More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1783 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1783  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 		 148 aa  293  7e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.344857  normal  0.911997 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47340  putative HIT family protein  70.07 
 
 		 153 aa  202  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4085  putative HIT family protein  68.71 
 
 		 153 aa  196  9e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1065  histidine triad (HIT) protein  39.73 
 
 		 172 aa  108  3e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4456  histidine triad (HIT) protein  40.65 
 
 		 145 aa  104  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2239  histidine triad (HIT) protein  41.46 
 
 		 145 aa  103  8e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.640796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3954  histidine triad (HIT) protein  39.84 
 
 		 143 aa  98.2  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4028  histidine triad (HIT) protein  39.84 
 
 		 143 aa  98.2  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3968  histidine triad (HIT) protein  39.84 
 
 		 143 aa  97.8  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.777319  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1993  histidine triad (HIT) protein  42.86 
 
 		 140 aa  95.9  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1740  histidine triad protein  36.75 
 
 		 139 aa  95.1  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0531  histidine triad (HIT) protein  42.73 
 
 		 137 aa  94.4  5e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.406416  normal  0.0183035 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1664  histidine triad (HIT) protein  39.09 
 
 		 145 aa  94  7e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.147901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1614  histidine triad (HIT) protein  41.82 
 
 		 139 aa  92.8  1e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1805  histidine triad (HIT) protein  36.3 
 
 		 141 aa  90.5  7e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.496797 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0711  histidine triad (HIT) protein  43.22 
 
 		 142 aa  90.1  9e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0363676  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2145  histidine triad (HIT) protein  37.06 
 
 		 146 aa  85.9  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3726  histidine triad (HIT) protein  36.75 
 
 		 138 aa  85.5  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0781  histidine triad (HIT) protein  41.38 
 
 		 135 aa  85.9  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3101  histidine triad (HIT) protein  39.82 
 
 		 118 aa  85.1  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3349  histidine triad (HIT) protein  43.93 
 
 		 148 aa  85.5  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425203 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1461  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 		 143 aa  84.3  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1531  histidine triad (HIT) protein  36.7 
 
 		 136 aa  84.7  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3533  histidine triad (HIT) protein  42.45 
 
 		 121 aa  83.6  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.346774  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11288  HIT family protein  40.37 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.750453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1342  histidine triad (HIT) protein  34.78 
 
 		 130 aa  82.4  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0644  histidine triad (HIT) protein  35.65 
 
 		 140 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1609  histidine triad (HIT) protein  42.86 
 
 		 115 aa  81.3  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1423  histidine triad (HIT) protein  35.24 
 
 		 111 aa  81.3  0.000000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0629  histidine triad (HIT) protein  39.09 
 
 		 112 aa  81.3  0.000000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.17683  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3238  histidine triad (HIT) protein  38.39 
 
 		 118 aa  80.9  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0432  histidine triad (HIT) protein  42.16 
 
 		 113 aa  80.9  0.000000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0312734  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0312  histidine triad (HIT) protein  34.21 
 
 		 110 aa  80.5  0.000000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0762523  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0919  histidine triad (HIT) protein  34.97 
 
 		 140 aa  80.5  0.000000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.420438  normal  0.191843 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0787  histidine triad (HIT) protein  42.31 
 
 		 113 aa  80.1  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.614928  normal  0.190225 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1151  HIT family protein  38.46 
 
 		 165 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0966  HIT family protein  36.21 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0957  HIT family protein  36.21 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0381  protein kinase C1 inhibitor  35.19 
 
 		 139 aa  79.7  0.00000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3376  histidine triad (HIT) protein  40.38 
 
 		 116 aa  79.7  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1212  HIT family protein  36.21 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1333  histidine triad (HIT) protein  34.78 
 
 		 130 aa  79.7  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0568524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0075  histidine triad (HIT) protein  38.74 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2454  histidine triad (HIT) protein  37.17 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.832288  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2539  histidine triad (HIT) protein  37.17 
 
