protein  46.73 
 
 
146 aa  105  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.179252 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2801  histidine triad (HIT) protein  40.91 
 
 
139 aa  106  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.106273  normal  0.788809 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0494  putative HIT-like protein  50.91 
 
 
144 aa  105  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2451  histidine triad (HIT) protein  40.85 
 
 
142 aa  105  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.94056  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2024  histidine triad (HIT) protein  40.15 
 
 
140 aa  105  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4827  histidine triad (HIT) protein  43.48 
 
 
143 aa  105  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.487703  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03708  HIT domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G12680)  35.82 
 
 
133 aa  105  3e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.117728  normal  0.7439 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2926  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 
149 aa  105  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2405  histidine triad (HIT) protein  41.18 
 
 
142 aa  104  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.112602  normal  0.457991 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2280  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  40.74 
 
 
132 aa  104  3e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1302  histidine triad (HIT) protein  46.73 
 
 
146 aa  104  4e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1292  histidine triad (HIT) protein  44.19 
 
 
145 aa  104  4e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.268815  normal  0.885199 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1373  HIT family protein  35.83 
 
 
141 aa  104  5e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00295303  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1925  histidine triad (HIT) protein  37.5 
 
 
140 aa  103  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3327  histidine triad (HIT) protein  44.7 
 
 
139 aa  103  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.036152 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0952  histidine triad (HIT) protein  49 
 
 
143 aa  104  5e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000117681  hitchhiker  0.00115812 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1891  histidine triad (HIT) protein  37.5 
 
 
140 aa  103  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.472953  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1499  histidine triad (HIT) protein  36.88 
 
 
301 aa  103  6e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.348624  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2237  histidine triad (HIT) protein  42.96 
 
 
138 aa  103  7e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1168  HIT family protein  39.1 
 
 
140 aa  103  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.247304  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3642  histidine triad (HIT) protein  39.1 
 
 
145 aa  103  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0807517  normal  0.0488836 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1125  HIT family protein  38.35 
 
 
140 aa  102  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.20711  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1376  histidine triad (HIT) protein  41.51 
 
 
151 aa  102  2e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.341423  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0211  histidine triad (HIT) protein  45.86 
 
 
145 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2534  HIT family protein  46.15 
 
 
141 aa  101  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.91947  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0327  histidine triad (HIT) protein  39.29 
 
 
144 aa  101  4e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0007671  normal  0.0222978 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1531  histidine triad (HIT) protein  36.84 
 
 
136 aa  100  6e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3549  histidine triad (HIT) protein  41.88 
 
 
142 aa  100  8e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276085  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0746  histidine triad (HIT) protein  44.95 
 
 
145 aa  98.6  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00337572 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2416  histidine triad (HIT) protein  39.31 
 
 
146 aa  99  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0525465  normal  0.0378675 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2807  histidine triad (HIT) protein  42.54 
 
 
145 aa  99  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4498  histidine triad (HIT) protein  38.94 
 
 
140 aa  98.2  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1228  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  40.37 
 
 
140 aa  97.8  4e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0892724  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0381  protein kinase C1 inhibitor  36.75 
 
 
139 aa  97.8  5e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1444  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  35.21 
 
 
144 aa  97.4  6e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000339612  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3968  histidine triad (HIT) protein  41.13 
 
 
141 aa  96.7  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3316  histidine triad (HIT) protein  41.79 
 
 
142 aa  96.7  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.33287  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1423  HIT family protein  42.74 
 
 
114 aa  96.3  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.465509  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21440  putative HIT family protein  38.97 
 
 
145 aa  95.9  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.117632  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3046  histidine triad (HIT) protein  41.04 
 
 
142 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3954  histidine triad (HIT) protein  37.41 
 
 
143 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4028  histidine triad (HIT) protein  37.41 
 
 
143 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3968  histidine triad (HIT) protein  37.41 
 
 
143 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.777319  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1829  putative HIT family protein  40.71 
 
 
145 aa  94.4  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1120  histidine triad (HIT) protein  42.42 
 
 
139 aa  94.7  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636565  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2542  histidine triad (HIT) protein  41.03 
 
 
174 aa  94  5e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6201  histidine triad (HIT) protein  41.67 
 
 
141 aa  94  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.488321  normal  0.398749 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1263  histidine triad (HIT) protein  40.37 
 
 
144 aa  93.6  9e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000437908  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00190  hydrolase, putative  37.59 
 
 
140 aa  92.8  1e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1155  hemolysin A  41.03 
 
 
367 aa  93.2  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3536  histidine triad (HIT) protein  41.35 
 
 
144 aa  92.4  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.806394 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1993  histidine triad (HIT) protein  39.81 
 
 
140 aa  92  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4754  hypothetical protein  40.46 
 
 
141 aa  91.7  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.419636  normal  0.737034 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3136  histidine triad (HIT) protein  41.79 
 
 
145 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.186474  normal  0.519956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6333  histidine triad (HIT) protein  41.01 
 
 
142 aa  91.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303729  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0141  histidine triad (HIT) protein  35.29 
 
 
144 aa  91.3  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11288  HIT family protein  37.9 
 
 
144 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.750453  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>