More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0302 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0302  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 		 128 aa  263  8e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1591  histidine triad (HIT) protein  70.16 
 
 		 129 aa  193  6e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01700  HIT family protein  66.94 
 
 		 129 aa  190  5e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127711  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1687  HIT family protein  52.71 
 
 		 129 aa  150  4e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.833443 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4584  histidine triad (HIT) protein  52.8 
 
 		 129 aa  150  5.9999999999999996e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000842385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1241  histidine triad (HIT) protein  55.2 
 
 		 131 aa  146  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1055  histidine triad (HIT) protein  58.06 
 
 		 130 aa  144  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3809  histidine triad (HIT) protein  50.78 
 
 		 133 aa  142  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.197548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1632  HIT family protein  50.79 
 
 		 130 aa  139  9e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0437202  hitchhiker  0.00568101 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0732  hypothetical protein  47.2 
 
 		 132 aa  134  4e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2900  histidine triad (HIT) protein  47.24 
 
 		 131 aa  134  4e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.276504  normal  0.0712491 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3302  HIT family protein  47.24 
 
 		 131 aa  134  4e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1583  histidine triad (HIT) protein  43.75 
 
 		 134 aa  103  8e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4971  histidine triad (HIT) protein  44.86 
 
 		 138 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4588  histidine triad (HIT) protein  44.86 
 
 		 138 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4676  histidine triad (HIT) protein  44.86 
 
 		 138 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0370318  normal  0.851631 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3102  histidine triad (HIT) protein  39.84 
 
 		 131 aa  101  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.550311  normal  0.852173 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10774  hypothetical protein  41.67 
 
 		 133 aa  99  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5173  histidine triad (HIT) protein  42.99 
 
 		 138 aa  99  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.707443 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0826  histidine triad (HIT) protein  38.28 
 
 		 141 aa  97.1  7e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15219  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2413  histidine triad (HIT) protein  36.15 
 
 		 148 aa  92.4  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0135198 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3629  histidine triad (HIT) protein  35.16 
 
 		 133 aa  90.9  5e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1815  histidine triad (HIT) protein  39.05 
 
 		 136 aa  90.9  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0400003  normal  0.0526222 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3327  histidine triad (HIT) protein  35.43 
 
 		 139 aa  89.7  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.036152 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0381  protein kinase C1 inhibitor  38.17 
 
 		 139 aa  87  7e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3968  histidine triad (HIT) protein  33.85 
 
 		 141 aa  87  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0254  histidine triad (HIT) protein  40.59 
 
 		 145 aa  85.5  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4702  histidine triad (HIT) protein  34.09 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00557305 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1701  histidine triad (HIT) protein  33.59 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.377935 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2801  histidine triad (HIT) protein  35.61 
 
 		 139 aa  85.5  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.106273  normal  0.788809 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4476  putative histidine triad (HIT) protein  32.31 
 
 		 141 aa  84.3  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000626279 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2633  histidine triad (HIT) protein  35.16 
 
 		 142 aa  83.6  8e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00206121  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4014  histidine triad (HIT) protein  37.98 
 
 		 137 aa  83.6  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1740  histidine triad protein  37.31 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2539  histidine triad (HIT) protein  37.4 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0492  HIT family protein  39.6 
 
 		 138 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1579  HIT family protein  38.61 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.380866  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1275  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  35.77 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2559  HIT family protein  38.61 
 
 		 138 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.609142  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1382  HIT family protein  38.61 
 
 		 138 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0207  HIT family protein  38.61 
 
 		 138 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2703  HIT family protein  38.61 
 
 		 138 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0979  HIT family protein  38.61 
 
 		 138 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.721312  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0238  HIT family protein  38.61 
 
 		 138 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0206  histidine triad (HIT) protein  36.15 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.577034 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2368  histidine triad (HIT) protein  32.81 
 
 		 142 aa  80.5  0.000000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000014225 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0579  histidine triad domain-containing protein  34.85 
 
