More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4709 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_4709  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 
153 aa  318  9.999999999999999e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3416  histidine triad  65.56 
 
 
151 aa  227  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.621229  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3351  histidine triad  65.56 
 
 
151 aa  227  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.814063 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3517  hypothetical protein  65.56 
 
 
151 aa  227  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.810284  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3422  histidine triad  65.56 
 
 
151 aa  227  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1911  hypothetical protein  59.87 
 
 
157 aa  189  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0579038  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5152  histidine triad (HIT) protein  62.5 
 
 
154 aa  186  8e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.760188 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1241  histidine triad (HIT) protein  36 
 
 
131 aa  75.1  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2848  histidine triad (HIT) protein  34.62 
 
 
136 aa  74.3  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0302  histidine triad (HIT) protein  38.78 
 
 
128 aa  73.2  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1531  histidine triad (HIT) protein  37.04 
 
 
136 aa  73.6  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2900  histidine triad (HIT) protein  36.11 
 
 
131 aa  73.2  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.276504  normal  0.0712491 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3302  HIT family protein  36.11 
 
 
131 aa  73.2  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1687  HIT family protein  39.22 
 
 
129 aa  72  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.833443 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1461  histidine triad (HIT) protein  38.1 
 
 
143 aa  71.2  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0814  histidine triad (HIT) protein  34.29 
 
 
144 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1151  HIT family protein  33.96 
 
 
165 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0966  HIT family protein  33.96 
 
 
144 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0957  HIT family protein  33.96 
 
 
144 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1083  HIT family protein  33.96 
 
 
144 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1591  histidine triad (HIT) protein  35.29 
 
 
129 aa  70.1  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2151  histidine triad (HIT) protein  34.31 
 
 
146 aa  69.7  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.14674  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1124  HIT family protein  33.96 
 
 
144 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1055  histidine triad (HIT) protein  31.54 
 
 
130 aa  69.7  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1212  HIT family protein  33.96 
 
 
144 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4221  HIT family protein  33.96 
 
 
144 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.071329  normal  0.0179678 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0596  histidine triad (HIT) protein  30.91 
 
 
131 aa  69.7  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0962  histidine triad (HIT) protein  33.96 
 
 
144 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01700  HIT family protein  34.31 
 
 
129 aa  68.9  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127711  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0732  hypothetical protein  34.31 
 
 
132 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3629  histidine triad (HIT) protein  34.29 
 
 
133 aa  67  0.00000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0472  HIT family protein  30.19 
 
 
131 aa  66.6  0.0000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.974422  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0644  histidine triad (HIT) protein  35.24 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0978  HIT family protein  33.02 
 
 
144 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1047  HIT family protein  33.02 
 
 
144 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3753  histidine triad (HIT) protein  32.45 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4584  histidine triad (HIT) protein  34.95 
 
 
129 aa  65.1  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000842385  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1740  histidine triad protein  29.41 
 
 
139 aa  65.1  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2416  histidine triad (HIT) protein  32.35 
 
 
146 aa  65.1  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0525465  normal  0.0378675 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1632  HIT family protein  32.35 
 
 
130 aa  65.1  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0437202  hitchhiker  0.00568101 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2280  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  35.24 
 
 
132 aa  64.7  0.0000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03708  HIT domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G12680)  35 
 
 
133 aa  63.9  0.0000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.117728  normal  0.7439 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1583  histidine triad (HIT) protein  30 
 
 
134 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2413  histidine triad (HIT) protein  33 
 
 
148 aa  62.4  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0135198 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1730  histidine triad (HIT) protein  34.78 
 
 
117 aa  62.8  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.020903 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4837  histidine triad (HIT) protein  30 
 
 
140 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0161096  normal  0.332557 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0620  histidine triad (HIT) protein  27.34 
 
 
130 aa  61.6  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.693859  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2926  histidine triad (HIT) protein  31.17 
 
 
149 aa  62  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1333  histidine triad (HIT) protein  30.39 
 
 
130 aa  62  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0568524  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl245  putative nucleotidyl hydrolase/transferase  40.26 
 
