More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1209 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1209  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 		 131 aa  271  3e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.818472  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4872  histidine triad (HIT) protein  81.68 
 
 		 133 aa  229  1e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4565  histidine triad (HIT) protein  71.09 
 
 		 130 aa  189  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1004  histidine triad (HIT) protein  63.93 
 
 		 125 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1576  putative hydrolase  58.91 
 
 		 182 aa  169  9e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.031095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04560  histidine triad (HIT) protein  60.83 
 
 		 122 aa  157  5e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  52.42 
 
 		 1077 aa  138  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1435  histidine triad (HIT) protein  59.17 
 
 		 126 aa  137  7e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2227  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  54.92 
 
 		 122 aa  136  1e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1000  hypothetical protein  54.92 
 
 		 122 aa  134  5e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1483  hypothetical protein  51.75 
 
 		 142 aa  133  8e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0142  histidine triad (HIT) protein  53.04 
 
 		 130 aa  130  6.999999999999999e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0651  histidine triad (HIT) protein  52.5 
 
 		 120 aa  129  9e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0007662  unclonable  0.000000000136009 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0450  hypothetical protein  53.33 
 
 		 124 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1659  histidine triad (HIT) protein  50.85 
 
 		 125 aa  123  7e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.490499  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0365  histidine triad (HIT) protein  52.5 
 
 		 121 aa  122  1e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.5377  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4049  histidine triad (HIT) protein  44.53 
 
 		 289 aa  119  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3984  type III restriction protein res subunit  48.31 
 
 		 1418 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0296  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  50.39 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0398  histidine triad (HIT) protein  42.37 
 
 		 284 aa  114  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0077  histidine triad (HIT) protein  45.08 
 
 		 138 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1420  histidine triad (HIT) protein  37.65 
 
 		 179 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0920  histidine triad (HIT) protein  38.79 
 
 		 174 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.675581  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0432  histidine triad (HIT) protein  46.55 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07720  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  42.62 
 
 		 131 aa  105  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1488  histidine triad (HIT) protein  60.87 
 
 		 109 aa  103  5e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000559646  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0929  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  46.49 
 
 		 126 aa  103  1e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.685079  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4113  histidine triad (HIT) protein  36.07 
 
 		 289 aa  101  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.489073 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1740  histidine triad protein  39.02 
 
 		 139 aa  94  7e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2944  histidine triad (HIT) protein  40.37 
 
 		 179 aa  92.8  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.173088  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0074  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 		 180 aa  92  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2525  histidine triad (HIT) protein  42.99 
 
 		 181 aa  90.5  7e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.271713  normal  0.184582 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1725  histidine triad (HIT) protein  39.2 
 
 		 161 aa  89  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0187  histidine triad (HIT) protein  38.17 
 
 		 164 aa  85.9  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.414611  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1531  histidine triad (HIT) protein  37.74 
 
 		 136 aa  85.9  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1980  histidine triad (HIT) protein  39.81 
 
 		 189 aa  85.5  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000948071 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0075  histidine triad (HIT) protein  39.02 
 
 		 143 aa  85.1  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0562  histidine triad (HIT) protein  38.53 
 
 		 167 aa  84.7  4e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2345  histidine triad (HIT) protein  39.32 
 
 		 165 aa  84  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0449  diadenosine tetraphosphate hydrolase  40 
 
 		 194 aa  83.6  9e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13910  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  38.89 
 
 		 187 aa  82.8  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0128023  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2433  histidine triad (HIT) protein  38.46 
 
 		 165 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106121  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2145  histidine triad (HIT) protein  37.7 
 
 		 146 aa  82.4  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0648  histidine triad (HIT) protein  37.3 
 
 		 163 aa  81.6  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0010  histidine triad (HIT) protein  34.23 
 
 		 169 aa  81.6  0.000000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0387329  normal  0.117285 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1784  histidine triad (HIT) protein  37.96 
 
 		 190 aa  81.6  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.238238  normal  0.0568731 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12632  hypothetical protein  34.58 
 
 		 195 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0100073  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1151  HIT family protein  39.09 
 
 		 165 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0978  HIT family protein  39.09 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1047  HIT family protein  39.09 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3726  histidine triad (HIT) protein  39.29 
 
