More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1980 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1980  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 
189 aa  390  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000948071 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1784  histidine triad (HIT) protein  71.67 
 
 
190 aa  267  5.9999999999999995e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.238238  normal  0.0568731 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13910  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  69.89 
 
 
187 aa  259  1e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0128023  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17420  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  73.56 
 
 
192 aa  253  1.0000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.657455  normal  0.0943717 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1657  histidine triad (HIT) protein  69.09 
 
 
190 aa  246  1e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.411198  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2335  histidine triad (HIT) protein  69.23 
 
 
192 aa  244  4e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733694  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2042  histidine triad (HIT) protein  63.64 
 
 
195 aa  239  2e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000192809 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2400  histidine triad (HIT) protein  64.53 
 
 
183 aa  236  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  hitchhiker  0.0085284 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2316  histidine triad (HIT) protein  67.44 
 
 
200 aa  229  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00279696  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2098  histidine triad (HIT) protein  62.72 
 
 
206 aa  228  3e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00118589  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3065  histidine triad (HIT) protein  64.04 
 
 
184 aa  220  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.236002  normal  0.385258 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1771  histidine triad (HIT) protein  64.97 
 
 
182 aa  218  3.9999999999999997e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00317268  normal  0.0187767 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1360  histidine triad (HIT) protein  58.76 
 
 
192 aa  218  5e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.529345 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3187  histidine triad (HIT) protein  65 
 
 
192 aa  217  7e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14920  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  65.48 
 
 
188 aa  216  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15420  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  60.34 
 
 
187 aa  216  2e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0547976  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2077  histidine triad (HIT) protein  64.71 
 
 
181 aa  216  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1784  histidine triad (HIT) protein  67.66 
 
 
182 aa  216  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.686669  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2282  histidine triad (HIT) protein  56.98 
 
 
244 aa  214  8e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.983913  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2290  histidine triad (HIT) protein  56.98 
 
 
244 aa  214  8e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.358271  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2243  histidine triad (HIT) protein  56.98 
 
 
220 aa  213  9e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.118301  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6130  histidine triad (HIT) protein  64.12 
 
 
187 aa  213  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0700761  normal  0.347518 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1377  histidine triad (HIT) protein  59.77 
 
 
184 aa  213  1.9999999999999998e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0235527  normal  0.0272856 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5156  histidine triad (HIT) protein  60.48 
 
 
229 aa  212  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00760567  hitchhiker  0.000469823 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0449  diadenosine tetraphosphate hydrolase  53.93 
 
 
194 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2090  histidine triad (HIT) protein  62.2 
 
 
182 aa  210  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746736  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2105  hypothetical protein  61.54 
 
 
185 aa  209  3e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2559  histidine triad (HIT) protein  58.33 
 
 
182 aa  207  8e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1357  histidine triad (HIT) protein  56.9 
 
 
250 aa  206  2e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.474283 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0818  histidine triad (HIT) protein  57.63 
 
 
191 aa  204  5e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  0.0395405 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3837  histidine triad (HIT) protein  56.55 
 
 
182 aa  201  4e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.868089  normal  0.143653 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10680  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  60.8 
 
 
226 aa  199  9.999999999999999e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000753626  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2288  histidine triad (HIT) protein  52.25 
 
 
193 aa  194  4.0000000000000005e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.274965  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12632  hypothetical protein  53.8 
 
 
195 aa  194  7e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0100073  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3441  histidine triad (HIT) protein  60.82 
 
 
182 aa  192  3e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000440827  hitchhiker  0.0000328621 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2372  histidine triad (HIT) protein  57.5 
 
 
174 aa  191  7e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1920  histidine triad (HIT) protein  51.16 
 
 
182 aa  185  3e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.629691  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1524  histidine triad (HIT) protein  44.05 
 
 
166 aa  165  2.9999999999999998e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0010  histidine triad (HIT) protein  49.68 
 
 
169 aa  165  2.9999999999999998e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0387329  normal  0.117285 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2880  histidine triad (HIT) protein  50.96 
 
 
170 aa  164  6.9999999999999995e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00137934  normal  0.021176 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1725  histidine triad (HIT) protein  47.17 
 
 
161 aa  158  5e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1225  histidine triad (HIT) protein  44.23 
 
 
171 aa  154  5.0000000000000005e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1504  HIT (HINT, histidine triad) family protein  46.01 
 
 
165 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000163027  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0562  histidine triad (HIT) protein  44.87 
 
 
167 aa  149  2e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0620  histidine triad (HIT) protein  41.28 
 
 
163 aa  149  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00610052  hitchhiker  0.000000200539 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1932  histidine triad (HIT) protein  43.56 
 
 
178 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.106566  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1191  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 
162 aa  145  3e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00599383  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1658  histidine triad (HIT) protein  41.67 
 
