More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3629 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3629  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 		 133 aa  269  1e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4588  histidine triad (HIT) protein  70.23 
 
 		 138 aa  195  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4676  histidine triad (HIT) protein  70.23 
 
 		 138 aa  195  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0370318  normal  0.851631 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4971  histidine triad (HIT) protein  69.47 
 
 		 138 aa  192  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1583  histidine triad (HIT) protein  65.41 
 
 		 134 aa  189  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10774  hypothetical protein  66.41 
 
 		 133 aa  184  4e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5173  histidine triad (HIT) protein  65.65 
 
 		 138 aa  181  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.707443 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0826  histidine triad (HIT) protein  62.31 
 
 		 141 aa  169  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15219  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1701  histidine triad (HIT) protein  53.85 
 
 		 143 aa  147  6e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.377935 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07820  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  60.34 
 
 		 142 aa  146  1.0000000000000001e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2633  histidine triad (HIT) protein  52.31 
 
 		 142 aa  143  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00206121  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2368  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 		 142 aa  138  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000014225 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3102  histidine triad (HIT) protein  50.38 
 
 		 131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.550311  normal  0.852173 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2413  histidine triad (HIT) protein  45.38 
 
 		 148 aa  126  8.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0135198 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1815  histidine triad (HIT) protein  45.8 
 
 		 136 aa  126  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0400003  normal  0.0526222 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1970  histidine triad (HIT) protein  44.7 
 
 		 146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.939838  hitchhiker  0.0000383714 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3809  histidine triad (HIT) protein  38.93 
 
 		 133 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.197548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1632  HIT family protein  38.02 
 
 		 130 aa  104  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0437202  hitchhiker  0.00568101 
 
 
-
 
NC_002950  PG1687  HIT family protein  40.62 
 
 		 129 aa  104  4e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.833443 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4584  histidine triad (HIT) protein  39.45 
 
 		 129 aa  99  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000842385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2900  histidine triad (HIT) protein  39.32 
 
 		 131 aa  97.8  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.276504  normal  0.0712491 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3302  HIT family protein  39.32 
 
 		 131 aa  97.8  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01700  HIT family protein  39.25 
 
 		 129 aa  97.1  7e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127711  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1241  histidine triad (HIT) protein  35.94 
 
 		 131 aa  95.9  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0732  hypothetical protein  32.77 
 
 		 132 aa  93.2  1e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1591  histidine triad (HIT) protein  35.51 
 
 		 129 aa  91.3  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0302  histidine triad (HIT) protein  35.16 
 
 		 128 aa  90.9  5e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1055  histidine triad (HIT) protein  39.25 
 
 		 130 aa  84  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0381  protein kinase C1 inhibitor  35.61 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0096  histidine triad (HIT) protein  36.19 
 
 		 139 aa  77  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2151  histidine triad (HIT) protein  34.31 
 
 		 146 aa  77  0.00000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.14674  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0370  HIT family protein  38.32 
 
 		 139 aa  75.1  0.0000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0746  histidine triad (HIT) protein  35.77 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00337572 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0254  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1275  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  40.71 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1740  histidine triad protein  34.78 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1050  histidine triad (HIT) protein  36.17 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.265499  normal  0.307581 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4702  histidine triad (HIT) protein  36.54 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00557305 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6201  histidine triad (HIT) protein  35.14 
 
 		 141 aa  72  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.488321  normal  0.398749 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1749  histidine triad (HIT) protein  34.29 
 
 		 139 aa  72  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0596  histidine triad (HIT) protein  30.1 
 
 		 131 aa  72  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0966  HIT family protein  35.51 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0957  HIT family protein  35.51 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1212  HIT family protein  35.51 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1573  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  31.93 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1124  HIT family protein  35.51 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1151  HIT family protein  32.84 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1376  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2280  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  35.45 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4498  histidine triad (HIT) protein  36.94 
 
 		 140 aa  70.5  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0494  putative HIT-like protein  36.79 
 
 		 144 aa  70.1  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1771  histidine triad (HIT) protein  38.1 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1228  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  40.38 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0892724  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1574  histidine triad (HIT) protein  36.19 
 
 		 141 aa  70.1  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.650242  normal  0.227098 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2926  histidine triad (HIT) protein  36.19 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0962  histidine triad (HIT) protein  35.51 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1891  histidine triad (HIT) protein  34.82 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.472953  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1263  histidine triad (HIT) protein  35.04 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000437908  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1083  HIT family protein  34.58 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2290  histidine triad (HIT) protein  36.19 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1925  histidine triad (HIT) protein  34.82 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4221  HIT family protein  34.58 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.071329  normal  0.0179678 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1373  HIT family protein  32.35 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00295303  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2024  histidine triad (HIT) protein  34.95 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2801  histidine triad (HIT) protein  33.01 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.106273  normal  0.788809 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0620  histidine triad (HIT) protein  28.57 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.693859  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2539  histidine triad (HIT) protein  37.38 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0644  histidine triad (HIT) protein  33.08 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3057  histidine triad (HIT) protein  35.71 
 
 		 115 aa  67.8  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.750318  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0814  histidine triad (HIT) protein  32.09 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3549  histidine triad (HIT) protein  36.19 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276085  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4320  histidine triad (HIT) protein  34.17 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0862778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4689  histidine triad (HIT) protein  34.17 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0956525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4837  histidine triad (HIT) protein  34.45 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0161096  normal  0.332557 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0978  HIT family protein  34.58 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1047  HIT family protein  34.58 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4709  histidine triad (HIT) protein  34.29 
 
 		 153 aa  67  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1125  HIT family protein  35.92 
 
 		 140 aa  67  0.00000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.20711  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1342  histidine triad (HIT) protein  27.45 
 
 		 130 aa  67  0.00000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2405  histidine triad (HIT) protein  36.19 
 
 		 142 aa  67  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.112602  normal  0.457991 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3878  histidine triad (HIT) protein  40.38 
 
 		 142 aa  67  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000287053  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0075  histidine triad (HIT) protein  38.32 
 
 		 143 aa  67  0.00000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0006  histidine triad (HIT) protein  36.19 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0070148  unclonable  0.000000000279381 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1333  histidine triad (HIT) protein  29.52 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0568524  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1168  HIT family protein  34.95 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.247304  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1993  histidine triad (HIT) protein  32.77 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0472  HIT family protein  28.57 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.974422  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2237  histidine triad (HIT) protein  30.83 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1891  histidine triad (HIT) protein  30.83 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1342  histidine triad (HIT) protein  26.67 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1292  histidine triad (HIT) protein  40.83 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.268815  normal  0.885199 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1461  histidine triad (HIT) protein  33.64 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1829  putative HIT family protein  31.65 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0579  histidine triad domain-containing protein  34.95 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0235717  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3046  histidine triad (HIT) protein  36.19 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1561  histidine triad (HIT) protein  35.85 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2534  HIT family protein  34.29 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.91947  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3316  histidine triad (HIT) protein  34.29 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.33287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1062  HIT family hydrolase  35.51 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102876  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0075  histidine triad (HIT) protein  35.24 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  0.167835 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>