More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0450 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0450  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  259  1e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1000  hypothetical protein  58.47 
 
 
122 aa  154  4e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2227  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  55.46 
 
 
122 aa  149  2e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0651  histidine triad (HIT) protein  52.5 
 
 
120 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0007662  unclonable  0.000000000136009 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1435  histidine triad (HIT) protein  53.33 
 
 
126 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04560  histidine triad (HIT) protein  50.82 
 
 
122 aa  137  6e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  50 
 
 
1077 aa  132  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1209  histidine triad (HIT) protein  53.33 
 
 
131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.818472  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0929  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  49.58 
 
 
126 aa  126  8.000000000000001e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.685079  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4872  histidine triad (HIT) protein  55 
 
 
133 aa  126  9.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1004  histidine triad (HIT) protein  50.83 
 
 
125 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0365  histidine triad (HIT) protein  50.41 
 
 
121 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.5377  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3984  type III restriction protein res subunit  50.89 
 
 
1418 aa  117  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0142  histidine triad (HIT) protein  46.09 
 
 
130 aa  117  6e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0296  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  47.97 
 
 
127 aa  115  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07720  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  50 
 
 
131 aa  114  3.9999999999999997e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1483  hypothetical protein  55 
 
 
142 aa  113  6.9999999999999995e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1659  histidine triad (HIT) protein  46.9 
 
 
125 aa  112  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.490499  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4565  histidine triad (HIT) protein  48.33 
 
 
130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0432  histidine triad (HIT) protein  40.98 
 
 
149 aa  110  8.000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0398  histidine triad (HIT) protein  45.22 
 
 
284 aa  110  9e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4049  histidine triad (HIT) protein  42.98 
 
 
289 aa  110  9e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318812  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1576  putative hydrolase  44.17 
 
 
182 aa  106  9.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.031095  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1488  histidine triad (HIT) protein  52.29 
 
 
109 aa  104  4e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000559646  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0077  histidine triad (HIT) protein  42.62 
 
 
138 aa  90.9  6e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4113  histidine triad (HIT) protein  35.34 
 
 
289 aa  89.7  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.489073 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0920  histidine triad (HIT) protein  33.76 
 
 
174 aa  82.8  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.675581  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1420  histidine triad (HIT) protein  32.48 
 
 
179 aa  83.2  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2042  histidine triad (HIT) protein  38.53 
 
 
195 aa  82  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000192809 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1740  histidine triad protein  31.78 
 
 
139 aa  81.3  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13910  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  41.67 
 
 
187 aa  80.5  0.000000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0128023  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2316  histidine triad (HIT) protein  37.61 
 
 
200 aa  77.4  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00279696  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3837  histidine triad (HIT) protein  35.58 
 
 
182 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.868089  normal  0.143653 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0472  histidine triad (HIT) protein  38.24 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1784  histidine triad (HIT) protein  38.89 
 
 
190 aa  77.4  0.00000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.238238  normal  0.0568731 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2713  histidine triad (HIT) protein  33.04 
 
 
162 aa  76.3  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.256067  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1357  histidine triad (HIT) protein  38.53 
 
 
250 aa  76.6  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.474283 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0620  histidine triad (HIT) protein  37.61 
 
 
163 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00610052  hitchhiker  0.000000200539 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1980  histidine triad (HIT) protein  37.96 
 
 
189 aa  75.1  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000948071 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2282  histidine triad (HIT) protein  35.58 
 
 
244 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.983913  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0074  histidine triad (HIT) protein  38.18 
 
 
180 aa  74.7  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2243  histidine triad (HIT) protein  35.58 
 
 
220 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.118301  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2290  histidine triad (HIT) protein  35.58 
 
 
244 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.358271  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1462  histidine triad (HIT) protein  35.45 
 
 
162 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0644  histidine triad (HIT) protein  36.54 
 
 
140 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1444  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  36.36 
 
 
144 aa  73.9  0.0000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000339612  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3993  type III restriction protein res subunit  66 
 
 
1348 aa  73.9  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1504  HIT (HINT, histidine triad) family protein  34.55 
 
 
165 aa  73.9  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000163027  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0010  histidine triad (HIT) protein  39.53 
 