 		 138 aa  81.3  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4221  HIT family protein  39.09 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.071329  normal  0.0179678 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0966  HIT family protein  39.09 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0957  HIT family protein  39.09 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1083  HIT family protein  39.09 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1212  HIT family protein  39.09 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1124  HIT family protein  39.09 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3993  type III restriction protein res subunit  62.71 
 
 		 1348 aa  80.5  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1225  histidine triad (HIT) protein  35.78 
 
 		 171 aa  80.1  0.000000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3642  histidine triad (HIT) protein  36.21 
 
 		 145 aa  80.5  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0807517  normal  0.0488836 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0814  histidine triad (HIT) protein  39.09 
 
 		 144 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1657  histidine triad (HIT) protein  36.11 
 
 		 190 aa  80.1  0.000000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.411198  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0551  histidine triad (HIT) protein  35.14 
 
 		 181 aa  79.7  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2400  histidine triad (HIT) protein  36.04 
 
 		 183 aa  80.1  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  hitchhiker  0.0085284 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4476  putative histidine triad (HIT) protein  42.86 
 
 		 141 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000626279 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1920  histidine triad (HIT) protein  38.54 
 
 		 182 aa  79.7  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.629691  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3187  histidine triad (HIT) protein  36.11 
 
 		 192 aa  79.7  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1524  histidine triad (HIT) protein  34.26 
 
 		 166 aa  79.3  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2282  histidine triad (HIT) protein  32.46 
 
 		 244 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.983913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2042  histidine triad (HIT) protein  37.04 
 
 		 195 aa  79  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000192809 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1638  histidine triad (HIT) protein  35.09 
 
 		 162 aa  79  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000357011  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0711  histidine triad (HIT) protein  41.28 
 
 		 142 aa  79  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0363676  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2243  histidine triad (HIT) protein  32.46 
 
 		 220 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.118301  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2290  histidine triad (HIT) protein  32.46 
 
 		 244 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.358271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4085  putative HIT family protein  38.26 
 
 		 153 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2290  histidine triad (HIT) protein  37.39 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0845631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1522  histidine triad (HIT) protein  35.9 
 
 		 165 aa  78.2  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.311815  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2074  histidine triad (HIT) protein  33.04 
 
 		 165 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165381  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47340  putative HIT family protein  38.26 
 
 		 153 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3968  histidine triad (HIT) protein  41.11 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1701  HIT family protein  37.72 
 
 		 162 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.652784  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2288  histidine triad (HIT) protein  35.51 
 
 		 193 aa  77.8  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.274965  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2559  histidine triad (HIT) protein  35.51 
 
 		 182 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0644  histidine triad (HIT) protein  39.81 
 
 		 140 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15420  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  38.74 
 
 		 187 aa  77.8  0.00000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0547976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0254  histidine triad (HIT) protein  40.91 
 
 		 145 aa  77.4  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1504  HIT (HINT, histidine triad) family protein  33.03 
 
 		 165 aa  77.4  0.00000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000163027  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17420  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  37.17 
 
 		 192 aa  77  0.00000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.657455  normal  0.0943717 
 
 
-
 
NC_002936  DET1615  HIT domain-containing protein  34.86 
 
 		 163 aa  77  0.00000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1784  histidine triad (HIT) protein  36.94 
 
 		 182 aa  77.4  0.00000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.686669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1497  histidine triad (HIT) protein  35.78 
 
 		 163 aa  77  0.00000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0842593  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0962  histidine triad (HIT) protein  38.18 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1342  histidine triad (HIT) protein  33.96 
 
 		 130 aa  77  0.00000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1771  histidine triad (HIT) protein  36.94 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00317268  normal  0.0187767 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1461  histidine triad (HIT) protein  37.38 
 
 		 143 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3837  histidine triad (HIT) protein  34.58 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.868089  normal  0.143653 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1511  histidine triad (HIT) protein  36.36 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1462  histidine triad (HIT) protein  36.52 
 
 		 162 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2098  histidine triad (HIT) protein  35.19 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00118589  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2372  histidine triad (HIT) protein  35.19 
 
 		 174 aa  76.6  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>