More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4113 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4113  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 
289 aa  596  1e-169  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.489073 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0398  histidine triad (HIT) protein  65.6 
 
 
284 aa  416  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4049  histidine triad (HIT) protein  50.17 
 
 
289 aa  313  1.9999999999999998e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318812  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0840  histidine triad (HIT) protein  48.84 
 
 
266 aa  257  2e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  hitchhiker  0.000000646753 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0344  histidine triad (HIT) protein  46.18 
 
 
268 aa  254  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.448559 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4872  histidine triad (HIT) protein  38.21 
 
 
133 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04560  histidine triad (HIT) protein  42.86 
 
 
122 aa  108  8.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0142  histidine triad (HIT) protein  43.97 
 
 
130 aa  107  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1000  hypothetical protein  40.16 
 
 
122 aa  105  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0651  histidine triad (HIT) protein  40.34 
 
 
120 aa  102  8e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0007662  unclonable  0.000000000136009 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1483  hypothetical protein  41.44 
 
 
142 aa  100  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1209  histidine triad (HIT) protein  36.07 
 
 
131 aa  101  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.818472  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1576  putative hydrolase  39.83 
 
 
182 aa  99.4  7e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.031095  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1435  histidine triad (HIT) protein  35.29 
 
 
126 aa  95.9  7e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  34.43 
 
 
1077 aa  95.5  8e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4565  histidine triad (HIT) protein  37.7 
 
 
130 aa  94.7  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1004  histidine triad (HIT) protein  37.29 
 
 
125 aa  94.4  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1659  histidine triad (HIT) protein  38.79 
 
 
125 aa  93.6  4e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.490499  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2227  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  37.82 
 
 
122 aa  92.8  5e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0365  histidine triad (HIT) protein  36.21 
 
 
121 aa  92.4  7e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.5377  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0296  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  35.83 
 
 
127 aa  91.7  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0929  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  35.9 
 
 
126 aa  90.9  2e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.685079  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0450  hypothetical protein  35.34 
 
 
124 aa  89.7  5e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3984  type III restriction protein res subunit  40.82 
 
 
1418 aa  86.3  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07720  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  33.33 
 
 
131 aa  82  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1488  histidine triad (HIT) protein  39.33 
 
 
109 aa  81.6  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000559646  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1531  histidine triad (HIT) protein  33.9 
 
 
136 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0432  histidine triad (HIT) protein  31.36 
 
 
149 aa  79.3  0.00000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0644  histidine triad (HIT) protein  34.86 
 
 
140 aa  74.3  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2944  histidine triad (HIT) protein  29.84 
 
 
179 aa  73.6  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.173088  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1342  histidine triad (HIT) protein  39.62 
 
 
130 aa  73.2  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1333  histidine triad (HIT) protein  39.62 
 
 
130 aa  73.2  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0568524  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1740  histidine triad protein  31.36 
 
 
139 aa  72.8  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1228  histidine triad (HIT) protein  25.98 
 
 
163 aa  72.4  0.000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3642  histidine triad (HIT) protein  30.63 
 
 
145 aa  72.4  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0807517  normal  0.0488836 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0074  histidine triad (HIT) protein  28.8 
 
 
180 aa  72  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0620  histidine triad (HIT) protein  37.74 
 
 
130 aa  72  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.693859  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3726  histidine triad (HIT) protein  37.27 
 
 
138 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0010  histidine triad (HIT) protein  31.09 
 
 
169 aa  70.9  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0387329  normal  0.117285 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1342  histidine triad (HIT) protein  29.73 
 
 
163 aa  70.5  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.187699  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1342  histidine triad (HIT) protein  40.57 
 
 
130 aa  70.5  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2890  histidine triad (HIT) protein  26.45 
 
 
139 aa  70.1  0.00000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1461  histidine triad (HIT) protein  34.86 
 
 
143 aa  69.7  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0814  histidine triad (HIT) protein  32.14 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0962  histidine triad (HIT) protein  31.53 
 
 
144 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0648  histidine triad (HIT) protein  32.81 
 
 
163 aa  68.9  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0075  histidine triad (HIT) protein  31.09 
 
 
143 aa  68.6  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0927  HIT family hydrolase  35.2 
 
 
162 aa  68.2  0.0000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0187  histidine triad (HIT) protein  28.36 
 
 
164 aa  68.6  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.414611  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1151  HIT family protein  31.53 
 
