More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1701 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1701  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 		 143 aa  286  9e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.377935 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4971  histidine triad (HIT) protein  52.24 
 
 		 138 aa  160  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4676  histidine triad (HIT) protein  51.49 
 
 		 138 aa  158  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0370318  normal  0.851631 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4588  histidine triad (HIT) protein  51.49 
 
 		 138 aa  158  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0826  histidine triad (HIT) protein  55.4 
 
 		 141 aa  154  4e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15219  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2633  histidine triad (HIT) protein  55.97 
 
 		 142 aa  150  7e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00206121  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3629  histidine triad (HIT) protein  53.85 
 
 		 133 aa  147  6e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1583  histidine triad (HIT) protein  48.87 
 
 		 134 aa  146  9e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2413  histidine triad (HIT) protein  52.99 
 
 		 148 aa  144  4.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0135198 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10774  hypothetical protein  48.48 
 
 		 133 aa  143  9e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5173  histidine triad (HIT) protein  48.51 
 
 		 138 aa  142  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.707443 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07820  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  58.26 
 
 		 142 aa  142  2e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2368  histidine triad (HIT) protein  48.92 
 
 		 142 aa  137  7e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000014225 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3102  histidine triad (HIT) protein  50.77 
 
 		 131 aa  130  5e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.550311  normal  0.852173 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1970  histidine triad (HIT) protein  46.43 
 
 		 146 aa  119  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.939838  hitchhiker  0.0000383714 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1815  histidine triad (HIT) protein  43.18 
 
 		 136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0400003  normal  0.0526222 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3809  histidine triad (HIT) protein  34.09 
 
 		 133 aa  100  7e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.197548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3302  HIT family protein  39.69 
 
 		 131 aa  96.7  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2900  histidine triad (HIT) protein  39.69 
 
 		 131 aa  96.7  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.276504  normal  0.0712491 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01700  HIT family protein  38.17 
 
 		 129 aa  95.9  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127711  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4584  histidine triad (HIT) protein  36.15 
 
 		 129 aa  95.5  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000842385  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1687  HIT family protein  35.94 
 
 		 129 aa  90.1  8e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.833443 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0732  hypothetical protein  32.28 
 
 		 132 aa  90.1  9e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1632  HIT family protein  29.23 
 
 		 130 aa  86.7  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0437202  hitchhiker  0.00568101 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0302  histidine triad (HIT) protein  33.59 
 
 		 128 aa  85.9  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1574  histidine triad (HIT) protein  34.81 
 
 		 141 aa  84.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.650242  normal  0.227098 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1055  histidine triad (HIT) protein  36.92 
 
 		 130 aa  84.7  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1771  histidine triad (HIT) protein  35.56 
 
 		 143 aa  84  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1591  histidine triad (HIT) protein  33.65 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1241  histidine triad (HIT) protein  33.96 
 
 		 131 aa  81.3  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0254  histidine triad (HIT) protein  36.96 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1740  histidine triad protein  38.06 
 
 		 139 aa  80.1  0.000000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2926  histidine triad (HIT) protein  32.85 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2151  histidine triad (HIT) protein  38.83 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.14674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1376  histidine triad (HIT) protein  33.08 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2024  histidine triad (HIT) protein  34.07 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0579  histidine triad domain-containing protein  31.21 
 
 		 140 aa  76.6  0.00000000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0235717  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1168  HIT family protein  33.33 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.247304  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1125  HIT family protein  33.33 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.20711  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4837  histidine triad (HIT) protein  34.53 
 
 		 140 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0161096  normal  0.332557 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3753  histidine triad (HIT) protein  35.46 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2534  HIT family protein  36.79 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.91947  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0370  HIT family protein  32.84 
 
 		 139 aa  73.9  0.0000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4689  histidine triad (HIT) protein  34.75 
 
 		 142 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0956525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1275  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  35.77 
 
 		 139 aa  73.9  0.0000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0726  histidine triad (HIT) protein  29.29 
 
 		 145 aa  73.6  0.0000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4320  histidine triad (HIT) protein  34.75 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0862778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1228  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  35.11 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0892724  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2801  histidine triad (HIT) protein  30.15 
 
 		 139 aa  70.1  0.000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.106273  normal  0.788809 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0075  histidine triad (HIT) protein  34.31 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  0.167835 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0746  histidine triad (HIT) protein  36.19 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00337572 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1531  histidine triad (HIT) protein  33.56 
 
 		 136 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0211  histidine triad (HIT) protein  33.09 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2405  histidine triad (HIT) protein  32.12 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.112602  normal  0.457991 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0381  protein kinase C1 inhibitor  31.82 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1076  histidine triad (HIT) protein  31.3 
 
 		 146 aa  67.4  0.00000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.179252 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3108  histidine triad (HIT) protein  32.58 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2454  histidine triad (HIT) protein  32.58 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.832288  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0006  histidine triad (HIT) protein  33.58 
 
 		 142 aa  67  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0070148  unclonable  0.000000000279381 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0096  histidine triad (HIT) protein  37.27 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1749  histidine triad (HIT) protein  36.36 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1302  histidine triad (HIT) protein  30.53 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2145  histidine triad (HIT) protein  32.33 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3316  histidine triad (HIT) protein  31.62 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.33287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3046  histidine triad (HIT) protein  33.58 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1342  histidine triad (HIT) protein  28.16 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2807  histidine triad (HIT) protein  34.59 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0004  histidine triad (HIT) protein  30.15 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0275782 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2290  histidine triad (HIT) protein  30.37 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21440  putative HIT family protein  33.33 
 
 		 145 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.117632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1573  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  30.37 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2890  histidine triad (HIT) protein  34.19 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4498  histidine triad (HIT) protein  39.25 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1925  histidine triad (HIT) protein  28.35 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1891  histidine triad (HIT) protein  28.35 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.472953  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3422  histidine triad  33.02 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3351  histidine triad  33.02 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.814063 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1829  putative HIT family protein  31.69 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3416  histidine triad  33.02 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.621229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0781  histidine triad (HIT) protein  33.02 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1376  histidine triad (HIT) protein  33.98 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.341423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3517  hypothetical protein  33.02 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.810284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2280  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  33.02 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4014  histidine triad (HIT) protein  32.85 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1009  histidine triad (HIT) protein  34.97 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0075  histidine triad (HIT) protein  38.46 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2683  histidine triad (HIT) protein  35.29 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0644  histidine triad (HIT) protein  30.19 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1373  HIT family protein  27.41 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00295303  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0952  histidine triad (HIT) protein  31.07 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000117681  hitchhiker  0.00115812 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1342  histidine triad (HIT) protein  26.21 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1333  histidine triad (HIT) protein  26.21 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0568524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1050  histidine triad (HIT) protein  35.58 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.265499  normal  0.307581 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1255  HIT family protein  33.01 
 
 		 119 aa  60.8  0.000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3549  histidine triad (HIT) protein  33.01 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276085  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0832  histidine triad (HIT) protein  28.79 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1151  HIT family protein  30.84 
 
 		 165 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0957  HIT family protein  30.84 
 
 		 144 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1124  HIT family protein  30.84 
 
 		 144 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1212  HIT family protein  30.84 
 
 		 144 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>