More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2227 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_2227  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  100 
 
 
122 aa  255  1e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04560  histidine triad (HIT) protein  63.64 
 
 
122 aa  161  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0651  histidine triad (HIT) protein  57.14 
 
 
120 aa  152  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0007662  unclonable  0.000000000136009 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0450  hypothetical protein  55.46 
 
 
124 aa  149  2e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1000  hypothetical protein  55.83 
 
 
122 aa  148  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  53.28 
 
 
1077 aa  144  4.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1209  histidine triad (HIT) protein  54.92 
 
 
131 aa  136  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.818472  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1435  histidine triad (HIT) protein  52.03 
 
 
126 aa  136  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4872  histidine triad (HIT) protein  55.83 
 
 
133 aa  131  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1004  histidine triad (HIT) protein  48.78 
 
 
125 aa  130  7.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4565  histidine triad (HIT) protein  49.18 
 
 
130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1576  putative hydrolase  46.72 
 
 
182 aa  123  8.000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.031095  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3984  type III restriction protein res subunit  49.56 
 
 
1418 aa  123  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0296  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  48.39 
 
 
127 aa  123  9e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0365  histidine triad (HIT) protein  51.28 
 
 
121 aa  122  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.5377  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0929  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  50.42 
 
 
126 aa  122  2e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.685079  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0142  histidine triad (HIT) protein  49.14 
 
 
130 aa  116  9e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0432  histidine triad (HIT) protein  45.16 
 
 
149 aa  115  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1659  histidine triad (HIT) protein  46.96 
 
 
125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.490499  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1483  hypothetical protein  49.53 
 
 
142 aa  114  5e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4049  histidine triad (HIT) protein  44.63 
 
 
289 aa  110  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318812  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1488  histidine triad (HIT) protein  57.14 
 
 
109 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000559646  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07720  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  44.17 
 
 
131 aa  107  5e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0398  histidine triad (HIT) protein  40.34 
 
 
284 aa  107  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1420  histidine triad (HIT) protein  35.44 
 
 
179 aa  94.4  5e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4113  histidine triad (HIT) protein  37.82 
 
 
289 aa  92.8  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.489073 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0077  histidine triad (HIT) protein  39.02 
 
 
138 aa  92.4  2e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0920  histidine triad (HIT) protein  33.76 
 
 
174 aa  89.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.675581  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1740  histidine triad protein  35.38 
 
 
139 aa  87.8  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3993  type III restriction protein res subunit  54.17 
 
 
1348 aa  84  6e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3726  histidine triad (HIT) protein  38.18 
 
 
138 aa  77.8  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0927  HIT family hydrolase  37.84 
 
 
162 aa  77.8  0.00000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1531  histidine triad (HIT) protein  34.58 
 
 
136 aa  77.8  0.00000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2280  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  37.74 
 
 
132 aa  75.9  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0644  histidine triad (HIT) protein  39.09 
 
 
140 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2098  histidine triad (HIT) protein  31.71 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00118589  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0075  histidine triad (HIT) protein  37.6 
 
 
143 aa  72.8  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2237  histidine triad (HIT) protein  34.86 
 
 
138 aa  72.8  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3642  histidine triad (HIT) protein  31.48 
 
 
145 aa  71.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0807517  normal  0.0488836 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0562  histidine triad (HIT) protein  33.64 
 
 
167 aa  71.2  0.000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1701  HIT family protein  33.64 
 
 
162 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.652784  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2145  histidine triad (HIT) protein  34.91 
 
 
146 aa  71.2  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538577  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1376  histidine triad (HIT) protein  34.26 
 
 
151 aa  70.9  0.000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.341423  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0814  histidine triad (HIT) protein  40.57 
 
 
144 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1151  HIT family protein  38.46 
 
 
165 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1461  histidine triad (HIT) protein  37.27 
 
 
143 aa  70.9  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1212  HIT family protein  38.46 
 
 
144 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0978  HIT family protein  38.46 
 
 
144 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0966  HIT family protein  38.46 
 
 
144 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0957  HIT family protein  38.46 
 
 
144 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1047  HIT family protein  38.46 
 
 
144 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4221  HIT family protein  38.46 
 
