More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1435 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1435  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 		 126 aa  259  8e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1000  hypothetical protein  61.67 
 
 		 122 aa  161  3e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04560  histidine triad (HIT) protein  54.55 
 
 		 122 aa  152  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0651  histidine triad (HIT) protein  56.67 
 
 		 120 aa  147  6e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0007662  unclonable  0.000000000136009 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0365  histidine triad (HIT) protein  58.97 
 
 		 121 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.5377  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  52.07 
 
 		 1077 aa  138  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1004  histidine triad (HIT) protein  53.66 
 
 		 125 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0450  hypothetical protein  53.33 
 
 		 124 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1209  histidine triad (HIT) protein  59.17 
 
 		 131 aa  137  7e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.818472  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0432  histidine triad (HIT) protein  52.42 
 
 		 149 aa  136  1e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2227  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  52.03 
 
 		 122 aa  136  1e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1659  histidine triad (HIT) protein  55.17 
 
 		 125 aa  136  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.490499  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0142  histidine triad (HIT) protein  54.31 
 
 		 130 aa  134  4e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1576  putative hydrolase  53.33 
 
 		 182 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.031095  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4565  histidine triad (HIT) protein  56.56 
 
 		 130 aa  127  7.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1488  histidine triad (HIT) protein  67.39 
 
 		 109 aa  126  9.000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000559646  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4872  histidine triad (HIT) protein  55.83 
 
 		 133 aa  122  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0296  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  49.19 
 
 		 127 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0398  histidine triad (HIT) protein  41.18 
 
 		 284 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3984  type III restriction protein res subunit  48.31 
 
 		 1418 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0929  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  44.74 
 
 		 126 aa  108  3e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.685079  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07720  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  46.67 
 
 		 131 aa  105  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4049  histidine triad (HIT) protein  42.86 
 
 		 289 aa  104  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1483  hypothetical protein  43.33 
 
 		 142 aa  102  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0920  histidine triad (HIT) protein  37.34 
 
 		 174 aa  99.8  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.675581  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0077  histidine triad (HIT) protein  46.15 
 
 		 138 aa  97.8  4e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1420  histidine triad (HIT) protein  35.67 
 
 		 179 aa  95.5  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4113  histidine triad (HIT) protein  35.29 
 
 		 289 aa  95.9  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.489073 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1657  histidine triad (HIT) protein  37.39 
 
 		 190 aa  90.1  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.411198  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1980  histidine triad (HIT) protein  42.34 
 
 		 189 aa  87.8  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000948071 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3993  type III restriction protein res subunit  78.43 
 
 		 1348 aa  87.4  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2074  histidine triad (HIT) protein  36.94 
 
 		 165 aa  84.3  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165381  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2559  histidine triad (HIT) protein  39.09 
 
 		 182 aa  84  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1784  histidine triad (HIT) protein  42.34 
 
 		 190 aa  84  7e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.238238  normal  0.0568731 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1342  histidine triad (HIT) protein  40.37 
 
 		 163 aa  83.6  9e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.187699  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3837  histidine triad (HIT) protein  38.18 
 
 		 182 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.868089  normal  0.143653 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0357  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0469904 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12632  hypothetical protein  40.59 
 
 		 195 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0100073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0010  histidine triad (HIT) protein  34.82 
 
 		 169 aa  82.4  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0387329  normal  0.117285 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2525  histidine triad (HIT) protein  43.62 
 
 		 181 aa  82.4  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.271713  normal  0.184582 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1357  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 		 250 aa  82  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.474283 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3726  histidine triad (HIT) protein  39.81 
 
 		 138 aa  81.3  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1524  histidine triad (HIT) protein  36.21 
 
 		 166 aa  80.9  0.000000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1973  HIT family protein  39.17 
 
 		 166 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000182824  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2243  histidine triad (HIT) protein  36.45 
 
 		 220 aa  80.9  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.118301  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1434  histidine triad (HIT) protein  40.91 
 
 		 174 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.186815  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1373  HIT family protein  41.94 
 
 		 141 aa  80.5  0.000000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00295303  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2282  histidine triad (HIT) protein  36.45 
 
 		 244 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.983913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2290  histidine triad (HIT) protein  36.45 
 
 		 244 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.358271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2090  histidine triad (HIT) protein  41.44 
 
 		 182 aa  80.5  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746736  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0562  histidine triad (HIT) protein  34.19 
 
