More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5152 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5152  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 		 154 aa  322  2e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760188 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3422  histidine triad  63.33 
 
 		 151 aa  203  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3351  histidine triad  63.33 
 
 		 151 aa  203  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.814063 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3416  histidine triad  63.33 
 
 		 151 aa  203  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.621229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3517  hypothetical protein  63.33 
 
 		 151 aa  203  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.810284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4709  histidine triad (HIT) protein  62.5 
 
 		 153 aa  202  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1911  hypothetical protein  60.93 
 
 		 157 aa  185  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0579038  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3809  histidine triad (HIT) protein  33.56 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.197548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1632  HIT family protein  34.91 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0437202  hitchhiker  0.00568101 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1531  histidine triad (HIT) protein  32.2 
 
 		 136 aa  67.4  0.00000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4584  histidine triad (HIT) protein  33.11 
 
 		 129 aa  67  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000842385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2900  histidine triad (HIT) protein  39.22 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.276504  normal  0.0712491 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3302  HIT family protein  39.22 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0732  hypothetical protein  36.52 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1687  HIT family protein  37.86 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.833443 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07820  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  33.66 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2151  histidine triad (HIT) protein  33.98 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.14674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2633  histidine triad (HIT) protein  29.66 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00206121  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1055  histidine triad (HIT) protein  30.2 
 
 		 130 aa  62  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01700  HIT family protein  30.53 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127711  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1591  histidine triad (HIT) protein  34.31 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1342  histidine triad (HIT) protein  26.98 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1701  histidine triad (HIT) protein  32.67 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.377935 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0596  histidine triad (HIT) protein  28.57 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0826  histidine triad (HIT) protein  32.67 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15219  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1342  histidine triad (HIT) protein  26.98 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0832  histidine triad (HIT) protein  28.19 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1241  histidine triad (HIT) protein  29.37 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0455  HIT domain-containing protein  34.95 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.378719  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3642  histidine triad (HIT) protein  35.85 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0807517  normal  0.0488836 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl245  putative nucleotidyl hydrolase/transferase  40.26 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1461  histidine triad (HIT) protein  34.86 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0472  HIT family protein  30.19 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.974422  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0302  histidine triad (HIT) protein  29.93 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1333  histidine triad (HIT) protein  25.4 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0568524  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0370  HIT family protein  27.85 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1970  histidine triad (HIT) protein  30.39 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.939838  hitchhiker  0.0000383714 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1815  histidine triad (HIT) protein  30.69 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0400003  normal  0.0526222 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0075  histidine triad (HIT) protein  36.19 
 
 		 143 aa  57  0.00000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03708  HIT domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G12680)  33.33 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.117728  normal  0.7439 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3629  histidine triad (HIT) protein  27.59 
 
 		 133 aa  57  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3833  histidine triad (HIT) protein  38.83 
 
 		 120 aa  57  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0644  histidine triad (HIT) protein  34.26 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0620  histidine triad (HIT) protein  26.77 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.693859  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0883  histidine triad (HIT) protein  48.89 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.877405 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1573  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  32.41 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_397  HIT domain protein  33.01 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.647527  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2682  hypothetical protein  36.62 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3376  histidine triad (HIT) protein  33.61 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1583  histidine triad (HIT) protein  30.1 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2368  histidine triad (HIT) protein  27 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000014225 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2239  histidine triad (HIT) protein  55.56 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.640796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2848  histidine triad (HIT) protein  28.95 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1740  histidine triad protein  25.49 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1263  histidine triad (HIT) protein  37.14 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000437908  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3102  histidine triad (HIT) protein  30.69 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.550311  normal  0.852173 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4456  histidine triad (HIT) protein  53.33 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0432  histidine triad (HIT) protein  33.98 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0312734  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2683  histidine triad (HIT) protein  35.85 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0269  histidine triad protein HIT  26.72 
 
 		 152 aa  53.5  0.0000009  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0663739  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4971  histidine triad (HIT) protein  29.37 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0315  histidine triad (HIT) protein  40.58 
 
 		 112 aa  53.1  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130359 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00190  hydrolase, putative  28.7 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3968  histidine triad (HIT) protein  51.11 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.777319  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2135  histidine triad (HIT) protein  31.15 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.605825  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2413  histidine triad (HIT) protein  26.67 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0135198 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3954  histidine triad (HIT) protein  43.64 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4588  histidine triad (HIT) protein  29.37 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1076  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4028  histidine triad (HIT) protein  43.64 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4676  histidine triad (HIT) protein  29.37 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0370318  normal  0.851631 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5173  histidine triad (HIT) protein  28.69 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.707443 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2890  histidine triad (HIT) protein  29.73 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3248  histidine triad (HIT) protein  34.91 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00763147  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1574  histidine triad (HIT) protein  29.14 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.650242  normal  0.227098 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1891  histidine triad (HIT) protein  47.73 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4085  putative HIT family protein  33.68 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3753  histidine triad (HIT) protein  30.46 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0711  histidine triad (HIT) protein  42.86 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0363676  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4827  histidine triad (HIT) protein  38.24 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.487703  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6201  histidine triad (HIT) protein  44.44 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.488321  normal  0.398749 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2813  hypothetical protein  35.21 
 
 		 113 aa  51.6  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0004  histidine triad (HIT) protein  31.13 
 
 		 149 aa  51.6  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0275782 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4837  histidine triad (HIT) protein  29.8 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0161096  normal  0.332557 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3349  histidine triad (HIT) protein  37.33 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425203 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06270  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  38.24 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0484184  normal  0.0161272 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47340  putative HIT family protein  33.68 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2280  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  26.14 
 
 		 132 aa  51.6  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1993  histidine triad (HIT) protein  40.82 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12200  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  35.29 
 
 		 114 aa  51.2  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1050  histidine triad (HIT) protein  31.37 
 
 		 139 aa  51.6  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.265499  normal  0.307581 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2926  histidine triad (HIT) protein  30.26 
 
 		 149 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11288  HIT family protein  51.11 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.750453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1444  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  31.5 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000339612  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1151  HIT family protein  31.13 
 
 		 165 aa  51.2  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1805  histidine triad (HIT) protein  28.99 
 
 		 141 aa  50.8  0.000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.496797 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3726  histidine triad (HIT) protein  28.85 
 
 		 138 aa  50.8  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2169  histidine triad (HIT) protein  31.37 
 
 		 140 aa  51.2  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0381  protein kinase C1 inhibitor  39.68 
 
 		 139 aa  50.4  0.000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10774  hypothetical protein  31.09 
 
 		 133 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>