 
135 aa  61.6  0.000000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4971  histidine triad (HIT) protein  28.43 
 
 
138 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4588  histidine triad (HIT) protein  28.43 
 
 
138 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1573  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  30.91 
 
 
139 aa  61.2  0.000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4676  histidine triad (HIT) protein  28.43 
 
 
138 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0370318  normal  0.851631 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0254  histidine triad (HIT) protein  28.18 
 
 
145 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1342  histidine triad (HIT) protein  25.78 
 
 
130 aa  60.8  0.000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1302  histidine triad (HIT) protein  33.66 
 
 
146 aa  60.8  0.000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1970  histidine triad (HIT) protein  30.84 
 
 
146 aa  60.8  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.939838  hitchhiker  0.0000383714 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1342  histidine triad (HIT) protein  28.35 
 
 
130 aa  60.5  0.000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0381  protein kinase C1 inhibitor  34.29 
 
 
139 aa  60.5  0.000000009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0952  histidine triad (HIT) protein  32.67 
 
 
143 aa  60.1  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000117681  hitchhiker  0.00115812 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1532  histidine triad (HIT) protein  27.33 
 
 
145 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.77898  normal  0.453293 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0004  histidine triad (HIT) protein  27.56 
 
 
149 aa  59.3  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0275782 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1701  histidine triad (HIT) protein  30.77 
 
 
143 aa  59.3  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.377935 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0338  histidine triad (HIT) protein  33.05 
 
 
121 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.288049  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3809  histidine triad (HIT) protein  31.67 
 
 
133 aa  59.3  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.197548  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3249  HIT family protein  33.02 
 
 
121 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2704  HIT family protein  33.02 
 
 
121 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0207  HIT family protein  33.01 
 
 
138 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3714  HIT family protein  33.02 
 
 
121 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1579  HIT family protein  33.01 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.380866  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3101  histidine triad (HIT) protein  39.44 
 
 
118 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0238  HIT family protein  33.01 
 
 
138 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3683  MttA/Hcf106 family protein  33.02 
 
 
121 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0979  HIT family protein  33.01 
 
 
138 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.721312  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2755  HIT family protein  33.02 
 
 
121 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1798  HIT family protein  33.02 
 
 
121 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1382  HIT family protein  33.01 
 
 
138 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0492  HIT family protein  33.01 
 
 
138 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3656  HIT family protein  33.02 
 
 
121 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2559  HIT family protein  33.01 
 
 
138 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.609142  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2703  HIT family protein  33.01 
 
 
138 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2633  histidine triad (HIT) protein  26.67 
 
 
142 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00206121  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2539  histidine triad (HIT) protein  28.57 
 
 
139 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2368  histidine triad (HIT) protein  27 
 
 
142 aa  58.2  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000014225 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3139  histidine triad (HIT) protein  27.33 
 
 
143 aa  58.2  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0448341 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42119  protein kinase C inhibitor-I, histidine triad nucleotide-binding protein-like protein  31.15 
 
 
156 aa  57.8  0.00000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.149088 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4320  histidine triad (HIT) protein  28.67 
 
 
142 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0862778  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10774  hypothetical protein  30.61 
 
 
133 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2405  histidine triad (HIT) protein  34.26 
 
 
142 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.112602  normal  0.457991 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3549  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 
142 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276085  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0353  histidine triad (HIT) protein  34.91 
 
 
121 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2749  histidine triad (HIT) protein  33.64 
 
 
124 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3376  histidine triad (HIT) protein  34.62 
 
 
116 aa  57.4  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1125  HIT family protein  28.83 
 
 
140 aa  57.4  0.00000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.20711  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6201  histidine triad (HIT) protein  33.78 
 
 
141 aa  57  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.488321  normal  0.398749 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2239  histidine triad (HIT) protein  53.33 
 
 
145 aa  57  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.640796  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3533  histidine triad (HIT) protein  33.05 
 
 
121 aa  57  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.346774  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4689  histidine triad (HIT) protein  28.67 
 
 
142 aa  57  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0956525  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1168  HIT family protein  28.83 
 
 
140 aa  57  0.00000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.247304  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>