More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3809 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3809  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 		 133 aa  267  2.9999999999999997e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.197548  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1687  HIT family protein  58.59 
 
 		 129 aa  170  5e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.833443 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4584  histidine triad (HIT) protein  57.69 
 
 		 129 aa  160  6e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000842385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1632  HIT family protein  58.46 
 
 		 130 aa  155  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0437202  hitchhiker  0.00568101 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1591  histidine triad (HIT) protein  53.85 
 
 		 129 aa  150  8e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0732  hypothetical protein  51.91 
 
 		 132 aa  148  2e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01700  HIT family protein  53.08 
 
 		 129 aa  148  3e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127711  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1055  histidine triad (HIT) protein  60.31 
 
 		 130 aa  147  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0302  histidine triad (HIT) protein  50.78 
 
 		 128 aa  142  2e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1241  histidine triad (HIT) protein  49.23 
 
 		 131 aa  142  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2900  histidine triad (HIT) protein  51.15 
 
 		 131 aa  138  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.276504  normal  0.0712491 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3302  HIT family protein  51.15 
 
 		 131 aa  138  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4971  histidine triad (HIT) protein  38.64 
 
 		 138 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3629  histidine triad (HIT) protein  38.93 
 
 		 133 aa  114  3.9999999999999997e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5173  histidine triad (HIT) protein  37.12 
 
 		 138 aa  114  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.707443 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4588  histidine triad (HIT) protein  38.64 
 
 		 138 aa  114  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4676  histidine triad (HIT) protein  38.64 
 
 		 138 aa  114  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0370318  normal  0.851631 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1583  histidine triad (HIT) protein  41.35 
 
 		 134 aa  111  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0826  histidine triad (HIT) protein  41.22 
 
 		 141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15219  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3102  histidine triad (HIT) protein  38.17 
 
 		 131 aa  106  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.550311  normal  0.852173 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10774  hypothetical protein  36.15 
 
 		 133 aa  106  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1815  histidine triad (HIT) protein  34.85 
 
 		 136 aa  102  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0400003  normal  0.0526222 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1701  histidine triad (HIT) protein  34.09 
 
 		 143 aa  100  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.377935 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2413  histidine triad (HIT) protein  31.54 
 
 		 148 aa  93.6  9e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0135198 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07820  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  34.21 
 
 		 142 aa  91.3  4e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2633  histidine triad (HIT) protein  31.06 
 
 		 142 aa  84.3  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00206121  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2368  histidine triad (HIT) protein  30.77 
 
 		 142 aa  82.8  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000014225 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1970  histidine triad (HIT) protein  28.79 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.939838  hitchhiker  0.0000383714 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1740  histidine triad protein  35.82 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0832  histidine triad (HIT) protein  38.14 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1228  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  40.91 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0892724  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3399  histidine triad (HIT) protein  34.33 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.163397  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4702  histidine triad (HIT) protein  34.33 
 
 		 144 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00557305 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0254  histidine triad (HIT) protein  36.63 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1531  histidine triad (HIT) protein  37.74 
 
 		 136 aa  73.9  0.0000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0211  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 145 aa  73.9  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4014  histidine triad (HIT) protein  36.76 
 
 		 137 aa  73.6  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0370  HIT family protein  34.56 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2801  histidine triad (HIT) protein  36.57 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.106273  normal  0.788809 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0096  histidine triad (HIT) protein  39.81 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1574  histidine triad (HIT) protein  35.82 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.650242  normal  0.227098 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2683  histidine triad (HIT) protein  37.84 
 
 		 149 aa  72  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1444  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  37.38 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000339612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2024  histidine triad (HIT) protein  34.53 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1573  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  39.09 
 
 		 139 aa  70.1  0.000000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3416  histidine triad  38.89 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.621229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3422  histidine triad  38.89 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3351  histidine triad  38.89 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.814063 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1050  histidine triad (HIT) protein  36.09 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.265499  normal  0.307581 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3753  histidine triad (HIT) protein  35.34 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3517  hypothetical protein  38.89 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.810284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1284  histidine triad (HIT) protein  30.6 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0494  putative HIT-like protein  32.35 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1771  histidine triad (HIT) protein  34.33 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0608  histidine triad (HIT) protein  43.88 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3108  histidine triad (HIT) protein  31.58 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0381  protein kinase C1 inhibitor  32.82 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2454  histidine triad (HIT) protein  31.58 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.832288  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4837  histidine triad (HIT) protein  34.33 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0161096  normal  0.332557 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1275  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  37.14 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1373  HIT family protein  34.33 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00295303  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1749  histidine triad (HIT) protein  38.83 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1025  histidine triad (HIT) protein  40.38 
 
 		 135 aa  67.4  0.00000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1461  histidine triad (HIT) protein  38.89 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0952  histidine triad (HIT) protein  37.86 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000117681  hitchhiker  0.00115812 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3968  histidine triad (HIT) protein  37.37 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1891  histidine triad (HIT) protein  30.23 
 
 		 137 aa  67  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0075  histidine triad (HIT) protein  34.31 
 
 		 138 aa  67  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  0.167835 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2151  histidine triad (HIT) protein  31.78 
 
 		 146 aa  67  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.14674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1076  histidine triad (HIT) protein  32.84 
 
 		 146 aa  67  0.00000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.179252 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0579  histidine triad domain-containing protein  33.08 
 
 		 140 aa  67  0.00000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0235717  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2169  histidine triad (HIT) protein  39 
 
 		 140 aa  67  0.00000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1168  HIT family protein  33.81 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.247304  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4476  putative histidine triad (HIT) protein  36.36 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000626279 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0006  histidine triad (HIT) protein  40.78 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0070148  unclonable  0.000000000279381 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1125  HIT family protein  33.81 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.20711  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4689  histidine triad (HIT) protein  33.58 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0956525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0596  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3327  histidine triad (HIT) protein  38.38 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.036152 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3726  histidine triad (HIT) protein  31.34 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2280  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  35.61 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0519  histidine triad nucleotide-binding protein 2 (hint-2)(hint-3)  39.22 
 
 		 117 aa  65.1  0.0000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3536  histidine triad (HIT) protein  34.07 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.806394 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1302  histidine triad (HIT) protein  32.09 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2416  histidine triad (HIT) protein  32.86 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0525465  normal  0.0378675 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4498  histidine triad (HIT) protein  34.81 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2290  histidine triad (HIT) protein  34.81 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1376  histidine triad (HIT) protein  38.38 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1891  histidine triad (HIT) protein  39.6 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.472953  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1342  histidine triad (HIT) protein  38 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1925  histidine triad (HIT) protein  39.6 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4320  histidine triad (HIT) protein  33.58 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0862778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1579  HIT family protein  35.29 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.380866  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0207  HIT family protein  35.29 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2703  HIT family protein  35.29 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0979  HIT family protein  35.29 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.721312  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1382  HIT family protein  35.29 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2559  HIT family protein  35.29 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.609142  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2210  histidine triad (HIT) protein  35.29 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.544525  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0238  HIT family protein  35.29 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>