More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1055 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1055  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 		 130 aa  263  5e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4584  histidine triad (HIT) protein  74.42 
 
 		 129 aa  201  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000842385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1591  histidine triad (HIT) protein  62.79 
 
 		 129 aa  175  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01700  HIT family protein  60.47 
 
 		 129 aa  172  9.999999999999999e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127711  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3809  histidine triad (HIT) protein  60.31 
 
 		 133 aa  170  5.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.197548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0302  histidine triad (HIT) protein  58.06 
 
 		 128 aa  166  1e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1687  HIT family protein  58.73 
 
 		 129 aa  160  4.0000000000000004e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.833443 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2900  histidine triad (HIT) protein  57.36 
 
 		 131 aa  154  4e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.276504  normal  0.0712491 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3302  HIT family protein  57.36 
 
 		 131 aa  154  4e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1632  HIT family protein  55.38 
 
 		 130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0437202  hitchhiker  0.00568101 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0732  hypothetical protein  54.33 
 
 		 132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1241  histidine triad (HIT) protein  51.16 
 
 		 131 aa  144  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3102  histidine triad (HIT) protein  43.61 
 
 		 131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.550311  normal  0.852173 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10774  hypothetical protein  38.28 
 
 		 133 aa  100  6e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0826  histidine triad (HIT) protein  42.31 
 
 		 141 aa  99.4  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15219  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5173  histidine triad (HIT) protein  37.69 
 
 		 138 aa  99.4  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.707443 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4676  histidine triad (HIT) protein  36.92 
 
 		 138 aa  99  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0370318  normal  0.851631 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4588  histidine triad (HIT) protein  36.92 
 
 		 138 aa  99  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4971  histidine triad (HIT) protein  36.92 
 
 		 138 aa  99  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1583  histidine triad (HIT) protein  37.69 
 
 		 134 aa  97.1  8e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3629  histidine triad (HIT) protein  39.25 
 
 		 133 aa  96.7  9e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1701  histidine triad (HIT) protein  36.92 
 
 		 143 aa  95.1  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.377935 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2413  histidine triad (HIT) protein  36.92 
 
 		 148 aa  94.7  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0135198 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1815  histidine triad (HIT) protein  35.34 
 
 		 136 aa  92.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0400003  normal  0.0526222 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2633  histidine triad (HIT) protein  39.23 
 
 		 142 aa  90.9  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00206121  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07820  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  39.25 
 
 		 142 aa  89  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2801  histidine triad (HIT) protein  40.46 
 
 		 139 aa  87.4  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.106273  normal  0.788809 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2024  histidine triad (HIT) protein  37.12 
 
 		 140 aa  86.3  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3968  histidine triad (HIT) protein  38.28 
 
 		 141 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4702  histidine triad (HIT) protein  36.36 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00557305 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4476  putative histidine triad (HIT) protein  37.5 
 
 		 141 aa  84.7  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000626279 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1076  histidine triad (HIT) protein  37.12 
 
 		 146 aa  82.8  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.179252 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0096  histidine triad (HIT) protein  44.66 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0579  histidine triad domain-containing protein  34.88 
 
 		 140 aa  81.6  0.000000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0235717  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0370  HIT family protein  38.46 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1302  histidine triad (HIT) protein  36.09 
 
 		 146 aa  82  0.000000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0254  histidine triad (HIT) protein  37.12 
 
 		 145 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1228  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  40.43 
 
 		 140 aa  81.6  0.000000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0892724  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1740  histidine triad protein  38.52 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2368  histidine triad (HIT) protein  35.38 
 
 		 142 aa  81.3  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000014225 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3753  histidine triad (HIT) protein  38.35 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0494  putative HIT-like protein  34.85 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2926  histidine triad (HIT) protein  37.88 
 
 		 149 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1970  histidine triad (HIT) protein  34.82 
 
