More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1583 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1583  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 
134 aa  275  2e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5173  histidine triad (HIT) protein  86.47 
 
 
138 aa  244  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.707443 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4588  histidine triad (HIT) protein  86.47 
 
 
138 aa  239  7.999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4676  histidine triad (HIT) protein  86.47 
 
 
138 aa  239  7.999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0370318  normal  0.851631 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4971  histidine triad (HIT) protein  85.71 
 
 
138 aa  236  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10774  hypothetical protein  80.15 
 
 
133 aa  231  3e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3629  histidine triad (HIT) protein  65.41 
 
 
133 aa  189  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2633  histidine triad (HIT) protein  54.62 
 
 
142 aa  159  9e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00206121  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2368  histidine triad (HIT) protein  50.77 
 
 
142 aa  150  5e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000014225 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0826  histidine triad (HIT) protein  52.31 
 
 
141 aa  149  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15219  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1701  histidine triad (HIT) protein  48.87 
 
 
143 aa  146  9e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.377935 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07820  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  53.45 
 
 
142 aa  139  9.999999999999999e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1815  histidine triad (HIT) protein  46.27 
 
 
136 aa  137  7e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0400003  normal  0.0526222 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1970  histidine triad (HIT) protein  45.45 
 
 
146 aa  131  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.939838  hitchhiker  0.0000383714 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3102  histidine triad (HIT) protein  46.92 
 
 
131 aa  130  6.999999999999999e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.550311  normal  0.852173 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2413  histidine triad (HIT) protein  45.38 
 
 
148 aa  126  8.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0135198 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3809  histidine triad (HIT) protein  41.35 
 
 
133 aa  111  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.197548  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01700  HIT family protein  42.2 
 
 
129 aa  103  6e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127711  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0302  histidine triad (HIT) protein  43.75 
 
 
128 aa  103  8e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1687  HIT family protein  39.84 
 
 
129 aa  100  9e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.833443 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2900  histidine triad (HIT) protein  39.23 
 
 
131 aa  100  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.276504  normal  0.0712491 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3302  HIT family protein  39.23 
 
 
131 aa  100  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1591  histidine triad (HIT) protein  40.19 
 
 
129 aa  97.4  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1632  HIT family protein  36.92 
 
 
130 aa  96.3  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0437202  hitchhiker  0.00568101 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1241  histidine triad (HIT) protein  36.72 
 
 
131 aa  95.9  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0732  hypothetical protein  32.84 
 
 
132 aa  93.6  8e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4584  histidine triad (HIT) protein  38.46 
 
 
129 aa  92  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000842385  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1055  histidine triad (HIT) protein  37.69 
 
 
130 aa  88.2  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1740  histidine triad protein  39.26 
 
 
139 aa  85.1  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_004310  BR1168  HIT family protein  38.97 
 
 
140 aa  83.2  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.247304  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1125  HIT family protein  38.24 
 
 
140 aa  82.8  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.20711  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3549  histidine triad (HIT) protein  43.4 
 
 
142 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276085  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2024  histidine triad (HIT) protein  41.58 
 
 
140 aa  80.9  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0381  protein kinase C1 inhibitor  35.61 
 
 
139 aa  78.2  0.00000000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0096  histidine triad (HIT) protein  37.72 
 
 
139 aa  78.2  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1749  histidine triad (HIT) protein  37.72 
 
 
139 aa  77.8  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2926  histidine triad (HIT) protein  39.62 
 
 
149 aa  77.4  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2534  HIT family protein  38.68 
 
 
141 aa  77  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.91947  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1574  histidine triad (HIT) protein  38.68 
 
 
141 aa  76.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.650242  normal  0.227098 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1771  histidine triad (HIT) protein  41.51 
 
 
143 aa  76.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123943  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1376  histidine triad (HIT) protein  41.18 
 
 
145 aa  76.6  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1531  histidine triad (HIT) protein  31.65 
 
 
136 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2405  histidine triad (HIT) protein  41.75 
 
 
142 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.112602  normal  0.457991 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0579  histidine triad domain-containing protein  37.04 
 
 
140 aa  75.1  0.0000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0235717  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21440  putative HIT family protein  34.56 
 
 
145 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.117632  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3753  histidine triad (HIT) protein  39.62 
 
 
145 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1829  putative HIT family protein  34.56 
 
