More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1241 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1241  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 		 131 aa  270  5.000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1687  HIT family protein  55.04 
 
 		 129 aa  158  2e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.833443 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1632  HIT family protein  57.26 
 
 		 130 aa  155  3e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0437202  hitchhiker  0.00568101 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1591  histidine triad (HIT) protein  53.91 
 
 		 129 aa  150  8e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0302  histidine triad (HIT) protein  55.2 
 
 		 128 aa  146  9e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4584  histidine triad (HIT) protein  49.22 
 
 		 129 aa  143  8.000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000842385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3809  histidine triad (HIT) protein  49.23 
 
 		 133 aa  142  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.197548  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01700  HIT family protein  51.61 
 
 		 129 aa  142  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127711  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0732  hypothetical protein  49.19 
 
 		 132 aa  141  3e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1055  histidine triad (HIT) protein  51.16 
 
 		 130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3302  HIT family protein  47.29 
 
 		 131 aa  121  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2900  histidine triad (HIT) protein  47.29 
 
 		 131 aa  121  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.276504  normal  0.0712491 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10774  hypothetical protein  37.4 
 
 		 133 aa  99  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3102  histidine triad (HIT) protein  39.84 
 
 		 131 aa  97.4  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.550311  normal  0.852173 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4971  histidine triad (HIT) protein  36.72 
 
 		 138 aa  97.4  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4676  histidine triad (HIT) protein  36.72 
 
 		 138 aa  97.1  8e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0370318  normal  0.851631 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1815  histidine triad (HIT) protein  44.34 
 
 		 136 aa  97.1  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0400003  normal  0.0526222 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4588  histidine triad (HIT) protein  36.72 
 
 		 138 aa  97.1  8e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1583  histidine triad (HIT) protein  36.72 
 
 		 134 aa  95.9  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3629  histidine triad (HIT) protein  35.94 
 
 		 133 aa  95.9  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5173  histidine triad (HIT) protein  35.16 
 
 		 138 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.707443 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2413  histidine triad (HIT) protein  31.78 
 
 		 148 aa  86.7  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0135198 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1444  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  36.96 
 
 		 144 aa  84.3  5e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000339612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1740  histidine triad protein  38.1 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1701  histidine triad (HIT) protein  33.96 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.377935 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1228  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  38.81 
 
 		 140 aa  81.3  0.000000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0892724  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07820  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  34.58 
 
 		 142 aa  81.3  0.000000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2633  histidine triad (HIT) protein  34.88 
 
 		 142 aa  80.5  0.000000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00206121  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0381  protein kinase C1 inhibitor  37.12 
 
 		 139 aa  80.5  0.000000000000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03708  HIT domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G12680)  36.92 
 
 		 133 aa  79  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.117728  normal  0.7439 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1263  histidine triad (HIT) protein  35.97 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000437908  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0826  histidine triad (HIT) protein  31.25 
 
 		 141 aa  77.8  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15219  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2368  histidine triad (HIT) protein  35.85 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000014225 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1970  histidine triad (HIT) protein  30.84 
 
 		 146 aa  76.6  0.00000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.939838  hitchhiker  0.0000383714 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1461  histidine triad (HIT) protein  39.22 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1531  histidine triad (HIT) protein  38.68 
 
 		 136 aa  75.5  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1275  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  33.83 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0781  histidine triad (HIT) protein  35.07 
 
 		 135 aa  75.1  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4709  histidine triad (HIT) protein  36 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2416  histidine triad (HIT) protein  36.19 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0525465  normal  0.0378675 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2024  histidine triad (HIT) protein  36.89 
 
 		 140 aa  74.7  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1168  HIT family protein  36.89 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.247304  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1125  HIT family protein  36.89 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.20711  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0494  putative HIT-like protein  30.6 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2807  histidine triad (HIT) protein  35.19 
 
 		 145 aa  73.6  0.0000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2151  histidine triad (HIT) protein  33.64 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.14674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1342  histidine triad (HIT) protein  38.83 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1333  histidine triad (HIT) protein  38.83 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0568524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4702  histidine triad (HIT) protein  28.36 
 
 		 144 aa  72  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00557305 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0620  histidine triad (HIT) protein  38.83 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.693859  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3316  histidine triad (HIT) protein  33.58 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.33287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0492  HIT family protein  33.66 
 
 		 138 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0096  histidine triad (HIT) protein  32.67 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1573  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  36.11 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2703  HIT family protein  32.67 
 
 		 138 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0207  HIT family protein  32.67 
 
 		 138 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1579  HIT family protein  32.67 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.380866  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2559  HIT family protein  32.67 
 
 		 138 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.609142  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0979  HIT family protein  32.67 
 
 		 138 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.721312  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1382  HIT family protein  32.67 
 
 		 138 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0238  HIT family protein  32.67 
 
 		 138 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3549  histidine triad (HIT) protein  35.64 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276085  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2890  histidine triad (HIT) protein  27.74 
 
 		 139 aa  70.1  0.000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1373  HIT family protein  39.6 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00295303  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2237  histidine triad (HIT) protein  31.85 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0254  histidine triad (HIT) protein  32.67 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1009  histidine triad (HIT) protein  31.85 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0596  histidine triad (HIT) protein  36.54 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2405  histidine triad (HIT) protein  34.65 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.112602  normal  0.457991 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0644  histidine triad (HIT) protein  33.09 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2451  histidine triad (HIT) protein  33.66 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.94056  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2801  histidine triad (HIT) protein  31.11 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.106273  normal  0.788809 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3726  histidine triad (HIT) protein  31.25 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3327  histidine triad (HIT) protein  31.31 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.036152 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0472  HIT family protein  36.89 
 
 		 131 aa  68.2  0.00000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.974422  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1342  histidine triad (HIT) protein  36.27 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2135  histidine triad (HIT) protein  28.15 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.605825  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl245  putative nucleotidyl hydrolase/transferase  39.42 
 
 		 135 aa  67.8  0.00000000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3517  hypothetical protein  30.28 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.810284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3351  histidine triad  30.28 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.814063 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3416  histidine triad  30.28 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.621229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3422  histidine triad  30.28 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2169  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0814  histidine triad (HIT) protein  34.11 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3399  histidine triad (HIT) protein  31.97 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.163397  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4476  putative histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000626279 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0519  histidine triad nucleotide-binding protein 2 (hint-2)(hint-3)  38.83 
 
 		 117 aa  67.4  0.00000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1925  histidine triad (HIT) protein  36.63 
 
 		 140 aa  67  0.00000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1891  histidine triad (HIT) protein  36.63 
 
 		 140 aa  67  0.00000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.472953  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2926  histidine triad (HIT) protein  31.68 
 
 		 149 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2290  histidine triad (HIT) protein  33.66 
 
 		 139 aa  67  0.00000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1151  HIT family protein  36.7 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0966  HIT family protein  34.11 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0957  HIT family protein  34.11 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1212  HIT family protein  34.11 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1083  HIT family protein  37.86 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1076  histidine triad (HIT) protein  34.95 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.179252 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3968  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1124  HIT family protein  34.11 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4221  HIT family protein  37.86 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.071329  normal  0.0179678 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>