More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1659 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1659  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 		 125 aa  261  2e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.490499  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0142  histidine triad (HIT) protein  72.81 
 
 		 130 aa  176  8e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1000  hypothetical protein  57.98 
 
 		 122 aa  149  8.999999999999999e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0651  histidine triad (HIT) protein  59.48 
 
 		 120 aa  144  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0007662  unclonable  0.000000000136009 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04560  histidine triad (HIT) protein  55.65 
 
 		 122 aa  143  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1435  histidine triad (HIT) protein  55.17 
 
 		 126 aa  136  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1576  putative hydrolase  49.15 
 
 		 182 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.031095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0365  histidine triad (HIT) protein  50.43 
 
 		 121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.5377  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1209  histidine triad (HIT) protein  50.85 
 
 		 131 aa  123  7e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.818472  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4872  histidine triad (HIT) protein  52.54 
 
 		 133 aa  123  9e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1004  histidine triad (HIT) protein  47.06 
 
 		 125 aa  121  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0929  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  46.9 
 
 		 126 aa  120  4e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.685079  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3984  type III restriction protein res subunit  47.79 
 
 		 1418 aa  116  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2227  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  46.96 
 
 		 122 aa  115  1.9999999999999998e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0450  hypothetical protein  46.9 
 
 		 124 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  44.63 
 
 		 1077 aa  111  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07720  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  50.46 
 
 		 131 aa  110  5e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4565  histidine triad (HIT) protein  44.92 
 
 		 130 aa  110  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0432  histidine triad (HIT) protein  44.83 
 
 		 149 aa  107  4.0000000000000004e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1488  histidine triad (HIT) protein  54.02 
 
 		 109 aa  103  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000559646  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0296  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  47.54 
 
 		 127 aa  101  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1483  hypothetical protein  45.37 
 
 		 142 aa  101  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0398  histidine triad (HIT) protein  40.52 
 
 		 284 aa  100  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4049  histidine triad (HIT) protein  40.35 
 
 		 289 aa  100  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4113  histidine triad (HIT) protein  38.79 
 
 		 289 aa  93.6  8e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.489073 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2944  histidine triad (HIT) protein  39.64 
 
 		 179 aa  88.2  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.173088  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1420  histidine triad (HIT) protein  35 
 
 		 179 aa  88.6  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0920  histidine triad (HIT) protein  34.42 
 
 		 174 aa  87  7e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.675581  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0010  histidine triad (HIT) protein  39.02 
 
 		 169 aa  86.7  9e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0387329  normal  0.117285 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1553  histidine triad (HIT) protein  37.61 
 
 		 177 aa  86.7  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.906837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0074  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 		 180 aa  84.7  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2598  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 169 aa  83.2  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0551  histidine triad (HIT) protein  38.74 
 
 		 181 aa  81.6  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2145  histidine triad (HIT) protein  37.74 
 
 		 146 aa  79.3  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1657  histidine triad (HIT) protein  34.11 
 
 		 190 aa  80.1  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.411198  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0562  histidine triad (HIT) protein  35.14 
 
 		 167 aa  79.7  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1740  histidine triad protein  31.15 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3993  type III restriction protein res subunit  47.5 
 
 		 1348 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1497  histidine triad (HIT) protein  33.58 
 
 		 163 aa  79.3  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0842593  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1357  histidine triad (HIT) protein  35.11 
 
 		 250 aa  79.3  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.474283 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0648  histidine triad (HIT) protein  34.62 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0077  histidine triad (HIT) protein  39.32 
 
 		 138 aa  78.6  0.00000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2890  histidine triad (HIT) protein  32.11 
 
 		 139 aa  77.4  0.00000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2290  histidine triad (HIT) protein  39.64 
 
 		 164 aa  77.8  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0845631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1658  histidine triad (HIT) protein  34.96 
 
 		 164 aa  77.4  0.00000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1973  HIT family protein  39.09 
 
 		 166 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000182824  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0187  histidine triad (HIT) protein  37.84 
 
 		 164 aa  77.4  0.00000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.414611  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1615  HIT domain-containing protein  34.43 
 
 		 163 aa  77  0.00000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1228  histidine triad (HIT) protein  30.63 
 
