More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0365 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0365  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 
121 aa  248  2e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.5377  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1435  histidine triad (HIT) protein  58.97 
 
 
126 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04560  histidine triad (HIT) protein  56.3 
 
 
122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1000  hypothetical protein  55.56 
 
 
122 aa  139  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0651  histidine triad (HIT) protein  52.1 
 
 
120 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0007662  unclonable  0.000000000136009 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0432  histidine triad (HIT) protein  51.72 
 
 
149 aa  127  4.0000000000000003e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1659  histidine triad (HIT) protein  50.43 
 
 
125 aa  125  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.490499  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1576  putative hydrolase  50 
 
 
182 aa  124  3e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.031095  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0450  hypothetical protein  50.41 
 
 
124 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1209  histidine triad (HIT) protein  52.5 
 
 
131 aa  122  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.818472  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0142  histidine triad (HIT) protein  49.15 
 
 
130 aa  122  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2227  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  51.28 
 
 
122 aa  122  2e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4872  histidine triad (HIT) protein  53.39 
 
 
133 aa  121  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1004  histidine triad (HIT) protein  49.15 
 
 
125 aa  117  7e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  44.44 
 
 
1077 aa  115  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0929  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  49.12 
 
 
126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.685079  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4565  histidine triad (HIT) protein  48.31 
 
 
130 aa  113  6.9999999999999995e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0296  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  48.76 
 
 
127 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0398  histidine triad (HIT) protein  43.1 
 
 
284 aa  108  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07720  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  46.85 
 
 
131 aa  107  7.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3984  type III restriction protein res subunit  45.28 
 
 
1418 aa  100  7e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1488  histidine triad (HIT) protein  57.3 
 
 
109 aa  99.8  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000559646  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4049  histidine triad (HIT) protein  40.68 
 
 
289 aa  97.4  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318812  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1483  hypothetical protein  42.61 
 
 
142 aa  97.1  8e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1657  histidine triad (HIT) protein  39.45 
 
 
190 aa  92.8  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.411198  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4113  histidine triad (HIT) protein  36.21 
 
 
289 aa  92.4  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.489073 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1980  histidine triad (HIT) protein  42.2 
 
 
189 aa  90.1  9e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000948071 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0077  histidine triad (HIT) protein  40.8 
 
 
138 aa  87.8  4e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3993  type III restriction protein res subunit  64.29 
 
 
1348 aa  80.5  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1342  histidine triad (HIT) protein  36.7 
 
 
163 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.187699  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2944  histidine triad (HIT) protein  38.74 
 
 
179 aa  79.7  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.173088  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12632  hypothetical protein  35.58 
 
 
195 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0100073  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1740  histidine triad protein  34.92 
 
 
139 aa  79  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0187  histidine triad (HIT) protein  37.84 
 
 
164 aa  78.6  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.414611  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1462  histidine triad (HIT) protein  35.78 
 
 
162 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2090  histidine triad (HIT) protein  36.7 
 
 
182 aa  78.6  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746736  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1658  histidine triad (HIT) protein  34.23 
 
 
164 aa  77.8  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1531  histidine triad (HIT) protein  38.18 
 
 
136 aa  77.8  0.00000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3837  histidine triad (HIT) protein  33.65 
 
 
182 aa  77.4  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.868089  normal  0.143653 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2243  histidine triad (HIT) protein  34.62 
 
 
220 aa  77  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.118301  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0449  diadenosine tetraphosphate hydrolase  37.27 
 
 
194 aa  77  0.00000000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0920  histidine triad (HIT) protein  32.26 
 
 
174 aa  77  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.675581  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4014  histidine triad (HIT) protein  41.76 
 
 
137 aa  76.6  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0562  histidine triad (HIT) protein  33.64 
 
 
167 aa  76.3  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2290  histidine triad (HIT) protein  34.62 
 
 
244 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.358271  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2282  histidine triad (HIT) protein  34.62 
 
 
244 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.983913  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1784  histidine triad (HIT) protein  35.78 
 
 
190 aa  75.5  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.238238  normal  0.0568731 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2559  histidine triad (HIT) protein  33.65 
 
 
182 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2074  histidine triad (HIT) protein  31.58 
 
 
165 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165381  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2372  histidine triad (HIT) protein  36.7 
 
 
174 aa  75.1  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1360  histidine triad (HIT) protein  36.11 
 
 
192 aa  74.7  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.529345 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1920  histidine triad (HIT) protein  33.02 
 
