146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2064 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2064  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 		 164 aa  336  9.999999999999999e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.225025 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0142  histidine triad (HIT) protein  44.44 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1659  histidine triad (HIT) protein  41 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.490499  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1000  hypothetical protein  43.88 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07720  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  43.33 
 
 		 131 aa  67  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1576  putative hydrolase  32.37 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.031095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0651  histidine triad (HIT) protein  40.59 
 
 		 120 aa  64.7  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0007662  unclonable  0.000000000136009 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04560  histidine triad (HIT) protein  39.56 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3984  type III restriction protein res subunit  42.16 
 
 		 1418 aa  63.9  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1209  histidine triad (HIT) protein  36.36 
 
 		 131 aa  63.5  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.818472  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0365  histidine triad (HIT) protein  35.24 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.5377  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1483  hypothetical protein  37.1 
 
 		 142 aa  62  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0398  histidine triad (HIT) protein  35.96 
 
 		 284 aa  61.2  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2525  histidine triad (HIT) protein  45.71 
 
 		 181 aa  61.6  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.271713  normal  0.184582 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0450  hypothetical protein  42.86 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3327  histidine triad (HIT) protein  33.09 
 
 		 139 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.036152 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4565  histidine triad (HIT) protein  36.46 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2227  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  38.38 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  40 
 
 		 1077 aa  59.3  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4872  histidine triad (HIT) protein  37.5 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1435  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4476  putative histidine triad (HIT) protein  29.63 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000626279 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3968  histidine triad (HIT) protein  30.77 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1488  histidine triad (HIT) protein  45.12 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000559646  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0781  histidine triad (HIT) protein  38.57 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1932  histidine triad (HIT) protein  36.27 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.106566  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0206  histidine triad (HIT) protein  34.06 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.577034 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2145  histidine triad (HIT) protein  32.8 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5415  histidine triad (HIT) protein  34.06 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.269942  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0929  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  32.67 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.685079  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5446  histidine triad (HIT) protein  34.06 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.311796 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4823  histidine triad (HIT) protein  34.06 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.784878 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4014  histidine triad (HIT) protein  37.14 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4049  histidine triad (HIT) protein  34.88 
 
 		 289 aa  53.9  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2464  histidine triad (HIT) protein  38.32 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1531  histidine triad (HIT) protein  28.89 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1004  histidine triad (HIT) protein  33.75 
 
 		 125 aa  52.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0207  HIT family protein  32.95 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0979  HIT family protein  32.95 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.721312  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0492  HIT family protein  32.95 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4113  histidine triad (HIT) protein  32.56 
 
 		 289 aa  52.4  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.489073 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1382  HIT family protein  32.95 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2703  HIT family protein  32.95 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2559  HIT family protein  32.95 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.609142  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0238  HIT family protein  32.95 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1579  HIT family protein  32.95 
 
 		 139 aa  52  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.380866  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4791  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 139 aa  51.6  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5333  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 139 aa  51.6  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1553  histidine triad (HIT) protein  32 
 
 		 177 aa  51.2  0.000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.906837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0432  histidine triad (HIT) protein  34.75 
 
 		 149 aa  51.2  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3108  histidine triad (HIT) protein  33.64 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0187  histidine triad (HIT) protein  32.88 
 
 		 164 aa  49.7  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.414611  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2288  histidine triad (HIT) protein  34.21 
 
 		 193 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.274965  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2454  histidine triad (HIT) protein  33.64 
 
 		 145 aa  49.7  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.832288  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0254  histidine triad (HIT) protein  31.65 
 
 		 145 aa  48.9  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1740  histidine triad protein  31.4 
 
 		 139 aa  48.9  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1342  histidine triad (HIT) protein  31.36 
 
 		 163 aa  48.9  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.187699  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1524  histidine triad (HIT) protein  28.57 
 
 		 166 aa  49.3  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3993  type III restriction protein res subunit  51.06 
 
 		 1348 aa  48.1  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0746  histidine triad (HIT) protein  30 
 
 		 145 aa  48.1  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00337572 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4837  histidine triad (HIT) protein  36.76 
 
 		 140 aa  48.1  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0161096  normal  0.332557 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2169  histidine triad (HIT) protein  35.16 
 
 		 140 aa  48.1  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1499  histidine triad (HIT) protein  32.35 
 
 		 301 aa  47.8  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.348624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3753  histidine triad (HIT) protein  37.88 
 
 		 145 aa  48.1  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0074  histidine triad (HIT) protein  35.53 
 
 		 180 aa  47.8  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4689  histidine triad (HIT) protein  35.29 
 
 		 142 aa  47.8  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0956525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0006  histidine triad (HIT) protein  37.14 
 
 		 142 aa  47.8  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0070148  unclonable  0.000000000279381 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4320  histidine triad (HIT) protein  35.29 
 
 		 142 aa  47.8  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0862778  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0075  histidine triad (HIT) protein  46 
 
 		 143 aa  47.4  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2290  histidine triad (HIT) protein  34.72 
 
 		 244 aa  47.4  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.358271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2282  histidine triad (HIT) protein  34.72 
 
 		 244 aa  47.4  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.983913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2243  histidine triad (HIT) protein  34.72 
 
 		 220 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.118301  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0010  histidine triad (HIT) protein  36.11 
 
 		 169 aa  46.6  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0387329  normal  0.117285 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1333  histidine triad (HIT) protein  30.36 
 
 		 130 aa  47  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0568524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1462  histidine triad (HIT) protein  29.09 
 
 		 162 aa  45.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1504  HIT (HINT, histidine triad) family protein  30.56 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000163027  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2290  histidine triad (HIT) protein  30.77 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1168  HIT family protein  31.65 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.247304  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0004  histidine triad (HIT) protein  34.07 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0275782 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1342  histidine triad (HIT) protein  29.46 
 
 		 130 aa  45.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1871  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 		 172 aa  45.4  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0811806  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2559  histidine triad (HIT) protein  34.72 
 
 		 182 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1125  HIT family protein  31.65 
 
 		 140 aa  45.4  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.20711  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0075  histidine triad (HIT) protein  35.71 
 
 		 138 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  0.167835 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12632  hypothetical protein  34.72 
 
 		 195 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0100073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3837  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 182 aa  44.7  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.868089  normal  0.143653 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0620  histidine triad (HIT) protein  29.46 
 
 		 130 aa  44.7  0.0006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.693859  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1050  histidine triad (HIT) protein  34.29 
 
 		 139 aa  44.7  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.265499  normal  0.307581 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0211  histidine triad (HIT) protein  32.91 
 
 		 145 aa  44.3  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1357  histidine triad (HIT) protein  35.21 
 
 		 250 aa  44.3  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.474283 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2944  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 179 aa  44.3  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.173088  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1376  histidine triad (HIT) protein  28.45 
 
 		 145 aa  44.3  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2848  histidine triad (HIT) protein  38.03 
 
 		 136 aa  44.3  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1228  histidine triad (HIT) protein  34.72 
 
 		 163 aa  44.3  0.0008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2024  histidine triad (HIT) protein  30.38 
 
 		 140 aa  44.3  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1373  HIT family protein  25.81 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00295303  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2451  histidine triad (HIT) protein  30.1 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.94056  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2926  histidine triad (HIT) protein  27.83 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1342  histidine triad (HIT) protein  30.95 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0562  histidine triad (HIT) protein  30 
 
 		 167 aa  43.1  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>