 
165 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0978  HIT family protein  32.43 
 
 
144 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0966  HIT family protein  31.53 
 
 
144 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0957  HIT family protein  31.53 
 
 
144 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1124  HIT family protein  31.53 
 
 
144 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1047  HIT family protein  32.43 
 
 
144 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1212  HIT family protein  31.53 
 
 
144 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2280  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  34.55 
 
 
132 aa  67.4  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1504  HIT (HINT, histidine triad) family protein  26.05 
 
 
165 aa  67.4  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000163027  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2290  histidine triad (HIT) protein  28.57 
 
 
164 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0845631  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1203  histidine triad (HIT) protein  30.7 
 
 
164 aa  66.6  0.0000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.34898  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4660  histidine triad (HIT) protein  26.05 
 
 
160 aa  66.6  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.374952  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0551  histidine triad (HIT) protein  31.53 
 
 
181 aa  67  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0168  hypothetical protein  24.03 
 
 
483 aa  66.6  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4221  HIT family protein  31.4 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.071329  normal  0.0179678 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1083  HIT family protein  31.4 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13910  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  30.97 
 
 
187 aa  66.2  0.0000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0128023  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2074  histidine triad (HIT) protein  33.03 
 
 
165 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165381  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1871  histidine triad (HIT) protein  32.48 
 
 
172 aa  65.9  0.0000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0811806  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0636  hypothetical protein  40.96 
 
 
759 aa  65.9  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0115625 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2169  histidine triad (HIT) protein  27.03 
 
 
140 aa  65.9  0.0000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1522  histidine triad (HIT) protein  29.36 
 
 
165 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.311815  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0596  histidine triad (HIT) protein  36.54 
 
 
131 aa  65.1  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1701  HIT family protein  30.95 
 
 
162 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.652784  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1050  histidine triad (HIT) protein  27.19 
 
 
139 aa  64.7  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.265499  normal  0.307581 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0183  hypothetical protein  30.77 
 
 
853 aa  64.7  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0347623 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1420  histidine triad (HIT) protein  24.84 
 
 
179 aa  64.7  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1638  histidine triad (HIT) protein  30.91 
 
 
162 aa  64.7  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000357011  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1497  histidine triad (HIT) protein  34.21 
 
 
163 aa  64.7  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0842593  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0472  HIT family protein  37.14 
 
 
131 aa  64.7  0.000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.974422  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0620  histidine triad (HIT) protein  29.46 
 
 
163 aa  64.7  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00610052  hitchhiker  0.000000200539 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2345  histidine triad (HIT) protein  29.36 
 
 
165 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2542  histidine triad (HIT) protein  29.06 
 
 
174 aa  64.3  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1511  histidine triad (HIT) protein  27.97 
 
 
189 aa  63.5  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0987  hypothetical protein  37.18 
 
 
664 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1225  histidine triad (HIT) protein  26.09 
 
 
171 aa  63.5  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0077  histidine triad (HIT) protein  27.35 
 
 
138 aa  63.2  0.000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4014  histidine triad (HIT) protein  34.07 
 
 
137 aa  63.5  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0269  histidine triad protein HIT  37.84 
 
 
152 aa  63.5  0.000000004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0663739  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1361  histidine triad (HIT) protein  32.46 
 
 
163 aa  62.8  0.000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.149111  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2433  histidine triad (HIT) protein  28.44 
 
 
165 aa  62.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106121  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0641  Hit family protein  28.07 
 
 
168 aa  62.8  0.000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.7817  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1009  histidine triad (HIT) protein  31.37 
 
 
139 aa  62.8  0.000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1188  hypothetical protein  30.77 
 
 
1022 aa  62.8  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3993  type III restriction protein res subunit  50 
 
 
1348 aa  62.4  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1444  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  37.5 
 
 
144 aa  62.4  0.000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000339612  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2237  histidine triad (HIT) protein  33.03 
 
 
138 aa  62.4  0.000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0743  histidine triad (HIT) protein  26.89 
 
 
168 aa  62.4  0.000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000120261  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1553  histidine triad (HIT) protein  30.63 
 
 
177 aa  62  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.906837  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1016  hypothetical protein  35.9 
 
 
664 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.244285  normal  0.98373 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1191  histidine triad (HIT) protein  31.78 
 
 
162 aa  62  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00599383  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>