 		 139 aa  79.3  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1342  histidine triad (HIT) protein  34.78 
 
 		 130 aa  79.3  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1124  HIT family protein  36.21 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0327  histidine triad (HIT) protein  39.25 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0007671  normal  0.0222978 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1284  histidine triad (HIT) protein  40.35 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3108  histidine triad (HIT) protein  37.17 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6201  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 141 aa  79  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.488321  normal  0.398749 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0840  hypothetical protein  41.9 
 
 		 116 aa  79  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4221  HIT family protein  38.46 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.071329  normal  0.0179678 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0338  histidine triad (HIT) protein  41.51 
 
 		 121 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.288049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3642  histidine triad (HIT) protein  36.84 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0807517  normal  0.0488836 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1083  HIT family protein  38.46 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0362  histidine triad (HIT) protein  40.57 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.481847 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3451  histidine triad (HIT) protein  35.26 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.923698  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6595  histidine triad (HIT) protein  34.25 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0353  histidine triad (HIT) protein  40.57 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2848  histidine triad (HIT) protein  37.39 
 
 		 136 aa  78.6  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0455  HIT domain-containing protein  39.22 
 
 		 113 aa  78.2  0.00000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.378719  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0004  histidine triad (HIT) protein  35.4 
 
 		 149 aa  78.2  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0275782 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0962  histidine triad (HIT) protein  36.21 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3159  histidine triad (HIT) protein  37.62 
 
 		 117 aa  78.2  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000807551 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0814  histidine triad (HIT) protein  39.25 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0705  histidine triad (HIT) protein  36.7 
 
 		 119 aa  77.8  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.141106  normal  0.441968 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0414  histidine triad (HIT) protein  40.57 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00547483 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2672  histidine triad (HIT) protein  40.57 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.429078  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0435  histidine triad (HIT) protein  40.57 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46824  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2448  histidine triad (HIT) protein  38.53 
 
 		 112 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1561  histidine triad (HIT) protein  37.38 
 
 		 139 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_397  HIT domain protein  38.24 
 
 		 113 aa  77.4  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.647527  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1228  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  31.16 
 
 		 140 aa  77  0.00000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0892724  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0862  histidine triad (HIT) protein  33.79 
 
 		 140 aa  77  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.379989  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1376  histidine triad (HIT) protein  34.91 
 
 		 151 aa  77  0.00000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.341423  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46060  histidine triad (HIT) family protein  38.39 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1798  HIT family protein  38.68 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2704  HIT family protein  38.68 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00190  hydrolase, putative  35.58 
 
 		 140 aa  76.3  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3683  MttA/Hcf106 family protein  38.68 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3550  histidine triad (HIT) protein  39.62 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0614045  hitchhiker  0.000408347 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3714  HIT family protein  38.68 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0180  histidine triad (HIT) protein  39.09 
 
 		 114 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3249  HIT family protein  38.68 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2135  histidine triad (HIT) protein  34.48 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.605825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2749  histidine triad (HIT) protein  38.18 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2755  HIT family protein  38.68 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3656  HIT family protein  38.68 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0006  histidine triad (HIT) protein  34.01 
 
 		 142 aa  76.6  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0070148  unclonable  0.000000000279381 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1263  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000437908  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0978  HIT family protein  35.34 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1047  HIT family protein  35.34 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2983  HIT family protein  38.6 
 
 		 121 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0408  putative histidine triad (HIT) protein, HitA  38.68 
 
 		 121 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0229  histidine triad (HIT) protein  37.61 
 
 		 114 aa  75.9  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.280449  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0620  histidine triad (HIT) protein  32.17 
 
 		 130 aa  75.5  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.693859  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2237  histidine triad (HIT) protein  29.37 
 
 		 138 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2280  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  35.92 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5553  histidine triad (HIT) protein  37.14 
 
 		 120 aa  75.5  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.555493  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>