 
164 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1878  histidine triad (HIT) protein  38.15 
 
 
172 aa  144  6e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0187  histidine triad (HIT) protein  42.59 
 
 
164 aa  142  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.414611  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1387  histidine triad (HIT) protein  38.51 
 
 
171 aa  142  4e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.026049  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0839  histidine triad (HIT) protein  38.27 
 
 
172 aa  141  6e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0818988  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1183  histidine triad (HIT) protein  45.75 
 
 
184 aa  140  9e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.970277  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1342  histidine triad (HIT) protein  45.75 
 
 
163 aa  139  3e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.187699  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2713  histidine triad (HIT) protein  40.38 
 
 
162 aa  139  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.256067  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2520  histidine triad (HIT) protein  42.94 
 
 
169 aa  138  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0779132  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0357  histidine triad (HIT) protein  45.75 
 
 
298 aa  138  6e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0469904 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1434  histidine triad (HIT) protein  44.59 
 
 
174 aa  137  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.186815  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4660  histidine triad (HIT) protein  39.87 
 
 
160 aa  137  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.374952  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2525  histidine triad (HIT) protein  47.71 
 
 
181 aa  135  4e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.271713  normal  0.184582 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1973  HIT family protein  43.79 
 
 
166 aa  135  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000182824  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0956  histidine triad (HIT) protein  35.88 
 
 
172 aa  135  5e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.630864  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1228  histidine triad (HIT) protein  44.51 
 
 
163 aa  134  6.0000000000000005e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2126  histidine triad (HIT) protein  40.59 
 
 
166 aa  134  6.0000000000000005e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000712705 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2598  histidine triad (HIT) protein  43.03 
 
 
169 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0837  histidine triad (HIT) protein  36.99 
 
 
173 aa  133  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1462  histidine triad (HIT) protein  42.41 
 
 
162 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2433  histidine triad (HIT) protein  46.2 
 
 
165 aa  132  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106121  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1871  histidine triad (HIT) protein  43.4 
 
 
172 aa  132  3.9999999999999996e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0811806  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2944  histidine triad (HIT) protein  39.88 
 
 
179 aa  132  3.9999999999999996e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.173088  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2345  histidine triad (HIT) protein  45.57 
 
 
165 aa  131  6e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0735  Hit family protein  39.19 
 
 
172 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.176537  normal  0.820671 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1497  histidine triad (HIT) protein  43.75 
 
 
163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0842593  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1615  HIT domain-containing protein  43.75 
 
 
163 aa  129  3e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2290  histidine triad (HIT) protein  44.3 
 
 
164 aa  129  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0845631  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1522  histidine triad (HIT) protein  44.3 
 
 
165 aa  129  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.311815  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2074  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 
165 aa  128  6e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165381  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0629  Hit family protein  37.76 
 
 
160 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1361  histidine triad (HIT) protein  44.44 
 
 
163 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.149111  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1553  histidine triad (HIT) protein  40.83 
 
 
177 aa  126  2.0000000000000002e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.906837  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0743  histidine triad (HIT) protein  38.51 
 
 
168 aa  125  3e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000120261  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0551  histidine triad (HIT) protein  38.04 
 
 
181 aa  125  4.0000000000000003e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1701  HIT family protein  40.72 
 
 
162 aa  124  6e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.652784  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1612  histidine triad (HIT) protein  37.41 
 
 
173 aa  122  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1638  histidine triad (HIT) protein  41.88 
 
 
162 aa  121  6e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000357011  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0074  histidine triad (HIT) protein  37.5 
 
 
180 aa  117  7.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0927  HIT family hydrolase  33.54 
 
 
162 aa  117  9.999999999999999e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1325  histidine triad (HIT) protein  42.58 
 
 
160 aa  115  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0365255  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2958  histidine triad (HIT) protein  41.94 
 
 
160 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2053  histidine triad (HIT) protein  41.4 
 
 
183 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.109814 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1511  histidine triad (HIT) protein  38.46 
 
 
189 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1324  Hit family protein  37.88 
 
 
165 aa  109  2.0000000000000002e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0648  histidine triad (HIT) protein  40.51 
 
 
163 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0143  histidine triad domain-containing protein  35.71 
 
 
161 aa  108  6e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0520  Hit family protein  32.32 
 
 
161 aa  107  1e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0607  Hit family protein  32.32 
 
 
161 aa  106  2e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0641  Hit family protein  34.72 
 
 
168 aa  105  3e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.7817  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1435  Hit family protein  31.71 
 
 
161 aa  105  4e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1203  histidine triad (HIT) protein  35.86 
 
 
164 aa  102  3e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.34898  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1305  histidine triad (HIT) protein  30.72 
 
 
163 aa  97.8  9e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>