More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4085 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4085  putative HIT family protein  100 
 
 
153 aa  296  5e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47340  putative HIT family protein  96.08 
 
 
153 aa  286  7e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1783  histidine triad (HIT) protein  68.71 
 
 
148 aa  196  9e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.344857  normal  0.911997 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4028  histidine triad (HIT) protein  42.2 
 
 
143 aa  99  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3954  histidine triad (HIT) protein  42.2 
 
 
143 aa  99  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3968  histidine triad (HIT) protein  42.2 
 
 
143 aa  98.2  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.777319  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4456  histidine triad (HIT) protein  42.2 
 
 
145 aa  98.2  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2239  histidine triad (HIT) protein  43.12 
 
 
145 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.640796  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3642  histidine triad (HIT) protein  42.24 
 
 
145 aa  95.9  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0807517  normal  0.0488836 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1740  histidine triad protein  33.9 
 
 
139 aa  92.4  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1461  histidine triad (HIT) protein  36.5 
 
 
143 aa  92  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1993  histidine triad (HIT) protein  44.86 
 
 
140 aa  92  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0327  histidine triad (HIT) protein  42.11 
 
 
144 aa  90.5  7e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0007671  normal  0.0222978 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2145  histidine triad (HIT) protein  37.24 
 
 
146 aa  90.5  7e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538577  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0531  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 
137 aa  89.7  1e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.406416  normal  0.0183035 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1614  histidine triad (HIT) protein  41.96 
 
 
139 aa  89  2e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6595  histidine triad (HIT) protein  41.04 
 
 
148 aa  88.6  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1664  histidine triad (HIT) protein  36.36 
 
 
145 aa  86.3  1e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.147901  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1065  histidine triad (HIT) protein  34.81 
 
 
172 aa  86.7  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2539  histidine triad (HIT) protein  41.67 
 
 
139 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0711  histidine triad (HIT) protein  44.92 
 
 
142 aa  85.1  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0363676  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3726  histidine triad (HIT) protein  35.04 
 
 
138 aa  85.1  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1561  histidine triad (HIT) protein  37.78 
 
 
139 aa  84.3  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1805  histidine triad (HIT) protein  38.39 
 
 
141 aa  83.6  9e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.496797 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6201  histidine triad (HIT) protein  39.34 
 
 
141 aa  83.6  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.488321  normal  0.398749 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11288  HIT family protein  39.45 
 
 
144 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.750453  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0644  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 
140 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1531  histidine triad (HIT) protein  36.7 
 
 
136 aa  82.8  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3349  histidine triad (HIT) protein  42.06 
 
 
148 aa  81.6  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425203 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1284  histidine triad (HIT) protein  39.39 
 
 
142 aa  81.6  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0781  histidine triad (HIT) protein  39.5 
 
 
135 aa  80.9  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1263  histidine triad (HIT) protein  34.82 
 
 
144 aa  80.5  0.000000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000437908  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2454  histidine triad (HIT) protein  36.21 
 
 
145 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.832288  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3108  histidine triad (HIT) protein  36.21 
 
 
143 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4498  histidine triad (HIT) protein  34.78 
 
 
140 aa  79  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0381  protein kinase C1 inhibitor  32.11 
 
 
139 aa  78.6  0.00000000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0075  histidine triad (HIT) protein  40.37 
 
 
143 aa  78.6  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2848  histidine triad (HIT) protein  38.53 
 
 
136 aa  78.6  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1209  histidine triad (HIT) protein  38.26 
 
 
131 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.818472  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2237  histidine triad (HIT) protein  35.19 
 
 
138 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1151  HIT family protein  33.33 
 
 
165 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0004  histidine triad (HIT) protein  33.62 
 
 
149 aa  77.8  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0275782 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0254  histidine triad (HIT) protein  36.7 
 
 
145 aa  77.4  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1212  HIT family protein  33.33 
 
 
144 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0966  HIT family protein  33.33 
 
 
144 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0957  HIT family protein  33.33 
 
 
144 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1423  histidine triad (HIT) protein  33.96 
 
 
111 aa  77.4  0.00000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1124  HIT family protein  33.33 
 
 
144 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4221  HIT family protein  33.33 
 
 
144 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.071329  normal  0.0179678 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4872  histidine triad (HIT) protein  38.74 
 
 
133 aa  76.6  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1083  HIT family protein  33.33 
 
