More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1993 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1993  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 		 140 aa  275  1e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2239  histidine triad (HIT) protein  59.26 
 
 		 145 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.640796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4456  histidine triad (HIT) protein  58.52 
 
 		 145 aa  160  8.000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3954  histidine triad (HIT) protein  54.81 
 
 		 143 aa  151  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4028  histidine triad (HIT) protein  54.81 
 
 		 143 aa  151  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3968  histidine triad (HIT) protein  54.81 
 
 		 143 aa  150  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.777319  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11288  HIT family protein  56.49 
 
 		 144 aa  144  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.750453  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0711  histidine triad (HIT) protein  51.8 
 
 		 142 aa  133  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0363676  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0327  histidine triad (HIT) protein  44.44 
 
 		 144 aa  128  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0007671  normal  0.0222978 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6595  histidine triad (HIT) protein  45.19 
 
 		 148 aa  122  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6201  histidine triad (HIT) protein  46.67 
 
 		 141 aa  121  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.488321  normal  0.398749 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3349  histidine triad (HIT) protein  50.45 
 
 		 148 aa  113  7.999999999999999e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425203 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1891  histidine triad (HIT) protein  52.29 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1284  histidine triad (HIT) protein  46.85 
 
 		 142 aa  110  5e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2237  histidine triad (HIT) protein  39.13 
 
 		 138 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0644  histidine triad (HIT) protein  44.86 
 
 		 140 aa  106  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4221  HIT family protein  44.25 
 
 		 144 aa  105  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.071329  normal  0.0179678 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1083  HIT family protein  44.25 
 
 		 144 aa  105  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0814  histidine triad (HIT) protein  45.13 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1151  HIT family protein  44.34 
 
 		 165 aa  104  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0966  HIT family protein  44.34 
 
 		 144 aa  104  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0957  HIT family protein  44.34 
 
 		 144 aa  104  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1124  HIT family protein  44.34 
 
 		 144 aa  104  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1212  HIT family protein  44.34 
 
 		 144 aa  104  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0962  histidine triad (HIT) protein  45.28 
 
 		 144 aa  103  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2280  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  40.8 
 
 		 132 aa  103  6e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0370  HIT family protein  40.74 
 
 		 139 aa  102  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1740  histidine triad protein  40.37 
 
 		 139 aa  103  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1461  histidine triad (HIT) protein  42.65 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1263  histidine triad (HIT) protein  41.28 
 
 		 144 aa  101  3e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000437908  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0381  protein kinase C1 inhibitor  40.68 
 
 		 139 aa  101  3e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0978  HIT family protein  43.4 
 
 		 144 aa  100  7e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1047  HIT family protein  43.4 
 
 		 144 aa  100  7e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3399  histidine triad (HIT) protein  42.86 
 
 		 149 aa  99  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.163397  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1573  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  38.46 
 
 		 139 aa  98.6  2e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1531  histidine triad (HIT) protein  37.4 
 
 		 136 aa  98.2  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1561  histidine triad (HIT) protein  40.44 
 
 		 139 aa  98.2  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2539  histidine triad (HIT) protein  41.44 
 
 		 139 aa  97.4  6e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1783  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 		 148 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.344857  normal  0.911997 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2926  histidine triad (HIT) protein  38.46 
 
 		 149 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1376  histidine triad (HIT) protein  40.37 
 
 		 151 aa  96.7  9e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.341423  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2890  histidine triad (HIT) protein  35.29 
 
 		 139 aa  96.3  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3726  histidine triad (HIT) protein  38.53 
 
 		 138 aa  95.9  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0781  histidine triad (HIT) protein  45.87 
 
 		 135 aa  95.9  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2848  histidine triad (HIT) protein  45.45 
 
 		 136 aa  95.9  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3642  histidine triad (HIT) protein  40.74 
 
 		 145 aa  95.9  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0807517  normal  0.0488836 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0141  histidine triad (HIT) protein  39.06 
 
 		 144 aa  93.6  7e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1009  histidine triad (HIT) protein  40.85 
 
 		 139 aa  93.2  1e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2534  HIT family protein  44.04 
 
 		 141 aa  92  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.91947  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2145  histidine triad (HIT) protein  39.81 
 
 		 146 aa  92.4  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538577  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0075  histidine triad (HIT) protein  46.73 
 
 		 143 aa  92  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1664  histidine triad (HIT) protein  42.99 
 
 		 145 aa  92.4  2e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.147901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4085  putative HIT family protein  44.86 
 