 
182 aa  74.3  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.629691  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0074  histidine triad (HIT) protein  39.09 
 
 
180 aa  74.3  0.0000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2042  histidine triad (HIT) protein  37.96 
 
 
195 aa  74.3  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000192809 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13910  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  37.61 
 
 
187 aa  73.9  0.0000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0128023  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2098  histidine triad (HIT) protein  32.11 
 
 
206 aa  73.6  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00118589  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1420  histidine triad (HIT) protein  31.37 
 
 
179 aa  73.6  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1701  HIT family protein  35.96 
 
 
162 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.652784  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1638  histidine triad (HIT) protein  34.23 
 
 
162 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000357011  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1524  histidine triad (HIT) protein  33.94 
 
 
166 aa  73.2  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1932  histidine triad (HIT) protein  32.63 
 
 
178 aa  72.8  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.106566  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3726  histidine triad (HIT) protein  37.27 
 
 
138 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2400  histidine triad (HIT) protein  36.11 
 
 
183 aa  72.4  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  hitchhiker  0.0085284 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0472  histidine triad (HIT) protein  34.31 
 
 
112 aa  71.6  0.000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14920  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  34.86 
 
 
188 aa  71.6  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1504  HIT (HINT, histidine triad) family protein  31.53 
 
 
165 aa  71.6  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000163027  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1553  histidine triad (HIT) protein  38.68 
 
 
177 aa  71.6  0.000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.906837  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2335  histidine triad (HIT) protein  36.11 
 
 
192 aa  70.9  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733694  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2525  histidine triad (HIT) protein  37.27 
 
 
181 aa  70.9  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.271713  normal  0.184582 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0837  histidine triad (HIT) protein  32.98 
 
 
173 aa  70.5  0.000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10680  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  37.04 
 
 
226 aa  70.1  0.000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000753626  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2598  histidine triad (HIT) protein  34.04 
 
 
169 aa  70.1  0.000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15420  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  37.61 
 
 
187 aa  69.7  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0547976  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0839  histidine triad (HIT) protein  31.58 
 
 
172 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0818988  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3642  histidine triad (HIT) protein  34.91 
 
 
145 aa  69.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0807517  normal  0.0488836 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17420  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  35.78 
 
 
192 aa  68.9  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.657455  normal  0.0943717 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0075  histidine triad (HIT) protein  40.18 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2713  histidine triad (HIT) protein  28.71 
 
 
162 aa  69.3  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.256067  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1357  histidine triad (HIT) protein  35.19 
 
 
250 aa  69.3  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.474283 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1390  protein kinase C inhibitor  33.71 
 
 
114 aa  68.6  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527818  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5156  histidine triad (HIT) protein  31.48 
 
 
229 aa  68.6  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00760567  hitchhiker  0.000469823 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0927  HIT family hydrolase  29.73 
 
 
162 aa  67.8  0.00000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1325  histidine triad (HIT) protein  34.58 
 
 
160 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0365255  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0551  histidine triad (HIT) protein  34.55 
 
 
181 aa  67.8  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1444  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  38.83 
 
 
144 aa  68.2  0.00000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000339612  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1891  histidine triad (HIT) protein  37.89 
 
 
140 aa  67.8  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.472953  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1612  histidine triad (HIT) protein  33.68 
 
 
173 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3968  histidine triad (HIT) protein  37.5 
 
 
141 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1925  histidine triad (HIT) protein  37.89 
 
 
140 aa  67.8  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3187  histidine triad (HIT) protein  32.11 
 
 
192 aa  67.8  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2316  histidine triad (HIT) protein  35.19 
 
 
200 aa  67.4  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00279696  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2958  histidine triad (HIT) protein  33.64 
 
 
160 aa  67  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1511  histidine triad (HIT) protein  35.14 
 
 
189 aa  67  0.00000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2288  histidine triad (HIT) protein  31.13 
 
 
193 aa  67  0.00000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.274965  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1191  histidine triad (HIT) protein  33.64 
 
 
162 aa  67  0.00000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00599383  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4476  putative histidine triad (HIT) protein  37.14 
 
 
141 aa  66.6  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000626279 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2126  histidine triad (HIT) protein  34.23 
 
 
166 aa  67  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000712705 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1373  HIT family protein  36.84 
 
 
141 aa  66.2  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00295303  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0743  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 
168 aa  65.9  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000120261  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1771  histidine triad (HIT) protein  33.94 
 
 
182 aa  65.5  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00317268  normal  0.0187767 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>