More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2400 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2400  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 
183 aa  376  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  hitchhiker  0.0085284 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2098  histidine triad (HIT) protein  68.97 
 
 
206 aa  261  4.999999999999999e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00118589  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1784  histidine triad (HIT) protein  65.19 
 
 
190 aa  250  1e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.238238  normal  0.0568731 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3187  histidine triad (HIT) protein  70.12 
 
 
192 aa  247  8e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2077  histidine triad (HIT) protein  66.67 
 
 
181 aa  245  2e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2335  histidine triad (HIT) protein  67.63 
 
 
192 aa  245  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733694  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13910  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  67.46 
 
 
187 aa  244  4e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0128023  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6130  histidine triad (HIT) protein  65.57 
 
 
187 aa  243  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0700761  normal  0.347518 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1357  histidine triad (HIT) protein  62.79 
 
 
250 aa  240  7.999999999999999e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.474283 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1784  histidine triad (HIT) protein  69.59 
 
 
182 aa  237  8e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.686669  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1771  histidine triad (HIT) protein  70.83 
 
 
182 aa  236  9e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00317268  normal  0.0187767 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1980  histidine triad (HIT) protein  64.53 
 
 
189 aa  236  1e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000948071 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17420  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  67.46 
 
 
192 aa  234  5.0000000000000005e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.657455  normal  0.0943717 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2090  histidine triad (HIT) protein  63.19 
 
 
182 aa  233  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746736  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14920  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  65.71 
 
 
188 aa  231  6e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2105  hypothetical protein  67.07 
 
 
185 aa  229  2e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1360  histidine triad (HIT) protein  59.09 
 
 
192 aa  226  2e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.529345 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15420  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  60 
 
 
187 aa  225  3e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0547976  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0818  histidine triad (HIT) protein  64.33 
 
 
191 aa  224  4e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  0.0395405 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5156  histidine triad (HIT) protein  60.34 
 
 
229 aa  224  6e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00760567  hitchhiker  0.000469823 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2042  histidine triad (HIT) protein  59.17 
 
 
195 aa  216  2e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000192809 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1657  histidine triad (HIT) protein  58.93 
 
 
190 aa  213  9.999999999999999e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.411198  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3441  histidine triad (HIT) protein  64.16 
 
 
182 aa  212  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000440827  hitchhiker  0.0000328621 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2282  histidine triad (HIT) protein  54.91 
 
 
244 aa  211  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.983913  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2243  histidine triad (HIT) protein  54.91 
 
 
220 aa  211  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.118301  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2290  histidine triad (HIT) protein  54.91 
 
 
244 aa  211  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.358271  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3065  histidine triad (HIT) protein  61.54 
 
 
184 aa  207  9e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.236002  normal  0.385258 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0449  diadenosine tetraphosphate hydrolase  56.63 
 
 
194 aa  206  2e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2316  histidine triad (HIT) protein  59.3 
 
 
200 aa  205  4e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00279696  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2559  histidine triad (HIT) protein  55.56 
 
 
182 aa  204  7e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12632  hypothetical protein  56 
 
 
195 aa  202  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0100073  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3837  histidine triad (HIT) protein  54.34 
 
 
182 aa  198  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.868089  normal  0.143653 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2288  histidine triad (HIT) protein  49.74 
 
 
193 aa  196  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.274965  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1377  histidine triad (HIT) protein  54.14 
 
 
184 aa  194  6e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0235527  normal  0.0272856 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10680  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  56.98 
 
 
226 aa  192  3e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000753626  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2372  histidine triad (HIT) protein  55.09 
 
 
174 aa  191  7e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1920  histidine triad (HIT) protein  49.7 
 
 
182 aa  176  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.629691  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1524  histidine triad (HIT) protein  47.37 
 
 
166 aa  162  4.0000000000000004e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2880  histidine triad (HIT) protein  50.31 
 
 
170 aa  161  5.0000000000000005e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00137934  normal  0.021176 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0010  histidine triad (HIT) protein  48.77 
 
 
169 aa  158  4e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0387329  normal  0.117285 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1225  histidine triad (HIT) protein  46.91 
 
 
171 aa  156  2e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1387  histidine triad (HIT) protein  45.06 
 
 
171 aa  153  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.026049  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0620  histidine triad (HIT) protein  48.03 
 
 
163 aa  152  4e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00610052  hitchhiker  0.000000200539 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0562  histidine triad (HIT) protein  45.34 
 
 
167 aa  152  4e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1191  histidine triad (HIT) protein  43.95 
 
 
162 aa  151  5.9999999999999996e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00599383  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0187  histidine triad (HIT) protein  45.45 
 
 
164 aa  149  3e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.414611  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1504  HIT (HINT, histidine triad) family protein  41.92 
 
