More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0142 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0142  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 
130 aa  269  9e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1659  histidine triad (HIT) protein  72.81 
 
 
125 aa  176  8e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.490499  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04560  histidine triad (HIT) protein  58.26 
 
 
122 aa  146  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1000  hypothetical protein  55.65 
 
 
122 aa  136  7.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1435  histidine triad (HIT) protein  54.31 
 
 
126 aa  134  4e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0651  histidine triad (HIT) protein  56.52 
 
 
120 aa  131  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0007662  unclonable  0.000000000136009 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1209  histidine triad (HIT) protein  53.04 
 
 
131 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.818472  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4872  histidine triad (HIT) protein  53.98 
 
 
133 aa  127  6e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1004  histidine triad (HIT) protein  49.14 
 
 
125 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0365  histidine triad (HIT) protein  49.15 
 
 
121 aa  122  1e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.5377  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0929  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  46.09 
 
 
126 aa  120  5e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.685079  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1576  putative hydrolase  47.83 
 
 
182 aa  120  6e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.031095  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3984  type III restriction protein res subunit  49.18 
 
 
1418 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4565  histidine triad (HIT) protein  48.7 
 
 
130 aa  117  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0450  hypothetical protein  46.09 
 
 
124 aa  117  6e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2227  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  49.14 
 
 
122 aa  116  9e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07720  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  52.29 
 
 
131 aa  114  3.9999999999999997e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0398  histidine triad (HIT) protein  42.98 
 
 
284 aa  110  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  44.35 
 
 
1077 aa  108  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1483  hypothetical protein  49.51 
 
 
142 aa  108  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4113  histidine triad (HIT) protein  43.97 
 
 
289 aa  107  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.489073 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0432  histidine triad (HIT) protein  43.22 
 
 
149 aa  107  5e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4049  histidine triad (HIT) protein  40.52 
 
 
289 aa  103  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318812  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1488  histidine triad (HIT) protein  62.65 
 
 
109 aa  103  9e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000559646  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0074  histidine triad (HIT) protein  40.71 
 
 
180 aa  99  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1740  histidine triad protein  38.33 
 
 
139 aa  94.7  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0296  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  45.22 
 
 
127 aa  94.7  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2944  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 
179 aa  94.4  5e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.173088  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0010  histidine triad (HIT) protein  40.18 
 
 
169 aa  91.7  3e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0387329  normal  0.117285 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0551  histidine triad (HIT) protein  39.82 
 
 
181 aa  90.9  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1524  histidine triad (HIT) protein  36.61 
 
 
166 aa  89  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1531  histidine triad (HIT) protein  37.04 
 
 
136 aa  88.6  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1420  histidine triad (HIT) protein  36.42 
 
 
179 aa  87.4  6e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2890  histidine triad (HIT) protein  34.91 
 
 
139 aa  86.3  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2290  histidine triad (HIT) protein  40.54 
 
 
164 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0845631  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4014  histidine triad (HIT) protein  45.05 
 
 
137 aa  85.9  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0187  histidine triad (HIT) protein  39.64 
 
 
164 aa  85.9  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.414611  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1228  histidine triad (HIT) protein  35.45 
 
 
163 aa  85.9  2e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1657  histidine triad (HIT) protein  36.94 
 
 
190 aa  85.5  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.411198  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0077  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 
138 aa  85.9  2e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0562  histidine triad (HIT) protein  38.18 
 
 
167 aa  85.1  3e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1342  histidine triad (HIT) protein  39.64 
 
 
163 aa  84.7  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.187699  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2074  histidine triad (HIT) protein  36.36 
 
 
165 aa  84  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165381  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13910  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  36.04 
 
 
187 aa  82.8  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0128023  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0920  histidine triad (HIT) protein  38.56 
 
 
174 aa  83.2  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.675581  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2598  histidine triad (HIT) protein  33.03 
 
 
169 aa  82  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1376  histidine triad (HIT) protein  39.81 
 
 
151 aa  82.4  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.341423  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1225  histidine triad (HIT) protein  34.82 
 
 
171 aa  81.6  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3726  histidine triad (HIT) protein  39.64 
 
 
138 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1784  histidine triad (HIT) protein  39.45 
 
 
190 aa  81.3  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.238238  normal  0.0568731 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3837  histidine triad (HIT) protein  36.45 
 
 
182 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.868089  normal  0.143653 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1701  HIT family protein  34.55 
 
 
162 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.652784  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2559  histidine triad (HIT) protein  37.38 
 
