More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1065 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1065  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 		 172 aa  353  5.999999999999999e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1783  histidine triad (HIT) protein  39.73 
 
 		 148 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.344857  normal  0.911997 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47340  putative HIT family protein  35.82 
 
 		 153 aa  88.2  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4085  putative HIT family protein  34.81 
 
 		 153 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1461  histidine triad (HIT) protein  33.79 
 
 		 143 aa  79  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0644  histidine triad (HIT) protein  35.65 
 
 		 140 aa  78.6  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1993  histidine triad (HIT) protein  36.67 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3726  histidine triad (HIT) protein  31.97 
 
 		 138 aa  75.5  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3954  histidine triad (HIT) protein  31.09 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4028  histidine triad (HIT) protein  31.09 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3968  histidine triad (HIT) protein  31.09 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.777319  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2239  histidine triad (HIT) protein  28.86 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.640796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1531  histidine triad (HIT) protein  27.86 
 
 		 136 aa  73.9  0.0000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1740  histidine triad protein  31.82 
 
 		 139 aa  73.6  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4456  histidine triad (HIT) protein  31.09 
 
 		 145 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1614  histidine triad (HIT) protein  33.04 
 
 		 139 aa  72.4  0.000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2237  histidine triad (HIT) protein  32.14 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1664  histidine triad (HIT) protein  31.78 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.147901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0962  histidine triad (HIT) protein  32.48 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2539  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3642  histidine triad (HIT) protein  27.86 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0807517  normal  0.0488836 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42119  protein kinase C inhibitor-I, histidine triad nucleotide-binding protein-like protein  30.61 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.149088 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00190  hydrolase, putative  35.54 
 
 		 140 aa  70.5  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1050  histidine triad (HIT) protein  31.82 
 
 		 139 aa  70.5  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.265499  normal  0.307581 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1151  HIT family protein  32.48 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1083  HIT family protein  32.48 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0966  HIT family protein  32.48 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0957  HIT family protein  32.48 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4221  HIT family protein  32.48 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.071329  normal  0.0179678 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1124  HIT family protein  32.48 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1212  HIT family protein  32.48 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0919  histidine triad (HIT) protein  33.04 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.420438  normal  0.191843 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1284  histidine triad (HIT) protein  32.76 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0531  histidine triad (HIT) protein  31.78 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.406416  normal  0.0183035 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0814  histidine triad (HIT) protein  32.48 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0381  protein kinase C1 inhibitor  32.14 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03708  HIT domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G12680)  31.3 
 
 		 133 aa  68.2  0.00000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.117728  normal  0.7439 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3108  histidine triad (HIT) protein  30.09 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2454  histidine triad (HIT) protein  30.09 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.832288  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2848  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1025  histidine triad (HIT) protein  32.41 
 
 		 135 aa  67.8  0.00000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2169  histidine triad (HIT) protein  27.12 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6595  histidine triad (HIT) protein  30.77 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1805  histidine triad (HIT) protein  30.7 
 
 		 141 aa  67  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.496797 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6333  histidine triad (HIT) protein  28.47 
 
 		 142 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303729  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3399  histidine triad (HIT) protein  28.47 
 
 		 149 aa  67.4  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.163397  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1561  histidine triad (HIT) protein  35.71 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11288  HIT family protein  27.97 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.750453  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0978  HIT family protein  31.62 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1047  HIT family protein  31.62 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0006  histidine triad (HIT) protein  31.25 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0070148  unclonable  0.000000000279381 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1333  histidine triad (HIT) protein  31.25 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0568524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0862  histidine triad (HIT) protein  28.95 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.379989  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0596  histidine triad (HIT) protein  34.95 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1342  histidine triad (HIT) protein  31.25 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0620  histidine triad (HIT) protein  32.14 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.693859  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2135  histidine triad (HIT) protein  25.34 
 
 		 148 aa  63.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.605825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0781  histidine triad (HIT) protein  30.43 
 
 		 135 aa  63.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1009  histidine triad (HIT) protein  27.42 
 
 		 139 aa  63.9  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1376  histidine triad (HIT) protein  26.57 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.341423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4498  histidine triad (HIT) protein  34.19 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1524  histidine triad (HIT) protein  32.14 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2145  histidine triad (HIT) protein  25.69 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0010  histidine triad (HIT) protein  33.91 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0387329  normal  0.117285 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0075  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1342  histidine triad (HIT) protein  29.46 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0398  histidine triad (HIT) protein  33.61 
 
 		 284 aa  62  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0075  histidine triad (HIT) protein  30.28 
 
 		 138 aa  62  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  0.167835 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1725  histidine triad (HIT) protein  35.09 
 
 		 161 aa  61.6  0.000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3451  histidine triad (HIT) protein  25.85 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.923698  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0711  histidine triad (HIT) protein  30.89 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0363676  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0472  HIT family protein  29.36 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.974422  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1749  histidine triad (HIT) protein  25.87 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1444  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  27.19 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000339612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0269  histidine triad protein HIT  27.08 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0663739  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0187  histidine triad (HIT) protein  36.61 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.414611  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2280  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  31.43 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1004  histidine triad (HIT) protein  35.19 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4660  histidine triad (HIT) protein  31.03 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.374952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3533  histidine triad (HIT) protein  33.94 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.346774  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6201  histidine triad (HIT) protein  27.27 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.488321  normal  0.398749 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1576  putative hydrolase  32.41 
 
 		 182 aa  58.2  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.031095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4014  histidine triad (HIT) protein  30.97 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0077  histidine triad (HIT) protein  36.11 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0327  histidine triad (HIT) protein  33.63 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0007671  normal  0.0222978 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0408  putative histidine triad (HIT) protein, HitA  32.11 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2713  histidine triad (HIT) protein  31.4 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.256067  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3550  histidine triad (HIT) protein  32.11 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0614045  hitchhiker  0.000408347 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0096  histidine triad (HIT) protein  27.52 
 
 		 139 aa  57  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1504  HIT (HINT, histidine triad) family protein  31.86 
 
 		 165 aa  57  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000163027  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0141  histidine triad (HIT) protein  30.4 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0746  histidine triad (HIT) protein  34.26 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00337572 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0357  histidine triad (HIT) protein  33.04 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0469904 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4872  histidine triad (HIT) protein  32.11 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1209  histidine triad (HIT) protein  36.78 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.818472  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0362  histidine triad (HIT) protein  33.03 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.481847 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2672  histidine triad (HIT) protein  33.03 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.429078  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1499  histidine triad (HIT) protein  25.41 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.348624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0414  histidine triad (HIT) protein  33.03 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00547483 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0353  histidine triad (HIT) protein  33.03 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>