 
145 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0746  histidine triad (HIT) protein  34.06 
 
 
145 aa  73.6  0.0000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00337572 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0254  histidine triad (HIT) protein  38.61 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4837  histidine triad (HIT) protein  37.86 
 
 
140 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0161096  normal  0.332557 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2290  histidine triad (HIT) protein  40.57 
 
 
139 aa  73.2  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3139  histidine triad (HIT) protein  36.03 
 
 
143 aa  72.8  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0448341 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0370  HIT family protein  34.59 
 
 
139 aa  72  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0644  histidine triad (HIT) protein  36.22 
 
 
140 aa  72.8  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2145  histidine triad (HIT) protein  29.85 
 
 
146 aa  72.8  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538577  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2280  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  40.37 
 
 
132 aa  72  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3046  histidine triad (HIT) protein  40.78 
 
 
142 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0596  histidine triad (HIT) protein  31 
 
 
131 aa  71.6  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1573  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  41.28 
 
 
139 aa  72  0.000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1461  histidine triad (HIT) protein  33.58 
 
 
143 aa  71.6  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4689  histidine triad (HIT) protein  34.07 
 
 
142 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0956525  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1050  histidine triad (HIT) protein  33.08 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.265499  normal  0.307581 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1342  histidine triad (HIT) protein  30 
 
 
130 aa  71.2  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1333  histidine triad (HIT) protein  30 
 
 
130 aa  71.2  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0568524  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1444  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  37.04 
 
 
144 aa  70.9  0.000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000339612  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1376  histidine triad (HIT) protein  35.04 
 
 
151 aa  71.2  0.000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.341423  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4320  histidine triad (HIT) protein  37.86 
 
 
142 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0862778  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1993  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 
140 aa  70.5  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1263  histidine triad (HIT) protein  33.58 
 
 
144 aa  70.5  0.000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000437908  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2416  histidine triad (HIT) protein  40.57 
 
 
146 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0525465  normal  0.0378675 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1342  histidine triad (HIT) protein  28.46 
 
 
130 aa  70.1  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0952  histidine triad (HIT) protein  37.14 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000117681  hitchhiker  0.00115812 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1532  histidine triad (HIT) protein  33.09 
 
 
145 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.77898  normal  0.453293 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1120  histidine triad (HIT) protein  41.51 
 
 
139 aa  70.1  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636565  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2451  histidine triad (HIT) protein  33.57 
 
 
142 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.94056  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1275  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  38.89 
 
 
139 aa  70.1  0.00000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1228  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  40.2 
 
 
140 aa  69.7  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0892724  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0620  histidine triad (HIT) protein  28.46 
 
 
130 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.693859  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2801  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 
139 aa  69.3  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.106273  normal  0.788809 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2237  histidine triad (HIT) protein  32.84 
 
 
138 aa  68.9  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0006  histidine triad (HIT) protein  34.29 
 
 
142 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0070148  unclonable  0.000000000279381 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2807  histidine triad (HIT) protein  39.81 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1076  histidine triad (HIT) protein  34.62 
 
 
146 aa  68.6  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.179252 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2539  histidine triad (HIT) protein  37.27 
 
 
139 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0075  histidine triad (HIT) protein  33.59 
 
 
138 aa  67.4  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  0.167835 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0781  histidine triad (HIT) protein  33.02 
 
 
135 aa  67.4  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2151  histidine triad (HIT) protein  29.41 
 
 
146 aa  67.4  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.14674  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3316  histidine triad (HIT) protein  37.86 
 
 
142 aa  67.4  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.33287  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6201  histidine triad (HIT) protein  30.66 
 
 
141 aa  67  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.488321  normal  0.398749 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1302  histidine triad (HIT) protein  34.62 
 
 
146 aa  67  0.00000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4498  histidine triad (HIT) protein  35.71 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3517  hypothetical protein  33.02 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.810284  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1151  HIT family protein  31.11 
 
 
165 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3416  histidine triad  33.02 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.621229  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3351  histidine triad  33.02 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.814063 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0788  histidine triad (HIT) protein  30.83 
 
 
455 aa  65.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.864692  normal  0.369294 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0075  histidine triad (HIT) protein  37.62 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3422  histidine triad  33.02 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3954  histidine triad (HIT) protein  30.28 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4028  histidine triad (HIT) protein  30.28 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>