286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0357 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0357  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 		 298 aa  617  1e-176  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0469904 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1434  histidine triad (HIT) protein  88.39 
 
 		 174 aa  301  1e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.186815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1973  HIT family protein  79.88 
 
 		 166 aa  287  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000182824  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1183  histidine triad (HIT) protein  73.55 
 
 		 184 aa  257  2e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.970277  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1342  histidine triad (HIT) protein  70.32 
 
 		 163 aa  242  3.9999999999999997e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.187699  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1462  histidine triad (HIT) protein  69.03 
 
 		 162 aa  238  5.999999999999999e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1658  histidine triad (HIT) protein  52.94 
 
 		 164 aa  195  9e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1387  histidine triad (HIT) protein  51.61 
 
 		 171 aa  189  5.999999999999999e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.026049  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2126  histidine triad (HIT) protein  51.61 
 
 		 166 aa  188  9e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712705 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2074  histidine triad (HIT) protein  47.74 
 
 		 165 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165381  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1638  histidine triad (HIT) protein  50.97 
 
 		 162 aa  181  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000357011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1524  histidine triad (HIT) protein  50.32 
 
 		 166 aa  174  9.999999999999999e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1504  HIT (HINT, histidine triad) family protein  49.02 
 
 		 165 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000163027  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1701  HIT family protein  45.16 
 
 		 162 aa  169  5e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.652784  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0010  histidine triad (HIT) protein  48.12 
 
 		 169 aa  169  8e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0387329  normal  0.117285 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2520  histidine triad (HIT) protein  48.24 
 
 		 169 aa  166  4e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0779132  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2598  histidine triad (HIT) protein  47.1 
 
 		 169 aa  166  4e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0620  histidine triad (HIT) protein  46.71 
 
 		 163 aa  166  5e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00610052  hitchhiker  0.000000200539 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0187  histidine triad (HIT) protein  50.97 
 
 		 164 aa  166  5e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.414611  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1225  histidine triad (HIT) protein  46.79 
 
 		 171 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2880  histidine triad (HIT) protein  48.43 
 
 		 170 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00137934  normal  0.021176 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4660  histidine triad (HIT) protein  43.51 
 
 		 160 aa  162  8.000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.374952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2713  histidine triad (HIT) protein  47.74 
 
 		 162 aa  161  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.256067  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1615  HIT domain-containing protein  47.17 
 
 		 163 aa  160  2e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2958  histidine triad (HIT) protein  47.74 
 
 		 160 aa  159  4e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1932  histidine triad (HIT) protein  45.34 
 
 		 178 aa  158  9e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.106566  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1325  histidine triad (HIT) protein  46.45 
 
 		 160 aa  158  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0365255  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2345  histidine triad (HIT) protein  45.12 
 
 		 165 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2433  histidine triad (HIT) protein  45.12 
 
 		 165 aa  156  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106121  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1497  histidine triad (HIT) protein  46.84 
 
 		 163 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0842593  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1361  histidine triad (HIT) protein  46.2 
 
 		 163 aa  155  1e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.149111  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1522  histidine triad (HIT) protein  44.23 
 
 		 165 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.311815  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2290  histidine triad (HIT) protein  43.87 
 
 		 164 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0845631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1191  histidine triad (HIT) protein  45.81 
 
 		 162 aa  154  2e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00599383  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0562  histidine triad (HIT) protein  43.59 
 
 		 167 aa  151  1e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1725  histidine triad (HIT) protein  47.74 
 
 		 161 aa  147  3e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1357  histidine triad (HIT) protein  47.4 
 
 		 250 aa  147  3e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.474283 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1228  histidine triad (HIT) protein  45.51 
 
 		 163 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1435  hypothetical protein  67.62 
 
 		 123 aa  145  6e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.080987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1305  histidine triad (HIT) protein  40.65 
 
 		 163 aa  144  1e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1871  histidine triad (HIT) protein  43.2 
 
 		 172 aa  144  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0811806  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0143  histidine triad domain-containing protein  43.23 
 
 		 161 aa  143  4e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1878  histidine triad (HIT) protein  42.77 
 
 		 172 aa  142  6e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1784  histidine triad (HIT) protein  46.5 
 
 		 190 aa  142  6e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.238238  normal  0.0568731 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0839  histidine triad (HIT) protein  41.32 
 
 		 172 aa  142  6e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0818988  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0743  histidine triad (HIT) protein  42.04 
 
 		 168 aa  141  9.999999999999999e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000120261  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0641  Hit family protein  41.25 
 
 		 168 aa  141  9.999999999999999e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.7817  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0648  histidine triad (HIT) protein  43.56 
 
 		 163 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2944  histidine triad (HIT) protein  44.12 
 