 		 167 aa  80.5  0.000000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1701  HIT family protein  37.07 
 
 		 162 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.652784  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1387  histidine triad (HIT) protein  34.48 
 
 		 171 aa  80.1  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.026049  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1658  histidine triad (HIT) protein  32.76 
 
 		 164 aa  80.1  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0449  diadenosine tetraphosphate hydrolase  40 
 
 		 194 aa  79.3  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2042  histidine triad (HIT) protein  40.74 
 
 		 195 aa  79  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000192809 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1462  histidine triad (HIT) protein  39.09 
 
 		 162 aa  79  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2372  histidine triad (HIT) protein  38.74 
 
 		 174 aa  79  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2944  histidine triad (HIT) protein  33.91 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.173088  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1361  histidine triad (HIT) protein  39.66 
 
 		 163 aa  78.2  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.149111  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1740  histidine triad protein  38.68 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1497  histidine triad (HIT) protein  38.79 
 
 		 163 aa  78.2  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0842593  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1615  HIT domain-containing protein  38.79 
 
 		 163 aa  77.8  0.00000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1228  histidine triad (HIT) protein  34.82 
 
 		 163 aa  77.4  0.00000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1891  histidine triad (HIT) protein  38.53 
 
 		 140 aa  77.4  0.00000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.472953  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1925  histidine triad (HIT) protein  38.53 
 
 		 140 aa  77.4  0.00000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2345  histidine triad (HIT) protein  40.68 
 
 		 165 aa  77.4  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2400  histidine triad (HIT) protein  38.05 
 
 		 183 aa  77  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  hitchhiker  0.0085284 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2433  histidine triad (HIT) protein  40.68 
 
 		 165 aa  77  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106121  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1183  histidine triad (HIT) protein  38.53 
 
 		 184 aa  77  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.970277  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13910  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  39.09 
 
 		 187 aa  77  0.00000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0128023  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1553  histidine triad (HIT) protein  34.23 
 
 		 177 aa  76.3  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.906837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1360  histidine triad (HIT) protein  36.36 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.529345 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3642  histidine triad (HIT) protein  37.04 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0807517  normal  0.0488836 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2598  histidine triad (HIT) protein  34.82 
 
 		 169 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2713  histidine triad (HIT) protein  31.31 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.256067  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1522  histidine triad (HIT) protein  38.98 
 
 		 165 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.311815  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2335  histidine triad (HIT) protein  39.45 
 
 		 192 aa  74.7  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2316  histidine triad (HIT) protein  37.96 
 
 		 200 aa  74.7  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00279696  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2098  histidine triad (HIT) protein  36.04 
 
 		 206 aa  74.7  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00118589  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1638  histidine triad (HIT) protein  36.21 
 
 		 162 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000357011  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0927  HIT family hydrolase  29.06 
 
 		 162 aa  73.9  0.0000000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1325  histidine triad (HIT) protein  38.18 
 
 		 160 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0365255  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1920  histidine triad (HIT) protein  37.62 
 
 		 182 aa  73.9  0.0000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.629691  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15420  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  37.72 
 
 		 187 aa  73.6  0.0000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0547976  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1225  histidine triad (HIT) protein  34.23 
 
 		 171 aa  73.6  0.0000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0818  histidine triad (HIT) protein  36.94 
 
 		 191 aa  72.8  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  0.0395405 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2880  histidine triad (HIT) protein  31.58 
 
 		 170 aa  72.8  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00137934  normal  0.021176 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14920  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  36.61 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10680  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  38.89 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000753626  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2958  histidine triad (HIT) protein  37.27 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2288  histidine triad (HIT) protein  34.29 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.274965  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1504  HIT (HINT, histidine triad) family protein  32.43 
 
 		 165 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000163027  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0187  histidine triad (HIT) protein  37.61 
 
 		 164 aa  72.4  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.414611  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0472  histidine triad (HIT) protein  37 
 
 		 112 aa  72.8  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3187  histidine triad (HIT) protein  36.89 
 
 		 192 aa  71.2  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0648  histidine triad (HIT) protein  37.01 
 
 		 163 aa  70.9  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5156  histidine triad (HIT) protein  33.64 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00760567  hitchhiker  0.000469823 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17420  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  36.36 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.657455  normal  0.0943717 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2290  histidine triad (HIT) protein  37.29 
 
 		 164 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0845631  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>