More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1373 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1373  HIT family protein  100 
 
 		 141 aa  290  6e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00295303  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1891  histidine triad (HIT) protein  86.82 
 
 		 140 aa  243  6e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.472953  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1925  histidine triad (HIT) protein  86.82 
 
 		 140 aa  243  6e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0644  histidine triad (HIT) protein  53.28 
 
 		 140 aa  150  5e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1461  histidine triad (HIT) protein  50.35 
 
 		 143 aa  149  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0814  histidine triad (HIT) protein  53.28 
 
 		 144 aa  149  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1151  HIT family protein  51.09 
 
 		 165 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1212  HIT family protein  51.09 
 
 		 144 aa  143  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0966  HIT family protein  51.09 
 
 		 144 aa  143  7.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0957  HIT family protein  51.09 
 
 		 144 aa  143  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1124  HIT family protein  51.09 
 
 		 144 aa  143  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1083  HIT family protein  51.09 
 
 		 144 aa  143  9e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4221  HIT family protein  51.09 
 
 		 144 aa  143  9e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.071329  normal  0.0179678 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0962  histidine triad (HIT) protein  50.36 
 
 		 144 aa  142  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0978  HIT family protein  50.36 
 
 		 144 aa  139  9e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1047  HIT family protein  50.36 
 
 		 144 aa  139  9e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0370  HIT family protein  50.71 
 
 		 139 aa  135  2e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1573  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  50.41 
 
 		 139 aa  127  4.0000000000000003e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2280  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  50.41 
 
 		 132 aa  126  1.0000000000000001e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4498  histidine triad (HIT) protein  48.31 
 
 		 140 aa  126  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3726  histidine triad (HIT) protein  54.7 
 
 		 138 aa  121  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1228  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  57.55 
 
 		 140 aa  120  5e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0892724  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1263  histidine triad (HIT) protein  46.76 
 
 		 144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000437908  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1125  HIT family protein  45.08 
 
 		 140 aa  118  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.20711  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1168  HIT family protein  44.26 
 
 		 140 aa  117  3.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.247304  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1275  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  48.57 
 
 		 139 aa  115  9.999999999999999e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0579  histidine triad domain-containing protein  42.22 
 
 		 140 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0235717  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0075  histidine triad (HIT) protein  43.07 
 
 		 138 aa  114  6e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  0.167835 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0006  histidine triad (HIT) protein  41.3 
 
 		 142 aa  113  7.999999999999999e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0070148  unclonable  0.000000000279381 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0781  histidine triad (HIT) protein  45.28 
 
 		 135 aa  111  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3139  histidine triad (HIT) protein  40.71 
 
 		 143 aa  110  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0448341 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1771  histidine triad (HIT) protein  41.8 
 
 		 143 aa  110  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2454  histidine triad (HIT) protein  38.33 
 
 		 145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.832288  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2024  histidine triad (HIT) protein  45.63 
 
 		 140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2539  histidine triad (HIT) protein  46.3 
 
 		 139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3108  histidine triad (HIT) protein  38.33 
 
 		 143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1292  histidine triad (HIT) protein  37.31 
 
 		 145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.268815  normal  0.885199 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2801  histidine triad (HIT) protein  41.18 
 
 		 139 aa  108  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.106273  normal  0.788809 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0254  histidine triad (HIT) protein  46.73 
 
 		 145 aa  107  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1574  histidine triad (HIT) protein  47.12 
 
 		 141 aa  107  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.650242  normal  0.227098 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2237  histidine triad (HIT) protein  37.23 
 
 		 138 aa  107  6e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4837  histidine triad (HIT) protein  35.97 
 
 		 140 aa  106  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0161096  normal  0.332557 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1829  putative HIT family protein  37.23 
 
 		 145 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0004  histidine triad (HIT) protein  40.17 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0275782 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2926  histidine triad (HIT) protein  45.19 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0381  protein kinase C1 inhibitor  40.14 
 
 		 139 aa  105  2e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1561  histidine triad (HIT) protein  43.52 
 
 		 139 aa  104  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4689  histidine triad (HIT) protein  35.97 
 
 		 142 aa  105  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0956525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0746  histidine triad (HIT) protein  41.35 
 
 		 145 aa  104  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00337572 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1444  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  53.64 
 
 		 144 aa  105  3e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000339612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4320  histidine triad (HIT) protein  37.9 
 