 		 140 aa  80.1  0.000000000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0235717  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4823  histidine triad (HIT) protein  35.38 
 
 		 139 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.784878 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5415  histidine triad (HIT) protein  35.38 
 
 		 139 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.269942  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5446  histidine triad (HIT) protein  35.38 
 
 		 139 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.311796 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1970  histidine triad (HIT) protein  37.76 
 
 		 146 aa  79.7  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.939838  hitchhiker  0.0000383714 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0494  putative HIT-like protein  33.59 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3726  histidine triad (HIT) protein  33.08 
 
 		 138 aa  79.3  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21440  putative HIT family protein  37.04 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.117632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1228  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  33.57 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0892724  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3416  histidine triad  33.11 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.621229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3753  histidine triad (HIT) protein  34.59 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3517  hypothetical protein  33.11 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.810284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1829  putative HIT family protein  36.72 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3422  histidine triad  33.11 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0952  histidine triad (HIT) protein  41.58 
 
 		 143 aa  79  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000117681  hitchhiker  0.00115812 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3351  histidine triad  33.11 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.814063 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4791  histidine triad (HIT) protein  34.62 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5333  histidine triad (HIT) protein  34.62 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0096  histidine triad (HIT) protein  36.09 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2451  histidine triad (HIT) protein  39.6 
 
 		 142 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.94056  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1302  histidine triad (HIT) protein  38.83 
 
 		 146 aa  77.8  0.00000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1561  histidine triad (HIT) protein  34.35 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1531  histidine triad (HIT) protein  35.88 
 
 		 136 aa  77.4  0.00000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1749  histidine triad (HIT) protein  36.57 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1076  histidine triad (HIT) protein  39.81 
 
 		 146 aa  77.4  0.00000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.179252 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0006  histidine triad (HIT) protein  36.09 
 
 		 142 aa  77  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0070148  unclonable  0.000000000279381 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0781  histidine triad (HIT) protein  31.01 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0211  histidine triad (HIT) protein  35.64 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0075  histidine triad (HIT) protein  33.83 
 
 		 138 aa  74.7  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  0.167835 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1573  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  39.22 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0370  HIT family protein  38 
 
 		 139 aa  73.9  0.0000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3139  histidine triad (HIT) protein  35.82 
 
 		 143 aa  73.9  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0448341 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0519  histidine triad nucleotide-binding protein 2 (hint-2)(hint-3)  40.78 
 
 		 117 aa  73.9  0.0000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07820  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  31.37 
 
 		 142 aa  73.6  0.0000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1574  histidine triad (HIT) protein  34.59 
 
 		 141 aa  73.6  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.650242  normal  0.227098 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4709  histidine triad (HIT) protein  38.78 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1532  histidine triad (HIT) protein  31.01 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.77898  normal  0.453293 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0746  histidine triad (HIT) protein  37.62 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00337572 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2416  histidine triad (HIT) protein  39.22 
 
 		 146 aa  72  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0525465  normal  0.0378675 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2848  histidine triad (HIT) protein  38 
 
 		 136 aa  72.8  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2683  histidine triad (HIT) protein  29.2 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0608  histidine triad (HIT) protein  41.41 
 
 		 118 aa  71.6  0.000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1444  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  33.58 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000339612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1925  histidine triad (HIT) protein  37.17 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3549  histidine triad (HIT) protein  36.54 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276085  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1891  histidine triad (HIT) protein  37.17 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.472953  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4498  histidine triad (HIT) protein  34.65 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1461  histidine triad (HIT) protein  34.07 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1771  histidine triad (HIT) protein  32.33 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3136  histidine triad (HIT) protein  34.26 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.186474  normal  0.519956 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0788  histidine triad (HIT) protein  32.81 
 
 		 455 aa  70.1  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.864692  normal  0.369294 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1263  histidine triad (HIT) protein  35.34 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000437908  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0596  histidine triad (HIT) protein  39.42 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3878  histidine triad (HIT) protein  26.77 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000287053  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>