More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0920 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0920  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 		 174 aa  355  9.999999999999999e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.675581  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1420  histidine triad (HIT) protein  77.71 
 
 		 179 aa  281  3.0000000000000004e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1209  histidine triad (HIT) protein  38.79 
 
 		 131 aa  107  6e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.818472  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4872  histidine triad (HIT) protein  36.54 
 
 		 133 aa  101  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1435  histidine triad (HIT) protein  37.34 
 
 		 126 aa  99.8  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1576  putative hydrolase  35.5 
 
 		 182 aa  99.8  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.031095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04560  histidine triad (HIT) protein  32.48 
 
 		 122 aa  92.8  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1004  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 125 aa  91.3  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1483  hypothetical protein  38.89 
 
 		 142 aa  90.1  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1000  hypothetical protein  33.54 
 
 		 122 aa  89.4  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2227  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  33.76 
 
 		 122 aa  89.7  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4565  histidine triad (HIT) protein  32.73 
 
 		 130 aa  87.4  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1659  histidine triad (HIT) protein  34.42 
 
 		 125 aa  87  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.490499  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0077  histidine triad (HIT) protein  35.85 
 
 		 138 aa  85.5  3e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0651  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 120 aa  85.1  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0007662  unclonable  0.000000000136009 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  33.57 
 
 		 1077 aa  84.7  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0450  hypothetical protein  33.76 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0142  histidine triad (HIT) protein  38.56 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0398  histidine triad (HIT) protein  30.72 
 
 		 284 aa  81.3  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0296  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  33.33 
 
 		 127 aa  79.3  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0365  histidine triad (HIT) protein  32.26 
 
 		 121 aa  77  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.5377  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07720  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  35.88 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4049  histidine triad (HIT) protein  28.75 
 
 		 289 aa  73.2  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0432  histidine triad (HIT) protein  31.37 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3984  type III restriction protein res subunit  33.33 
 
 		 1418 aa  71.2  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3993  type III restriction protein res subunit  52.63 
 
 		 1348 aa  68.6  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3726  histidine triad (HIT) protein  27.66 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0929  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  27.81 
 
 		 126 aa  67  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.685079  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1488  histidine triad (HIT) protein  30.95 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000559646  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2542  histidine triad (HIT) protein  29.79 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1749  histidine triad (HIT) protein  29.56 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0327  histidine triad (HIT) protein  27.86 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0007671  normal  0.0222978 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1740  histidine triad protein  26.19 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4113  histidine triad (HIT) protein  23.23 
 
 		 289 aa  61.2  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.489073 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0010  histidine triad (HIT) protein  26.85 
 
 		 169 aa  60.5  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0387329  normal  0.117285 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2145  histidine triad (HIT) protein  27.4 
 
 		 146 aa  60.8  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538577  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0711  histidine triad (HIT) protein  27.66 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0363676  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1524  histidine triad (HIT) protein  29.08 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0075  histidine triad (HIT) protein  28.12 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2944  histidine triad (HIT) protein  29.53 
 
 		 179 aa  57.8  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.173088  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0074  histidine triad (HIT) protein  31.54 
 
 		 180 aa  57.8  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0370  HIT family protein  26.17 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1980  histidine triad (HIT) protein  31.29 
 
 		 189 aa  57  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000948071 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11288  HIT family protein  30.22 
 
 		 144 aa  57  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.750453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0551  histidine triad (HIT) protein  30 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3954  histidine triad (HIT) protein  31.25 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1050  histidine triad (HIT) protein  26.54 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.265499  normal  0.307581 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0620  histidine triad (HIT) protein  25.9 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.693859  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4028  histidine triad (HIT) protein  31.25 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1225  histidine triad (HIT) protein  28.67 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1638  histidine triad (HIT) protein  26.9 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000357011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3968  histidine triad (HIT) protein  31.25 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.777319  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1993  histidine triad (HIT) protein  27.86 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0455  HIT domain-containing protein  36.47 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.378719  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1263  histidine triad (HIT) protein  29.29 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000437908  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_397  HIT domain protein  28.46 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.647527  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0978  HIT family protein  28.06 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0644  histidine triad (HIT) protein  29.29 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2433  histidine triad (HIT) protein  31.13 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106121  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1047  HIT family protein  28.06 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1333  histidine triad (HIT) protein  24.46 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0568524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2237  histidine triad (HIT) protein  26.95 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1083  HIT family protein  28.06 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4221  HIT family protein  28.06 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.071329  normal  0.0179678 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1342  histidine triad (HIT) protein  24.46 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1151  HIT family protein  28.06 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0966  HIT family protein  28.06 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0957  HIT family protein  28.06 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3349  histidine triad (HIT) protein  30.71 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425203 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1124  HIT family protein  28.06 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1212  HIT family protein  28.06 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3642  histidine triad (HIT) protein  27.86 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0807517  normal  0.0488836 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0432  histidine triad (HIT) protein  36.47 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0312734  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0096  histidine triad (HIT) protein  26.92 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3185  histidine triad (HIT) protein  30 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6595  histidine triad (HIT) protein  28.57 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1725  histidine triad (HIT) protein  28.74 
 
 		 161 aa  53.9  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1342  histidine triad (HIT) protein  22.3 
 
 		 130 aa  53.5  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1499  histidine triad (HIT) protein  29.05 
 
 		 301 aa  53.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.348624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0596  histidine triad (HIT) protein  23.24 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0962  histidine triad (HIT) protein  28.06 
 
 		 144 aa  53.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0004  histidine triad (HIT) protein  27.46 
 
 		 149 aa  53.1  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0275782 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2880  histidine triad (HIT) protein  26.25 
 
 		 170 aa  52.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00137934  normal  0.021176 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1614  histidine triad (HIT) protein  27.66 
 
 		 139 aa  53.1  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3451  histidine triad (HIT) protein  24.83 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.923698  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0814  histidine triad (HIT) protein  28.87 
 
 		 144 aa  53.1  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1076  histidine triad (HIT) protein  36.47 
 
 		 114 aa  53.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1461  histidine triad (HIT) protein  28.37 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2042  histidine triad (HIT) protein  27.78 
 
 		 195 aa  52.4  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000192809 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0472  histidine triad (HIT) protein  29.47 
 
 		 112 aa  52.4  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0254  histidine triad (HIT) protein  27.59 
 
 		 145 aa  52.4  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6201  histidine triad (HIT) protein  25.71 
 
 		 141 aa  52.4  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.488321  normal  0.398749 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1504  HIT (HINT, histidine triad) family protein  23.81 
 
 		 165 aa  52.4  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000163027  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2345  histidine triad (HIT) protein  29.8 
 
 		 165 aa  52.8  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2525  histidine triad (HIT) protein  30.95 
 
 		 181 aa  52.4  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.271713  normal  0.184582 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1573  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  23.57 
 
 		 139 aa  52.4  0.000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1369  histidine triad (HIT) protein  29.85 
 
 		 114 aa  52.4  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10458  predicted protein  32.06 
 
 		 171 aa  52  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.013689  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1531  histidine triad (HIT) protein  26.43 
 
 		 136 aa  52.4  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0562  histidine triad (HIT) protein  25.15 
 
 		 167 aa  52  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>