 		 163 aa  77  0.00000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1342  histidine triad (HIT) protein  36.36 
 
 		 163 aa  77  0.00000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.187699  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2433  histidine triad (HIT) protein  36.04 
 
 		 165 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106121  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0075  histidine triad (HIT) protein  34.43 
 
 		 143 aa  76.6  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13910  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  37.84 
 
 		 187 aa  75.5  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0128023  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1524  histidine triad (HIT) protein  35.45 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1504  HIT (HINT, histidine triad) family protein  31.53 
 
 		 165 aa  75.5  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000163027  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3837  histidine triad (HIT) protein  36.46 
 
 		 182 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.868089  normal  0.143653 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2372  histidine triad (HIT) protein  33.85 
 
 		 174 aa  75.5  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2559  histidine triad (HIT) protein  37.5 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2074  histidine triad (HIT) protein  30.63 
 
 		 165 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165381  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2345  histidine triad (HIT) protein  35.14 
 
 		 165 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1522  histidine triad (HIT) protein  34.23 
 
 		 165 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.311815  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3726  histidine triad (HIT) protein  33.96 
 
 		 138 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1531  histidine triad (HIT) protein  33.96 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2064  histidine triad (HIT) protein  41 
 
 		 164 aa  74.3  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.225025 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1784  histidine triad (HIT) protein  35.45 
 
 		 190 aa  74.3  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.238238  normal  0.0568731 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1980  histidine triad (HIT) protein  33.85 
 
 		 189 aa  74.3  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000948071 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1361  histidine triad (HIT) protein  32.12 
 
 		 163 aa  74.3  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.149111  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2525  histidine triad (HIT) protein  37.96 
 
 		 181 aa  73.9  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.271713  normal  0.184582 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2243  histidine triad (HIT) protein  34.19 
 
 		 220 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.118301  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2282  histidine triad (HIT) protein  34.19 
 
 		 244 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.983913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2290  histidine triad (HIT) protein  34.19 
 
 		 244 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.358271  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1225  histidine triad (HIT) protein  34.86 
 
 		 171 aa  73.2  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1701  HIT family protein  30.63 
 
 		 162 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.652784  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1360  histidine triad (HIT) protein  32.31 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.529345 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0743  histidine triad (HIT) protein  33.03 
 
 		 168 aa  72.8  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000120261  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1434  histidine triad (HIT) protein  38.18 
 
 		 174 aa  72.8  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.186815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3642  histidine triad (HIT) protein  35.85 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0807517  normal  0.0488836 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0004  histidine triad (HIT) protein  35.85 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0275782 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1638  histidine triad (HIT) protein  30.63 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000357011  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2958  histidine triad (HIT) protein  34.26 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0357  histidine triad (HIT) protein  35.45 
 
 		 298 aa  72  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0469904 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4476  putative histidine triad (HIT) protein  37.23 
 
 		 141 aa  72  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000626279 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1325  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0365255  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1387  histidine triad (HIT) protein  34.23 
 
 		 171 aa  72  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.026049  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12632  hypothetical protein  35.42 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0100073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0449  diadenosine tetraphosphate hydrolase  32.82 
 
 		 194 aa  72  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1376  histidine triad (HIT) protein  34.29 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.341423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2098  histidine triad (HIT) protein  32.31 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00118589  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1878  histidine triad (HIT) protein  36.11 
 
 		 172 aa  72  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3187  histidine triad (HIT) protein  31.54 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3968  histidine triad (HIT) protein  36.17 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2090  histidine triad (HIT) protein  31.01 
 
 		 182 aa  70.9  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746736  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2454  histidine triad (HIT) protein  34.91 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.832288  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0620  histidine triad (HIT) protein  29.46 
 
 		 163 aa  70.1  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00610052  hitchhiker  0.000000200539 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3108  histidine triad (HIT) protein  34.91 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4014  histidine triad (HIT) protein  37.36 
 
 		 137 aa  70.1  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1050  histidine triad (HIT) protein  33.61 
 
 		 139 aa  70.1  0.000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.265499  normal  0.307581 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2105  hypothetical protein  34.35 
 
 		 185 aa  69.7  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10680  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  35.19 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000753626  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2400  histidine triad (HIT) protein  31.54 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  hitchhiker  0.0085284 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>