 
144 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1891  histidine triad (HIT) protein  39.66 
 
 
137 aa  76.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3159  histidine triad (HIT) protein  35.29 
 
 
117 aa  76.3  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000807551 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0814  histidine triad (HIT) protein  33.62 
 
 
144 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3451  histidine triad (HIT) protein  35.09 
 
 
149 aa  75.9  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.923698  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1444  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  34.17 
 
 
144 aa  76.3  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000339612  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1155  hemolysin A  30.48 
 
 
367 aa  75.5  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0962  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 
144 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46060  histidine triad (HIT) family protein  36.04 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1004  histidine triad (HIT) protein  38.32 
 
 
125 aa  75.1  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4837  histidine triad (HIT) protein  35.4 
 
 
140 aa  75.1  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0161096  normal  0.332557 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1573  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  30.56 
 
 
139 aa  74.3  0.0000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0075  histidine triad (HIT) protein  34.86 
 
 
138 aa  73.9  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  0.167835 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0006  histidine triad (HIT) protein  34.86 
 
 
142 aa  73.9  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0070148  unclonable  0.000000000279381 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3238  histidine triad (HIT) protein  31.03 
 
 
118 aa  73.9  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0843  protein kinase C inhibitor  36.36 
 
 
118 aa  73.9  0.0000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2813  hypothetical protein  32.43 
 
 
113 aa  73.6  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1203  histidine triad (HIT) protein  31.62 
 
 
164 aa  73.6  0.0000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.34898  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2705  histidine triad (HIT) protein  34.55 
 
 
114 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.787766  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0978  HIT family protein  32.48 
 
 
144 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04560  histidine triad (HIT) protein  34.82 
 
 
122 aa  73.2  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2448  histidine triad (HIT) protein  31.82 
 
 
112 aa  73.2  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1062  HIT family hydrolase  35.45 
 
 
115 aa  73.6  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102876  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1047  HIT family protein  32.48 
 
 
144 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0919  histidine triad (HIT) protein  36.22 
 
 
140 aa  73.6  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.420438  normal  0.191843 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1342  histidine triad (HIT) protein  30.84 
 
 
130 aa  73.2  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4320  histidine triad (HIT) protein  33.63 
 
 
142 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0862778  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0315  histidine triad (HIT) protein  37.39 
 
 
112 aa  72.8  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130359 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2991  histidine triad (HIT) protein  31.53 
 
 
113 aa  72.4  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.337185  normal  0.959668 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4689  histidine triad (HIT) protein  33.63 
 
 
142 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0956525  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3399  histidine triad (HIT) protein  37.06 
 
 
149 aa  72.8  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.163397  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0840  hypothetical protein  33.33 
 
 
116 aa  72  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1376  histidine triad (HIT) protein  31.78 
 
 
151 aa  71.6  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.341423  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2682  hypothetical protein  32.43 
 
 
113 aa  72  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0450  hypothetical protein  39.47 
 
 
124 aa  71.6  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1342  histidine triad (HIT) protein  31.78 
 
 
130 aa  72  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1333  histidine triad (HIT) protein  31.78 
 
 
130 aa  72  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0568524  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0312  histidine triad (HIT) protein  29.91 
 
 
110 aa  72  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0762523  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0105  histidine triad (HIT) protein  36.52 
 
 
131 aa  72  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl245  putative nucleotidyl hydrolase/transferase  29.63 
 
 
135 aa  71.6  0.000000000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3376  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 
116 aa  71.6  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0432  histidine triad (HIT) protein  36.36 
 
 
113 aa  71.6  0.000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0312734  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06270  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  36.27 
 
 
128 aa  71.6  0.000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0484184  normal  0.0161272 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0229  histidine triad (HIT) protein  35.45 
 
 
114 aa  71.2  0.000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.280449  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0912  histidine triad (HIT) protein  37.25 
 
 
115 aa  71.2  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2281  HIT family protein  26.36 
 
 
114 aa  71.2  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1852  histidine triad (HIT) protein  30.91 
 
 
114 aa  71.2  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.279518 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1369  histidine triad (HIT) protein  35.29 
 
 
114 aa  70.9  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12750  histidine triad (HIT) protein  32.73 
 
 
114 aa  70.5  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.28931  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0269  histidine triad protein HIT  33.33 
 
 
152 aa  70.9  0.000000000007  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0663739  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>