232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1911 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1911  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  326  7e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0579038  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3416  histidine triad  58.55 
 
 		 151 aa  192  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.621229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3517  hypothetical protein  58.55 
 
 		 151 aa  192  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.810284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3422  histidine triad  58.55 
 
 		 151 aa  192  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3351  histidine triad  58.55 
 
 		 151 aa  192  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.814063 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4709  histidine triad (HIT) protein  59.87 
 
 		 153 aa  189  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5152  histidine triad (HIT) protein  60.93 
 
 		 154 aa  171  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760188 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1461  histidine triad (HIT) protein  35.59 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0302  histidine triad (HIT) protein  28 
 
 		 128 aa  68.2  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1591  histidine triad (HIT) protein  35.64 
 
 		 129 aa  66.6  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3302  HIT family protein  35.44 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2900  histidine triad (HIT) protein  35.44 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.276504  normal  0.0712491 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0814  histidine triad (HIT) protein  32.76 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1740  histidine triad protein  32.17 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1151  HIT family protein  31.09 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0966  HIT family protein  31.09 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0957  HIT family protein  31.09 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0826  histidine triad (HIT) protein  34.34 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15219  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1124  HIT family protein  31.09 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0644  histidine triad (HIT) protein  30.51 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3809  histidine triad (HIT) protein  34.62 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.197548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1212  HIT family protein  31.09 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1083  HIT family protein  31.09 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4221  HIT family protein  31.09 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.071329  normal  0.0179678 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4584  histidine triad (HIT) protein  29.8 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000842385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0962  histidine triad (HIT) protein  31.09 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2151  histidine triad (HIT) protein  33.96 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.14674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1055  histidine triad (HIT) protein  32.89 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1687  HIT family protein  30.67 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.833443 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01700  HIT family protein  27.52 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127711  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3753  histidine triad (HIT) protein  32.89 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0978  HIT family protein  30.25 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1047  HIT family protein  30.25 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2926  histidine triad (HIT) protein  31.58 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2239  histidine triad (HIT) protein  59.09 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.640796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1531  histidine triad (HIT) protein  31.15 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2683  histidine triad (HIT) protein  38.46 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1573  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  31.78 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4456  histidine triad (HIT) protein  54.55 
 
 		 145 aa  57  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4498  histidine triad (HIT) protein  30.16 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1532  histidine triad (HIT) protein  27.63 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.77898  normal  0.453293 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0370  HIT family protein  33.01 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2848  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3139  histidine triad (HIT) protein  26.62 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0448341 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1561  histidine triad (HIT) protein  31.3 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4837  histidine triad (HIT) protein  30.97 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0161096  normal  0.332557 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3102  histidine triad (HIT) protein  29.14 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.550311  normal  0.852173 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03708  HIT domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G12680)  27.56 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.117728  normal  0.7439 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0832  histidine triad (HIT) protein  27.74 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4320  histidine triad (HIT) protein  29.68 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0862778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2801  histidine triad (HIT) protein  27.67 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.106273  normal  0.788809 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1993  histidine triad (HIT) protein  44.44 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2633  histidine triad (HIT) protein  32.11 
 
 		 142 aa  53.1  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00206121  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3159  histidine triad (HIT) protein  38.32 
 
 		 117 aa  52.4  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000807551 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0952  histidine triad (HIT) protein  31.73 
 
 		 143 aa  52.4  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000117681  hitchhiker  0.00115812 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21440  putative HIT family protein  26.62 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.117632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2539  histidine triad (HIT) protein  30.43 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4689  histidine triad (HIT) protein  29.68 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0956525  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46060  histidine triad (HIT) family protein  42.86 
 
 		 112 aa  52  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4702  histidine triad (HIT) protein  27.56 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00557305 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1783  histidine triad (HIT) protein  39.13 
 
 		 148 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.344857  normal  0.911997 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1263  histidine triad (HIT) protein  41.18 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000437908  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1829  putative HIT family protein  28.43 
 
 		 145 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11288  HIT family protein  51.16 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.750453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6201  histidine triad (HIT) protein  34.75 
 
 		 141 aa  50.8  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.488321  normal  0.398749 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1609  histidine triad (HIT) protein  39.08 
 
 		 115 aa  50.8  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3642  histidine triad (HIT) protein  44.44 
 
 		 145 aa  50.8  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0807517  normal  0.0488836 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0746  histidine triad (HIT) protein  33.65 
 
 		 145 aa  50.8  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00337572 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2280  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  27.63 
 
 		 132 aa  50.8  0.000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0381  protein kinase C1 inhibitor  48.08 
 
 		 139 aa  50.8  0.000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1771  histidine triad (HIT) protein  32.05 
 
 		 143 aa  50.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123943  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3629  histidine triad (HIT) protein  30.3 
 
 		 133 aa  50.4  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0589  histidine triad (HIT) protein  36.49 
 
 		 114 aa  50.4  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.107105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1241  histidine triad (HIT) protein  30.3 
 
 		 131 aa  50.4  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1970  histidine triad (HIT) protein  27.88 
 
 		 146 aa  50.4  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.939838  hitchhiker  0.0000383714 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2405  histidine triad (HIT) protein  52.5 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.112602  normal  0.457991 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3549  histidine triad (HIT) protein  52.5 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276085  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1815  histidine triad (HIT) protein  29 
 
 		 136 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0400003  normal  0.0526222 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0362  histidine triad (HIT) protein  34.58 
 
 		 121 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.481847 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07820  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  30.69 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2542  histidine triad (HIT) protein  31.37 
 
 		 174 aa  50.1  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0620  histidine triad (HIT) protein  26.17 
 
 		 130 aa  49.7  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.693859  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0353  histidine triad (HIT) protein  39.66 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5046  histidine triad (HIT) protein  27.86 
 
 		 143 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1583  histidine triad (HIT) protein  28.28 
 
 		 134 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0494  putative HIT-like protein  28.66 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2704  HIT family protein  35.51 
 
 		 121 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1705  HIT family protein  35.58 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3683  MttA/Hcf106 family protein  35.51 
 
 		 121 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3533  histidine triad (HIT) protein  32.71 
 
 		 121 aa  48.9  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.346774  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0338  histidine triad (HIT) protein  39.66 
 
 		 121 aa  48.9  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.288049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4014  histidine triad (HIT) protein  28.93 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3238  histidine triad (HIT) protein  32.48 
 
 		 118 aa  48.9  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0596  histidine triad (HIT) protein  22.9 
 
 		 131 aa  48.9  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0732  hypothetical protein  32 
 
 		 132 aa  48.9  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3249  HIT family protein  35.51 
 
 		 121 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1798  HIT family protein  35.51 
 
 		 121 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3656  HIT family protein  35.51 
 
 		 121 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3714  HIT family protein  35.51 
 
 		 121 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2755  HIT family protein  35.51 
 
 		 121 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>