 		 142 aa  105  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0862778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3549  histidine triad (HIT) protein  46.23 
 
 		 142 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276085  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3327  histidine triad (HIT) protein  39.42 
 
 		 139 aa  104  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.036152 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21440  putative HIT family protein  36.96 
 
 		 145 aa  104  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.117632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2145  histidine triad (HIT) protein  35.83 
 
 		 146 aa  104  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1532  histidine triad (HIT) protein  43.24 
 
 		 145 aa  103  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.77898  normal  0.453293 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4476  putative histidine triad (HIT) protein  38.81 
 
 		 141 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000626279 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2405  histidine triad (HIT) protein  44.34 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.112602  normal  0.457991 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2451  histidine triad (HIT) protein  42.06 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.94056  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4014  histidine triad (HIT) protein  42.86 
 
 		 137 aa  102  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00190  hydrolase, putative  38.03 
 
 		 140 aa  101  3e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3753  histidine triad (HIT) protein  34.53 
 
 		 145 aa  101  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0211  histidine triad (HIT) protein  45.71 
 
 		 145 aa  100  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2290  histidine triad (HIT) protein  41.12 
 
 		 139 aa  100  6e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03708  HIT domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G12680)  41.6 
 
 		 133 aa  100  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.117728  normal  0.7439 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4702  histidine triad (HIT) protein  39.25 
 
 		 144 aa  99.4  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00557305 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2848  histidine triad (HIT) protein  41.03 
 
 		 136 aa  100  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0472  HIT family protein  40.52 
 
 		 131 aa  99.4  2e-20  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.974422  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3968  histidine triad (HIT) protein  37.31 
 
 		 141 aa  99.4  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl245  putative nucleotidyl hydrolase/transferase  41.18 
 
 		 135 aa  97.8  4e-20  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3316  histidine triad (HIT) protein  41.51 
 
 		 142 aa  97.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.33287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2534  HIT family protein  40.57 
 
 		 141 aa  97.4  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.91947  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3642  histidine triad (HIT) protein  36.11 
 
 		 145 aa  95.5  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0807517  normal  0.0488836 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0494  putative HIT-like protein  33.83 
 
 		 144 aa  95.9  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3878  histidine triad (HIT) protein  36.03 
 
 		 142 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000287053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1740  histidine triad protein  42.11 
 
 		 139 aa  95.5  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4754  hypothetical protein  47.12 
 
 		 141 aa  94.7  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.419636  normal  0.737034 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1120  histidine triad (HIT) protein  40.8 
 
 		 139 aa  94.7  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3046  histidine triad (HIT) protein  41.35 
 
 		 142 aa  94.4  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1891  histidine triad (HIT) protein  37.96 
 
 		 137 aa  93.6  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1376  histidine triad (HIT) protein  41.58 
 
 		 145 aa  93.6  9e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1376  histidine triad (HIT) protein  41.38 
 
 		 151 aa  92.8  1e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.341423  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0207  HIT family protein  40 
 
 		 138 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0979  HIT family protein  40 
 
 		 138 aa  92  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.721312  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1579  HIT family protein  40 
 
 		 139 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.380866  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1382  HIT family protein  40 
 
 		 138 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0492  HIT family protein  40.95 
 
 		 138 aa  92.4  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2559  HIT family protein  40 
 
 		 138 aa  92  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.609142  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0238  HIT family protein  40 
 
 		 138 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2703  HIT family protein  40 
 
 		 138 aa  92  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2239  histidine triad (HIT) protein  34.38 
 
 		 145 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.640796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3954  histidine triad (HIT) protein  32.12 
 
 		 143 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4028  histidine triad (HIT) protein  32.12 
 
 		 143 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2169  histidine triad (HIT) protein  34.29 
 
 		 140 aa  90.9  5e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4456  histidine triad (HIT) protein  34.38 
 
 		 145 aa  90.5  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4823  histidine triad (HIT) protein  38.24 
 
 		 139 aa  90.5  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.784878 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5415  histidine triad (HIT) protein  38.24 
 
 		 139 aa  90.5  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.269942  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5446  histidine triad (HIT) protein  38.24 
 
 		 139 aa  90.5  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.311796 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2890  histidine triad (HIT) protein  38.89 
 
 		 139 aa  90.1  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3968  histidine triad (HIT) protein  31.62 
 
 		 143 aa  89.4  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.777319  normal  0.0628419 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>