 
144 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.071329  normal  0.0179678 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1124  HIT family protein  38.46 
 
 
144 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1083  HIT family protein  38.46 
 
 
144 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1891  histidine triad (HIT) protein  34.26 
 
 
137 aa  70.5  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1373  HIT family protein  39.78 
 
 
141 aa  70.1  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00295303  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0520  Hit family protein  33.33 
 
 
161 aa  69.3  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2169  histidine triad (HIT) protein  34.51 
 
 
140 aa  69.7  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1435  Hit family protein  33.33 
 
 
161 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1638  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 
162 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000357011  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0597  diadenosine tetraphosphate hydrolase  35.64 
 
 
112 aa  69.7  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0607  Hit family protein  33.33 
 
 
161 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1705  HIT family protein  36.27 
 
 
112 aa  68.9  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1524  histidine triad (HIT) protein  31.53 
 
 
166 aa  69.3  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1444  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  35.19 
 
 
144 aa  69.3  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000339612  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1499  histidine triad (HIT) protein  29.91 
 
 
301 aa  69.3  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.348624  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3187  histidine triad (HIT) protein  32.26 
 
 
192 aa  68.6  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1784  histidine triad (HIT) protein  32.41 
 
 
190 aa  68.6  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.238238  normal  0.0568731 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0187  histidine triad (HIT) protein  36.51 
 
 
164 aa  68.6  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.414611  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1325  histidine triad (HIT) protein  37.1 
 
 
160 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0365255  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1462  histidine triad (HIT) protein  39.51 
 
 
162 aa  68.2  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2074  histidine triad (HIT) protein  32.73 
 
 
165 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165381  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1658  histidine triad (HIT) protein  30.95 
 
 
164 aa  68.6  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0472  histidine triad (HIT) protein  34.65 
 
 
112 aa  67.8  0.00000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0381  protein kinase C1 inhibitor  36.52 
 
 
139 aa  68.2  0.00000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0962  histidine triad (HIT) protein  37.5 
 
 
144 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0370  HIT family protein  34.91 
 
 
139 aa  67.8  0.00000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1657  histidine triad (HIT) protein  29.6 
 
 
190 aa  67.8  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.411198  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1553  histidine triad (HIT) protein  36.84 
 
 
177 aa  67.8  0.00000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.906837  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2958  histidine triad (HIT) protein  36.29 
 
 
160 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13910  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  32.11 
 
 
187 aa  67.4  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0128023  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4014  histidine triad (HIT) protein  34.78 
 
 
137 aa  67.4  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1050  histidine triad (HIT) protein  31.2 
 
 
139 aa  67.4  0.00000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.265499  normal  0.307581 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0449  diadenosine tetraphosphate hydrolase  36.36 
 
 
194 aa  67.4  0.00000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1573  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  32.11 
 
 
139 aa  67.4  0.00000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1342  histidine triad (HIT) protein  33.64 
 
 
163 aa  67.4  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.187699  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2400  histidine triad (HIT) protein  32.41 
 
 
183 aa  67.4  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  hitchhiker  0.0085284 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2335  histidine triad (HIT) protein  31.97 
 
 
192 aa  67  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733694  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1228  histidine triad (HIT) protein  30.28 
 
 
163 aa  67  0.00000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2598  histidine triad (HIT) protein  30.4 
 
 
169 aa  66.6  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1925  histidine triad (HIT) protein  37.63 
 
 
140 aa  66.2  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0269  histidine triad protein HIT  38.05 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0663739  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1891  histidine triad (HIT) protein  37.63 
 
 
140 aa  66.2  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.472953  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0074  histidine triad (HIT) protein  31.82 
 
 
180 aa  66.2  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0711  histidine triad (HIT) protein  38.05 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0363676  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2944  histidine triad (HIT) protein  31.53 
 
 
179 aa  66.2  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.173088  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3968  histidine triad (HIT) protein  32.73 
 
 
143 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.777319  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1980  histidine triad (HIT) protein  31.48 
 
 
189 aa  65.5  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000948071 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5156  histidine triad (HIT) protein  30.89 
 
 
229 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00760567  hitchhiker  0.000469823 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3954  histidine triad (HIT) protein  31.78 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>