 
182 aa  80.9  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1980  histidine triad (HIT) protein  35.78 
 
 
189 aa  80.1  0.000000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000948071 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1373  HIT family protein  36.7 
 
 
141 aa  79.7  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00295303  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1497  histidine triad (HIT) protein  35.71 
 
 
163 aa  79.7  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0842593  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2145  histidine triad (HIT) protein  37.38 
 
 
146 aa  79.7  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538577  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1973  HIT family protein  36.94 
 
 
166 aa  79.3  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000182824  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2237  histidine triad (HIT) protein  36.61 
 
 
138 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2243  histidine triad (HIT) protein  31.91 
 
 
220 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.118301  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2282  histidine triad (HIT) protein  31.91 
 
 
244 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.983913  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2290  histidine triad (HIT) protein  31.91 
 
 
244 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.358271  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1050  histidine triad (HIT) protein  37.5 
 
 
139 aa  79  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.265499  normal  0.307581 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1504  HIT (HINT, histidine triad) family protein  33.64 
 
 
165 aa  79.3  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000163027  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1638  histidine triad (HIT) protein  33.64 
 
 
162 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000357011  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0269  histidine triad protein HIT  36.94 
 
 
152 aa  79  0.00000000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0663739  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2433  histidine triad (HIT) protein  36.04 
 
 
165 aa  78.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106121  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1511  histidine triad (HIT) protein  35.71 
 
 
189 aa  79  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2345  histidine triad (HIT) protein  36.04 
 
 
165 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2372  histidine triad (HIT) protein  36.7 
 
 
174 aa  79  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0620  histidine triad (HIT) protein  36.36 
 
 
130 aa  78.2  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.693859  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1522  histidine triad (HIT) protein  35.14 
 
 
165 aa  78.2  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.311815  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2400  histidine triad (HIT) protein  33.03 
 
 
183 aa  78.6  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  hitchhiker  0.0085284 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1342  histidine triad (HIT) protein  35.54 
 
 
130 aa  78.2  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1333  histidine triad (HIT) protein  34.71 
 
 
130 aa  78.2  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0568524  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1553  histidine triad (HIT) protein  37.38 
 
 
177 aa  77.8  0.00000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.906837  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1658  histidine triad (HIT) protein  33.64 
 
 
164 aa  77.8  0.00000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0449  diadenosine tetraphosphate hydrolase  36.04 
 
 
194 aa  77.4  0.00000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0620  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 
163 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00610052  hitchhiker  0.000000200539 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3642  histidine triad (HIT) protein  37.5 
 
 
145 aa  77.4  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0807517  normal  0.0488836 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0726  histidine triad (HIT) protein  35.54 
 
 
145 aa  77  0.00000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12632  hypothetical protein  37.23 
 
 
195 aa  77  0.00000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0100073  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2288  histidine triad (HIT) protein  32.71 
 
 
193 aa  77  0.00000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.274965  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0075  histidine triad (HIT) protein  36.94 
 
 
143 aa  76.6  0.00000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1615  HIT domain-containing protein  34.55 
 
 
163 aa  76.6  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1361  histidine triad (HIT) protein  35.45 
 
 
163 aa  76.6  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.149111  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0357  histidine triad (HIT) protein  37.5 
 
 
298 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0469904 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2713  histidine triad (HIT) protein  30.47 
 
 
162 aa  76.3  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.256067  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2090  histidine triad (HIT) protein  35.78 
 
 
182 aa  76.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746736  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2098  histidine triad (HIT) protein  34.86 
 
 
206 aa  76.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00118589  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14523  predicted protein  32.23 
 
 
160 aa  75.9  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1387  histidine triad (HIT) protein  34.82 
 
 
171 aa  75.5  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.026049  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1342  histidine triad (HIT) protein  35.54 
 
 
130 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2525  histidine triad (HIT) protein  41.18 
 
 
181 aa  75.5  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.271713  normal  0.184582 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2064  histidine triad (HIT) protein  44.44 
 
 
164 aa  76.3  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.225025 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2169  histidine triad (HIT) protein  37.72 
 
 
140 aa  75.9  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1434  histidine triad (HIT) protein  35.4 
 
 
174 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.186815  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1360  histidine triad (HIT) protein  35.78 
 
 
192 aa  75.5  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.529345 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1444  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  36.61 
 
 
144 aa  75.1  0.0000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000339612  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0648  histidine triad (HIT) protein  34.65 
 
 
163 aa  75.1  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>