More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2290 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_2290  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 
244 aa  497  1e-140  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.358271  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2282  histidine triad (HIT) protein  99.18 
 
 
244 aa  491  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.983913  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2243  histidine triad (HIT) protein  99.55 
 
 
220 aa  450  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.118301  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12632  hypothetical protein  79.06 
 
 
195 aa  310  1e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0100073  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2559  histidine triad (HIT) protein  83.15 
 
 
182 aa  307  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3837  histidine triad (HIT) protein  81.22 
 
 
182 aa  305  3e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.868089  normal  0.143653 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2288  histidine triad (HIT) protein  65.57 
 
 
193 aa  258  8e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.274965  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1920  histidine triad (HIT) protein  60.34 
 
 
182 aa  228  5e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.629691  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1357  histidine triad (HIT) protein  56.07 
 
 
250 aa  218  5e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.474283 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2335  histidine triad (HIT) protein  58.48 
 
 
192 aa  216  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733694  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2098  histidine triad (HIT) protein  56.32 
 
 
206 aa  214  8e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00118589  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1980  histidine triad (HIT) protein  56.98 
 
 
189 aa  214  9.999999999999999e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000948071 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2400  histidine triad (HIT) protein  54.91 
 
 
183 aa  211  7.999999999999999e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  hitchhiker  0.0085284 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2090  histidine triad (HIT) protein  57.14 
 
 
182 aa  209  4e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746736  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1360  histidine triad (HIT) protein  52.75 
 
 
192 aa  207  1e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.529345 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3187  histidine triad (HIT) protein  58.54 
 
 
192 aa  207  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2372  histidine triad (HIT) protein  56.89 
 
 
174 aa  207  1e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6130  histidine triad (HIT) protein  56.14 
 
 
187 aa  203  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0700761  normal  0.347518 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14920  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  56.22 
 
 
188 aa  202  5e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5156  histidine triad (HIT) protein  54.39 
 
 
229 aa  202  5e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00760567  hitchhiker  0.000469823 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2077  histidine triad (HIT) protein  57.31 
 
 
181 aa  202  6e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17420  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  55.03 
 
 
192 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.657455  normal  0.0943717 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3441  histidine triad (HIT) protein  57.31 
 
 
182 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000440827  hitchhiker  0.0000328621 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1657  histidine triad (HIT) protein  57.23 
 
 
190 aa  196  3e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.411198  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15420  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  50 
 
 
187 aa  194  1e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0547976  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1784  histidine triad (HIT) protein  56.02 
 
 
182 aa  190  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.686669  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1771  histidine triad (HIT) protein  56.02 
 
 
182 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00317268  normal  0.0187767 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3065  histidine triad (HIT) protein  51.76 
 
 
184 aa  186  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.236002  normal  0.385258 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0818  histidine triad (HIT) protein  51.15 
 
 
191 aa  185  6e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  0.0395405 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13910  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  50.3 
 
 
187 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0128023  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2105  hypothetical protein  50.53 
 
 
185 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1784  histidine triad (HIT) protein  50.3 
 
 
190 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.238238  normal  0.0568731 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2042  histidine triad (HIT) protein  50.88 
 
 
195 aa  184  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000192809 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1377  histidine triad (HIT) protein  50.84 
 
 
184 aa  176  3e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0235527  normal  0.0272856 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2316  histidine triad (HIT) protein  49.71 
 
 
200 aa  174  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00279696  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0449  diadenosine tetraphosphate hydrolase  43.6 
 
 
194 aa  171  1e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10680  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  44.83 
 
 
226 aa  156  3e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000753626  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0010  histidine triad (HIT) protein  43.83 
 
 
169 aa  155  4e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0387329  normal  0.117285 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1524  histidine triad (HIT) protein  43.37 
 
 
166 aa  153  2e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2880  histidine triad (HIT) protein  44.25 
 
 
170 aa  152  7e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00137934  normal  0.021176 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2525  histidine triad (HIT) protein  46.63 
 
 
181 aa  147  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.271713  normal  0.184582 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1387  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 
171 aa  145  6e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.026049  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0837  histidine triad (HIT) protein  40.85 
 
 
173 aa  145  8.000000000000001e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1932  histidine triad (HIT) protein  41.36 
 
 
178 aa  144  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.106566  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1504  HIT (HINT, histidine triad) family protein  40.12 
 
 
165 aa  144  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000163027  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0956  histidine triad (HIT) protein  41.82 
 
 
172 aa  142  4e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.630864  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1342  histidine triad (HIT) protein  42.31 
 
