More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1004 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1004  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 		 125 aa  263  7e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4872  histidine triad (HIT) protein  64.23 
 
 		 133 aa  176  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1209  histidine triad (HIT) protein  63.93 
 
 		 131 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.818472  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4565  histidine triad (HIT) protein  64.23 
 
 		 130 aa  170  6.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1576  putative hydrolase  55.74 
 
 		 182 aa  157  4e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.031095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04560  histidine triad (HIT) protein  57.5 
 
 		 122 aa  157  5e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  52.46 
 
 		 1077 aa  143  6e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1435  histidine triad (HIT) protein  53.66 
 
 		 126 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1483  hypothetical protein  51.33 
 
 		 142 aa  131  3e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3984  type III restriction protein res subunit  48.31 
 
 		 1418 aa  131  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0651  histidine triad (HIT) protein  50.83 
 
 		 120 aa  131  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0007662  unclonable  0.000000000136009 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1000  hypothetical protein  51.67 
 
 		 122 aa  131  3.9999999999999996e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2227  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  48.78 
 
 		 122 aa  130  7.999999999999999e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0450  hypothetical protein  50.83 
 
 		 124 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0142  histidine triad (HIT) protein  49.14 
 
 		 130 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1659  histidine triad (HIT) protein  47.06 
 
 		 125 aa  121  3e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.490499  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0365  histidine triad (HIT) protein  49.15 
 
 		 121 aa  117  7e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.5377  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0296  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  47.54 
 
 		 127 aa  114  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07720  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  46.85 
 
 		 131 aa  110  8.000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0432  histidine triad (HIT) protein  47.41 
 
 		 149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0398  histidine triad (HIT) protein  40.68 
 
 		 284 aa  106  9.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1488  histidine triad (HIT) protein  57.61 
 
 		 109 aa  103  7e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000559646  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0077  histidine triad (HIT) protein  41.13 
 
 		 138 aa  102  2e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0929  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  43.86 
 
 		 126 aa  101  3e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.685079  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1420  histidine triad (HIT) protein  34.18 
 
 		 179 aa  99  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4049  histidine triad (HIT) protein  40.87 
 
 		 289 aa  96.7  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4113  histidine triad (HIT) protein  37.29 
 
 		 289 aa  94.4  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.489073 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0920  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 174 aa  91.3  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.675581  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1740  histidine triad protein  35.25 
 
 		 139 aa  83.6  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0644  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 		 140 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2890  histidine triad (HIT) protein  36.79 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0357  histidine triad (HIT) protein  36.94 
 
 		 298 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0469904 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3993  type III restriction protein res subunit  52.05 
 
 		 1348 aa  80.1  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3726  histidine triad (HIT) protein  39.62 
 
 		 138 aa  80.1  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0074  histidine triad (HIT) protein  34.82 
 
 		 180 aa  79.7  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0978  HIT family protein  35.96 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1047  HIT family protein  35.96 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1524  histidine triad (HIT) protein  35.14 
 
 		 166 aa  78.6  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4221  HIT family protein  35.96 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.071329  normal  0.0179678 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1083  HIT family protein  35.96 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0010  histidine triad (HIT) protein  32.73 
 
 		 169 aa  78.2  0.00000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0387329  normal  0.117285 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1151  HIT family protein  35.96 
 
 		 165 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0966  HIT family protein  35.96 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0957  HIT family protein  35.96 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2944  histidine triad (HIT) protein  36.7 
 
 		 179 aa  77.8  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.173088  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1124  HIT family protein  35.96 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1212  HIT family protein  35.96 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0075  histidine triad (HIT) protein  36.07 
 
 		 143 aa  76.6  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1658  histidine triad (HIT) protein  35.78 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1434  histidine triad (HIT) protein  35.14 
 
 		 174 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.186815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0962  histidine triad (HIT) protein  35.96 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1183  histidine triad (HIT) protein  36.04 
 
 		 184 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.970277  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1342  histidine triad (HIT) protein  35.14 
 
 		 163 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.187699  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1725  histidine triad (HIT) protein  39.62 
 
 		 161 aa  75.9  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0814  histidine triad (HIT) protein  37.72 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2145  histidine triad (HIT) protein  33.02 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1461  histidine triad (HIT) protein  38.18 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4085  putative HIT family protein  38.32 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1225  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 171 aa  75.1  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1462  histidine triad (HIT) protein  35.14 
 
 		 162 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1973  HIT family protein  35.14 
 
 		 166 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000182824  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47340  putative HIT family protein  38.32 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2280  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  35.71 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0187  histidine triad (HIT) protein  36.04 
 
 		 164 aa  74.3  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.414611  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2237  histidine triad (HIT) protein  33.61 
 
 		 138 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3327  histidine triad (HIT) protein  42.53 
 
 		 139 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.036152 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2372  histidine triad (HIT) protein  34.26 
 
 		 174 aa  73.6  0.0000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2539  histidine triad (HIT) protein  35.85 
 
 		 139 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1373  HIT family protein  33.94 
 
 		 141 aa  72.8  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00295303  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1504  HIT (HINT, histidine triad) family protein  34.86 
 
 		 165 aa  73.6  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000163027  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2525  histidine triad (HIT) protein  39.53 
 
 		 181 aa  73.6  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.271713  normal  0.184582 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1657  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 190 aa  72.8  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.411198  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0711  histidine triad (HIT) protein  37.5 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0363676  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1342  histidine triad (HIT) protein  34.91 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1357  histidine triad (HIT) protein  36.36 
 
 		 250 aa  72  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.474283 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4823  histidine triad (HIT) protein  41.57 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.784878 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0206  histidine triad (HIT) protein  41.57 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.577034 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5415  histidine triad (HIT) protein  41.57 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.269942  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5446  histidine triad (HIT) protein  41.57 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.311796 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56209  diadenosine polyphosphate hydrolase  37.23 
 
 		 179 aa  71.2  0.000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.270188 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3642  histidine triad (HIT) protein  33.64 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0807517  normal  0.0488836 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1531  histidine triad (HIT) protein  33.64 
 
 		 136 aa  71.2  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0620  histidine triad (HIT) protein  36.04 
 
 		 163 aa  71.2  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00610052  hitchhiker  0.000000200539 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5333  histidine triad (HIT) protein  42.53 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4476  putative histidine triad (HIT) protein  40.23 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000626279 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4791  histidine triad (HIT) protein  42.53 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1891  histidine triad (HIT) protein  36.36 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.472953  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0254  histidine triad (HIT) protein  37.5 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1925  histidine triad (HIT) protein  36.36 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3108  histidine triad (HIT) protein  30.58 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2454  histidine triad (HIT) protein  30.58 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.832288  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1980  histidine triad (HIT) protein  35.45 
 
 		 189 aa  70.5  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000948071 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3837  histidine triad (HIT) protein  34.58 
 
 		 182 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.868089  normal  0.143653 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2074  histidine triad (HIT) protein  34.51 
 
 		 165 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165381  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2098  histidine triad (HIT) protein  35.19 
 
 		 206 aa  70.5  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00118589  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2042  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 195 aa  70.5  0.000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000192809 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0620  histidine triad (HIT) protein  35.85 
 
 		 130 aa  70.1  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.693859  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1532  histidine triad (HIT) protein  37.78 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.77898  normal  0.453293 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0315  histidine triad (HIT) protein  37.86 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130359 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1342  histidine triad (HIT) protein  33.96 
 
 		 130 aa  70.1  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>