 		 146 aa  80.1  0.000000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.939838  hitchhiker  0.0000383714 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3327  histidine triad (HIT) protein  36.92 
 
 		 139 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.036152 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3422  histidine triad  36.8 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1125  HIT family protein  35.61 
 
 		 140 aa  78.6  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.20711  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3517  hypothetical protein  36.8 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.810284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3351  histidine triad  36.8 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.814063 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3416  histidine triad  36.8 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.621229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4837  histidine triad (HIT) protein  36.84 
 
 		 140 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0161096  normal  0.332557 
 
 
-
 
NC_004310  BR1168  HIT family protein  35.61 
 
 		 140 aa  78.6  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.247304  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4709  histidine triad (HIT) protein  33.56 
 
 		 153 aa  78.6  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0492  HIT family protein  36.36 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1573  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  40 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0207  HIT family protein  35.4 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0238  HIT family protein  35.4 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0979  HIT family protein  35.4 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.721312  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2559  HIT family protein  35.4 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.609142  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1382  HIT family protein  35.4 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1579  HIT family protein  35.4 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.380866  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2703  HIT family protein  35.4 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0952  histidine triad (HIT) protein  40.78 
 
 		 143 aa  77  0.00000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000117681  hitchhiker  0.00115812 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0075  histidine triad (HIT) protein  39.85 
 
 		 138 aa  77.4  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  0.167835 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1574  histidine triad (HIT) protein  38.35 
 
 		 141 aa  76.6  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.650242  normal  0.227098 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0381  protein kinase C1 inhibitor  37.25 
 
 		 139 aa  77  0.00000000000009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0006  histidine triad (HIT) protein  38.3 
 
 		 142 aa  76.6  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0070148  unclonable  0.000000000279381 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2169  histidine triad (HIT) protein  44 
 
 		 140 aa  76.3  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4320  histidine triad (HIT) protein  35.34 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0862778  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1771  histidine triad (HIT) protein  37.59 
 
 		 143 aa  76.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4689  histidine triad (HIT) protein  35.34 
 
 		 142 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0956525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3878  histidine triad (HIT) protein  33.59 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000287053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1444  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  39.25 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000339612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1531  histidine triad (HIT) protein  34.33 
 
 		 136 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1275  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  37.14 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1050  histidine triad (HIT) protein  44 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.265499  normal  0.307581 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1120  histidine triad (HIT) protein  36.09 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0596  histidine triad (HIT) protein  34.09 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4014  histidine triad (HIT) protein  35.34 
 
 		 137 aa  73.9  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1342  histidine triad (HIT) protein  41 
 
 		 130 aa  73.9  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1911  hypothetical protein  32.89 
 
 		 157 aa  73.6  0.0000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0579038  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2290  histidine triad (HIT) protein  35.61 
 
 		 139 aa  73.6  0.0000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1333  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 		 130 aa  73.6  0.0000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0568524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3399  histidine triad (HIT) protein  35.34 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.163397  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2151  histidine triad (HIT) protein  36.89 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.14674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1749  histidine triad (HIT) protein  40.78 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0211  histidine triad (HIT) protein  31.82 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1376  histidine triad (HIT) protein  34.65 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0781  histidine triad (HIT) protein  38.52 
 
 		 135 aa  72  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2539  histidine triad (HIT) protein  32.84 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1263  histidine triad (HIT) protein  40.74 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000437908  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3726  histidine triad (HIT) protein  37 
 
 		 138 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21440  putative HIT family protein  33.33 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.117632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2280  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  34.88 
 
 		 132 aa  71.2  0.000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2683  histidine triad (HIT) protein  33.05 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3139  histidine triad (HIT) protein  35.34 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0448341 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0075  histidine triad (HIT) protein  48 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0746  histidine triad (HIT) protein  34.85 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00337572 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4823  histidine triad (HIT) protein  35.94 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.784878 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5415  histidine triad (HIT) protein  35.94 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.269942  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>