 
163 aa  142  6e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.187699  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1878  histidine triad (HIT) protein  41.25 
 
 
172 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2713  histidine triad (HIT) protein  47.15 
 
 
162 aa  139  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.256067  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1725  histidine triad (HIT) protein  41.57 
 
 
161 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0839  histidine triad (HIT) protein  39.74 
 
 
172 aa  138  6e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0818988  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1225  histidine triad (HIT) protein  39.31 
 
 
171 aa  138  7e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0562  histidine triad (HIT) protein  41.56 
 
 
167 aa  137  1e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1612  histidine triad (HIT) protein  36.16 
 
 
173 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0187  histidine triad (HIT) protein  38.85 
 
 
164 aa  136  4e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.414611  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0735  Hit family protein  40.94 
 
 
172 aa  135  5e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.176537  normal  0.820671 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2126  histidine triad (HIT) protein  38.01 
 
 
166 aa  134  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000712705 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1658  histidine triad (HIT) protein  38.85 
 
 
164 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0620  histidine triad (HIT) protein  37.06 
 
 
163 aa  133  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00610052  hitchhiker  0.000000200539 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2290  histidine triad (HIT) protein  41.07 
 
 
164 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0845631  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0629  Hit family protein  45.11 
 
 
160 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2433  histidine triad (HIT) protein  41.67 
 
 
165 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106121  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1462  histidine triad (HIT) protein  43.44 
 
 
162 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2598  histidine triad (HIT) protein  39.88 
 
 
169 aa  129  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4660  histidine triad (HIT) protein  36.2 
 
 
160 aa  128  7.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.374952  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2345  histidine triad (HIT) protein  41.07 
 
 
165 aa  128  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2520  histidine triad (HIT) protein  42.5 
 
 
169 aa  128  9.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0779132  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1434  histidine triad (HIT) protein  36.99 
 
 
174 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.186815  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1191  histidine triad (HIT) protein  38.06 
 
 
162 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00599383  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2944  histidine triad (HIT) protein  35.91 
 
 
179 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.173088  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1522  histidine triad (HIT) protein  39.88 
 
 
165 aa  125  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.311815  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2074  histidine triad (HIT) protein  34.55 
 
 
165 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165381  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1973  HIT family protein  38.51 
 
 
166 aa  125  9e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000182824  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0648  histidine triad (HIT) protein  43.83 
 
 
163 aa  122  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1228  histidine triad (HIT) protein  39.16 
 
 
163 aa  122  4e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1638  histidine triad (HIT) protein  36.69 
 
 
162 aa  122  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000357011  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0357  histidine triad (HIT) protein  38.51 
 
 
298 aa  122  6e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0469904 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0551  histidine triad (HIT) protein  36.05 
 
 
181 aa  121  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1183  histidine triad (HIT) protein  35.39 
 
 
184 aa  120  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.970277  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1615  HIT domain-containing protein  40.27 
 
 
163 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0074  histidine triad (HIT) protein  37.87 
 
 
180 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1701  HIT family protein  32.34 
 
 
162 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.652784  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0743  histidine triad (HIT) protein  34.3 
 
 
168 aa  117  9.999999999999999e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000120261  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0927  HIT family hydrolase  32.52 
 
 
162 aa  117  9.999999999999999e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1497  histidine triad (HIT) protein  38.93 
 
 
163 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0842593  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1324  Hit family protein  36.42 
 
 
165 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0520  Hit family protein  36.42 
 
 
161 aa  116  3e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1435  Hit family protein  35.76 
 
 
161 aa  115  8.999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0607  Hit family protein  35.76 
 
 
161 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1361  histidine triad (HIT) protein  37.84 
 
 
163 aa  113  3e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.149111  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2958  histidine triad (HIT) protein  35.29 
 
 
160 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1871  histidine triad (HIT) protein  35.9 
 
 
172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0811806  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0143  histidine triad domain-containing protein  34 
 
 
161 aa  109  4.0000000000000004e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1325  histidine triad (HIT) protein  35 
 
 
160 aa  109  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0365255  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1553  histidine triad (HIT) protein  32.42 
 
 
177 aa  107  1e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.906837  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1305  histidine triad (HIT) protein  36 
 
 
163 aa  107  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2053  histidine triad (HIT) protein  35.91 
 
 
183 aa  106  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.109814 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1511  histidine triad (HIT) protein  34.52 
 
 
189 aa  105  5e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0641  Hit family protein  34.62 
 
 
168 aa  105  1e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.7817  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1203  histidine triad (HIT) protein  36.55 
 
 
164 aa  101  9e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.34898  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>