 
169 aa  73.9  0.0000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0387329  normal  0.117285 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0187  histidine triad (HIT) protein  32.56 
 
 
164 aa  73.2  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.414611  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1461  histidine triad (HIT) protein  36.54 
 
 
143 aa  73.2  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2559  histidine triad (HIT) protein  33.65 
 
 
182 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1342  histidine triad (HIT) protein  40.7 
 
 
163 aa  72  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.187699  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12632  hypothetical protein  34.62 
 
 
195 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0100073  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17420  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  38.53 
 
 
192 aa  72  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.657455  normal  0.0943717 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1657  histidine triad (HIT) protein  34.26 
 
 
190 aa  72.8  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.411198  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2335  histidine triad (HIT) protein  35.19 
 
 
192 aa  72.8  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733694  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2372  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 
174 aa  72  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4085  putative HIT family protein  39.47 
 
 
153 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1524  histidine triad (HIT) protein  35.45 
 
 
166 aa  72  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1531  histidine triad (HIT) protein  30.23 
 
 
136 aa  72  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2145  histidine triad (HIT) protein  34.58 
 
 
146 aa  72  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538577  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47340  putative HIT family protein  39.47 
 
 
153 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10680  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  38.89 
 
 
226 aa  71.6  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000753626  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1083  HIT family protein  31.01 
 
 
144 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4221  HIT family protein  31.01 
 
 
144 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.071329  normal  0.0179678 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1973  HIT family protein  33.94 
 
 
166 aa  70.9  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000182824  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2944  histidine triad (HIT) protein  39.08 
 
 
179 aa  71.2  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.173088  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2098  histidine triad (HIT) protein  32.11 
 
 
206 aa  71.2  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00118589  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3726  histidine triad (HIT) protein  33.96 
 
 
138 aa  70.9  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2288  histidine triad (HIT) protein  34.29 
 
 
193 aa  70.5  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.274965  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3187  histidine triad (HIT) protein  35.45 
 
 
192 aa  70.5  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1151  HIT family protein  31.01 
 
 
165 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1212  HIT family protein  31.01 
 
 
144 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0966  HIT family protein  31.01 
 
 
144 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0957  HIT family protein  31.01 
 
 
144 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1124  HIT family protein  31.01 
 
 
144 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0962  histidine triad (HIT) protein  35.14 
 
 
144 aa  70.1  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0978  HIT family protein  31.01 
 
 
144 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1047  HIT family protein  31.01 
 
 
144 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1228  histidine triad (HIT) protein  35.05 
 
 
163 aa  69.7  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1553  histidine triad (HIT) protein  37.76 
 
 
177 aa  69.3  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.906837  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2991  histidine triad (HIT) protein  37.86 
 
 
113 aa  69.7  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.337185  normal  0.959668 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0814  histidine triad (HIT) protein  33.91 
 
 
144 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5156  histidine triad (HIT) protein  33.64 
 
 
229 aa  70.1  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00760567  hitchhiker  0.000469823 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1932  histidine triad (HIT) protein  34.41 
 
 
178 aa  68.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.106566  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1324  Hit family protein  33.93 
 
 
165 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2090  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 
182 aa  69.3  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746736  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14920  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  34.26 
 
 
188 aa  68.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0562  histidine triad (HIT) protein  34.86 
 
 
167 aa  68.6  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2525  histidine triad (HIT) protein  39.53 
 
 
181 aa  68.6  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.271713  normal  0.184582 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1638  histidine triad (HIT) protein  33.64 
 
 
162 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000357011  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3642  histidine triad (HIT) protein  32.71 
 
 
145 aa  68.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0807517  normal  0.0488836 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2598  histidine triad (HIT) protein  32.73 
 
 
169 aa  68.2  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2074  histidine triad (HIT) protein  32.73 
 
 
165 aa  68.2  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165381  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2280  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  36.19 
 
 
132 aa  68.6  0.00000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2290  histidine triad (HIT) protein  38.37 
 
 
164 aa  68.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0845631  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0141  histidine triad (HIT) protein  32.28 
 
 
144 aa  68.2  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15420  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  33.94 
 
 
187 aa  67.8  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0547976  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1325  histidine triad (HIT) protein  38.32 
 
 
160 aa  67.8  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0365255  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>