 
165 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000163027  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1725  histidine triad (HIT) protein  45.12 
 
 
161 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1228  histidine triad (HIT) protein  48.48 
 
 
163 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2520  histidine triad (HIT) protein  49.7 
 
 
169 aa  144  5e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0779132  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2713  histidine triad (HIT) protein  42.59 
 
 
162 aa  144  7.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.256067  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2074  histidine triad (HIT) protein  42.86 
 
 
165 aa  143  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165381  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1658  histidine triad (HIT) protein  44.44 
 
 
164 aa  142  4e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1701  HIT family protein  44.44 
 
 
162 aa  141  5e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.652784  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1932  histidine triad (HIT) protein  43.2 
 
 
178 aa  141  6e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.106566  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2345  histidine triad (HIT) protein  45.18 
 
 
165 aa  140  8e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2944  histidine triad (HIT) protein  43.71 
 
 
179 aa  140  8e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.173088  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2126  histidine triad (HIT) protein  45.22 
 
 
166 aa  140  8e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000712705 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2433  histidine triad (HIT) protein  45.18 
 
 
165 aa  140  9e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106121  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1638  histidine triad (HIT) protein  44.1 
 
 
162 aa  137  7e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000357011  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2290  histidine triad (HIT) protein  46.41 
 
 
164 aa  137  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0845631  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1522  histidine triad (HIT) protein  44.79 
 
 
165 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.311815  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1183  histidine triad (HIT) protein  43.87 
 
 
184 aa  137  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.970277  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1434  histidine triad (HIT) protein  43.21 
 
 
174 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.186815  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4660  histidine triad (HIT) protein  39.02 
 
 
160 aa  135  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.374952  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2598  histidine triad (HIT) protein  42.07 
 
 
169 aa  134  5e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0551  histidine triad (HIT) protein  42.86 
 
 
181 aa  134  5e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0839  histidine triad (HIT) protein  38.79 
 
 
172 aa  134  5e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0818988  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1342  histidine triad (HIT) protein  42.94 
 
 
163 aa  134  7.000000000000001e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.187699  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1973  HIT family protein  43.67 
 
 
166 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000182824  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1615  HIT domain-containing protein  42.86 
 
 
163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1361  histidine triad (HIT) protein  42.51 
 
 
163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.149111  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0837  histidine triad (HIT) protein  40.27 
 
 
173 aa  133  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1462  histidine triad (HIT) protein  40.48 
 
 
162 aa  132  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0743  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 
168 aa  132  3.9999999999999996e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000120261  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0357  histidine triad (HIT) protein  43.04 
 
 
298 aa  131  5e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0469904 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0956  histidine triad (HIT) protein  37.58 
 
 
172 aa  131  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.630864  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0735  Hit family protein  40.94 
 
 
172 aa  131  6.999999999999999e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.176537  normal  0.820671 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1878  histidine triad (HIT) protein  36.75 
 
 
172 aa  130  7.999999999999999e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1497  histidine triad (HIT) protein  41.07 
 
 
163 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0842593  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1871  histidine triad (HIT) protein  43.71 
 
 
172 aa  129  3e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0811806  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1612  histidine triad (HIT) protein  38.16 
 
 
173 aa  128  5.0000000000000004e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2958  histidine triad (HIT) protein  42.5 
 
 
160 aa  125  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1325  histidine triad (HIT) protein  42.5 
 
 
160 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0365255  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0629  Hit family protein  41.35 
 
 
160 aa  125  5e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2525  histidine triad (HIT) protein  43.23 
 
 
181 aa  123  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.271713  normal  0.184582 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0074  histidine triad (HIT) protein  36.31 
 
 
180 aa  120  9.999999999999999e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1324  Hit family protein  39.44 
 
 
165 aa  118  6e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1511  histidine triad (HIT) protein  40.62 
 
 
189 aa  117  7.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0648  histidine triad (HIT) protein  42.51 
 
 
163 aa  115  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2053  histidine triad (HIT) protein  35.93 
 
 
183 aa  114  5e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.109814 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1553  histidine triad (HIT) protein  38.22 
 
 
177 aa  115  5e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.906837  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0641  Hit family protein  38.67 
 
 
168 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.7817  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0927  HIT family hydrolase  34.94 
 
 
162 aa  112  3e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0925  histidine triad (HIT) protein  38.36 
 
 
152 aa  108  3e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.220033 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1435  Hit family protein  35 
 
 
161 aa  108  6e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0607  Hit family protein  35 
 
 
161 aa  107  6e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0520  Hit family protein  35 
 
 
161 aa  107  8.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0143  histidine triad domain-containing protein  36 
 
 
161 aa  107  1e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1203  histidine triad (HIT) protein  38.78 
 
 
164 aa  105  5e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.34898  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>