 		 179 aa  141  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.173088  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1203  histidine triad (HIT) protein  41.56 
 
 		 164 aa  139  7.999999999999999e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.34898  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2525  histidine triad (HIT) protein  40.66 
 
 		 181 aa  137  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.271713  normal  0.184582 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2098  histidine triad (HIT) protein  45 
 
 		 206 aa  137  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00118589  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3187  histidine triad (HIT) protein  45.39 
 
 		 192 aa  137  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1980  histidine triad (HIT) protein  45.75 
 
 		 189 aa  137  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000948071 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2042  histidine triad (HIT) protein  44.08 
 
 		 195 aa  136  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000192809 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1657  histidine triad (HIT) protein  43.79 
 
 		 190 aa  136  4e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.411198  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0735  Hit family protein  40.74 
 
 		 172 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.176537  normal  0.820671 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0927  HIT family hydrolase  39.61 
 
 		 162 aa  135  6.0000000000000005e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1920  histidine triad (HIT) protein  42.38 
 
 		 182 aa  134  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.629691  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0551  histidine triad (HIT) protein  41.77 
 
 		 181 aa  134  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5156  histidine triad (HIT) protein  45.39 
 
 		 229 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00760567  hitchhiker  0.000469823 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1612  histidine triad (HIT) protein  40.37 
 
 		 173 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6130  histidine triad (HIT) protein  46.43 
 
 		 187 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0700761  normal  0.347518 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13910  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  44 
 
 		 187 aa  134  3e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0128023  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1360  histidine triad (HIT) protein  43.23 
 
 		 192 aa  132  5e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.529345 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0956  histidine triad (HIT) protein  39.38 
 
 		 172 aa  132  6.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.630864  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0449  diadenosine tetraphosphate hydrolase  42.11 
 
 		 194 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2105  hypothetical protein  47.5 
 
 		 185 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2400  histidine triad (HIT) protein  43.04 
 
 		 183 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  hitchhiker  0.0085284 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2372  histidine triad (HIT) protein  42.38 
 
 		 174 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0074  histidine triad (HIT) protein  40.51 
 
 		 180 aa  129  6e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0837  histidine triad (HIT) protein  38.65 
 
 		 173 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3837  histidine triad (HIT) protein  41.29 
 
 		 182 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.868089  normal  0.143653 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2335  histidine triad (HIT) protein  42.48 
 
 		 192 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1324  Hit family protein  38.71 
 
 		 165 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0818  histidine triad (HIT) protein  45.28 
 
 		 191 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  0.0395405 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2559  histidine triad (HIT) protein  40.65 
 
 		 182 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1553  histidine triad (HIT) protein  38.18 
 
 		 177 aa  126  5e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.906837  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0607  Hit family protein  37.66 
 
 		 161 aa  125  6e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1435  Hit family protein  37.66 
 
 		 161 aa  125  7e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12632  hypothetical protein  38.85 
 
 		 195 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0100073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0520  Hit family protein  37.66 
 
 		 161 aa  125  8.000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1771  histidine triad (HIT) protein  44.3 
 
 		 182 aa  124  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00317268  normal  0.0187767 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2090  histidine triad (HIT) protein  44.23 
 
 		 182 aa  123  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746736  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17420  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  44.87 
 
 		 192 aa  123  5e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.657455  normal  0.0943717 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1511  histidine triad (HIT) protein  45.57 
 
 		 189 aa  122  5e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2288  histidine triad (HIT) protein  38.27 
 
 		 193 aa  122  7e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.274965  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2316  histidine triad (HIT) protein  42.76 
 
 		 200 aa  122  7e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00279696  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1784  histidine triad (HIT) protein  43.31 
 
 		 182 aa  121  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.686669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0629  Hit family protein  40.15 
 
 		 160 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2243  histidine triad (HIT) protein  38.51 
 
 		 220 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.118301  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2282  histidine triad (HIT) protein  38.51 
 
 		 244 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.983913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2290  histidine triad (HIT) protein  38.51 
 
 		 244 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.358271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15420  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  39.62 
 
 		 187 aa  119  7.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0547976  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2077  histidine triad (HIT) protein  43.59 
 
 		 181 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1377  histidine triad (HIT) protein  43.11 
 
 		 184 aa  118  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0235527  normal  0.0272856 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14920  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  44.03 
 
 		 188 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2053  histidine triad (HIT) protein  39.74 
 
 		 183 aa  117  3e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.109814 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3065  histidine triad (HIT) protein  42.07 
 
 		 184 aa  116  3.9999999999999997e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.236002  normal  0.385258 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0925  histidine triad (HIT) protein  40.8 
 
 		 152 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.220033 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>