 		 153 aa  92  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47340  putative HIT family protein  44.86 
 
 		 153 aa  92  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0004  histidine triad (HIT) protein  39.66 
 
 		 149 aa  91.7  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0275782 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2169  histidine triad (HIT) protein  37.7 
 
 		 140 aa  91.3  4e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1373  HIT family protein  32.37 
 
 		 141 aa  90.9  5e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00295303  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0006  histidine triad (HIT) protein  40.91 
 
 		 142 aa  90.9  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0070148  unclonable  0.000000000279381 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1228  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  37.19 
 
 		 140 aa  90.5  6e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0892724  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1342  histidine triad (HIT) protein  35.51 
 
 		 130 aa  90.1  8e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0075  histidine triad (HIT) protein  41.67 
 
 		 138 aa  90.1  9e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  0.167835 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4827  histidine triad (HIT) protein  44.34 
 
 		 143 aa  89.7  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.487703  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1050  histidine triad (HIT) protein  34.31 
 
 		 139 aa  90.1  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.265499  normal  0.307581 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1805  histidine triad (HIT) protein  42.2 
 
 		 141 aa  88.6  2e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.496797 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1342  histidine triad (HIT) protein  38.32 
 
 		 130 aa  89  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1333  histidine triad (HIT) protein  37.38 
 
 		 130 aa  88.2  3e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0568524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0620  histidine triad (HIT) protein  38.32 
 
 		 130 aa  88.6  3e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.693859  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1444  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  34.23 
 
 		 144 aa  88.2  3e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000339612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3451  histidine triad (HIT) protein  36.57 
 
 		 149 aa  87.8  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.923698  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1925  histidine triad (HIT) protein  34.65 
 
 		 140 aa  87.8  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4837  histidine triad (HIT) protein  39.82 
 
 		 140 aa  87.4  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0161096  normal  0.332557 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1891  histidine triad (HIT) protein  34.65 
 
 		 140 aa  87.8  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.472953  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0862  histidine triad (HIT) protein  40.85 
 
 		 140 aa  87.4  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.379989  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4689  histidine triad (HIT) protein  38.94 
 
 		 142 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0956525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6333  histidine triad (HIT) protein  38.52 
 
 		 142 aa  87.4  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303729  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4320  histidine triad (HIT) protein  38.94 
 
 		 142 aa  87  7e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0862778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2542  histidine triad (HIT) protein  39.26 
 
 		 174 aa  87  8e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1614  histidine triad (HIT) protein  38.71 
 
 		 139 aa  86.3  1e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2024  histidine triad (HIT) protein  37.5 
 
 		 140 aa  86.7  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1771  histidine triad (HIT) protein  38.97 
 
 		 143 aa  86.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2454  histidine triad (HIT) protein  36.69 
 
 		 145 aa  86.3  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.832288  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1376  histidine triad (HIT) protein  38.98 
 
 		 145 aa  86.3  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3108  histidine triad (HIT) protein  36.69 
 
 		 143 aa  86.3  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0579  histidine triad domain-containing protein  35.59 
 
 		 140 aa  85.9  2e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0235717  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0919  histidine triad (HIT) protein  39.44 
 
 		 140 aa  85.1  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.420438  normal  0.191843 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1574  histidine triad (HIT) protein  40.18 
 
 		 141 aa  84.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.650242  normal  0.227098 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1125  HIT family protein  38.89 
 
 		 140 aa  85.1  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.20711  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1168  HIT family protein  38.89 
 
 		 140 aa  84.7  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.247304  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl245  putative nucleotidyl hydrolase/transferase  32.43 
 
 		 135 aa  84.7  4e-16  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0746  histidine triad (HIT) protein  41.9 
 
 		 145 aa  84.3  5e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00337572 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0096  histidine triad (HIT) protein  37.04 
 
 		 139 aa  84  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2801  histidine triad (HIT) protein  37.17 
 
 		 139 aa  83.6  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.106273  normal  0.788809 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00190  hydrolase, putative  33.07 
 
 		 140 aa  83.2  0.000000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3101  histidine triad (HIT) protein  38.53 
 
 		 118 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2135  histidine triad (HIT) protein  36.43 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.605825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0726  histidine triad (HIT) protein  38.1 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4498  histidine triad (HIT) protein  37.5 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0531  histidine triad (HIT) protein  40.35 
 
 		 137 aa  82  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.406416  normal  0.0183035 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1749  histidine triad (HIT) protein  36.11 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0197  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 		 114 aa  82  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.54784  normal  0.0954658 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>