More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4584 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4584  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 		 129 aa  260  4e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000842385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1055  histidine triad (HIT) protein  74.42 
 
 		 130 aa  176  8e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1591  histidine triad (HIT) protein  62.02 
 
 		 129 aa  174  5e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3809  histidine triad (HIT) protein  57.69 
 
 		 133 aa  160  6e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.197548  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01700  HIT family protein  55.04 
 
 		 129 aa  157  3e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127711  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3302  HIT family protein  54.26 
 
 		 131 aa  151  2.9999999999999998e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2900  histidine triad (HIT) protein  54.26 
 
 		 131 aa  151  2.9999999999999998e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.276504  normal  0.0712491 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1632  HIT family protein  53.85 
 
 		 130 aa  150  5.9999999999999996e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0437202  hitchhiker  0.00568101 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0302  histidine triad (HIT) protein  52.8 
 
 		 128 aa  150  5.9999999999999996e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1687  HIT family protein  53.97 
 
 		 129 aa  147  5e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.833443 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0732  hypothetical protein  51.97 
 
 		 132 aa  147  6e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1241  histidine triad (HIT) protein  49.22 
 
 		 131 aa  143  9e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3102  histidine triad (HIT) protein  41.54 
 
 		 131 aa  100  6e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.550311  normal  0.852173 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0826  histidine triad (HIT) protein  41.54 
 
 		 141 aa  99  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15219  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3629  histidine triad (HIT) protein  39.45 
 
 		 133 aa  99  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07820  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  41.28 
 
 		 142 aa  95.5  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1701  histidine triad (HIT) protein  36.15 
 
 		 143 aa  95.5  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.377935 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4676  histidine triad (HIT) protein  36.92 
 
 		 138 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0370318  normal  0.851631 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5173  histidine triad (HIT) protein  37.69 
 
 		 138 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.707443 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4588  histidine triad (HIT) protein  36.92 
 
 		 138 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4971  histidine triad (HIT) protein  36.92 
 
 		 138 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1583  histidine triad (HIT) protein  38.46 
 
 		 134 aa  92  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1740  histidine triad protein  38.81 
 
 		 139 aa  92  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10774  hypothetical protein  36.72 
 
 		 133 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2633  histidine triad (HIT) protein  37.69 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00206121  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1815  histidine triad (HIT) protein  33.08 
 
 		 136 aa  87.8  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0400003  normal  0.0526222 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0096  histidine triad (HIT) protein  38.69 
 
 		 139 aa  84.7  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2169  histidine triad (HIT) protein  34.56 
 
 		 140 aa  79.3  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3399  histidine triad (HIT) protein  37.12 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.163397  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1749  histidine triad (HIT) protein  42.72 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1025  histidine triad (HIT) protein  34.33 
 
 		 135 aa  78.2  0.00000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1531  histidine triad (HIT) protein  34.33 
 
 		 136 aa  77  0.00000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4014  histidine triad (HIT) protein  35.07 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1444  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  32.12 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000339612  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2413  histidine triad (HIT) protein  34.09 
 
 		 148 aa  76.6  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0135198 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1050  histidine triad (HIT) protein  36.84 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.265499  normal  0.307581 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0381  protein kinase C1 inhibitor  32.35 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1228  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  36.69 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0892724  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0832  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 141 aa  75.9  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1275  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  33.33 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2368  histidine triad (HIT) protein  32.31 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000014225 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3351  histidine triad  34.9 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.814063 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3422  histidine triad  34.9 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3517  hypothetical protein  34.9 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.810284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3416  histidine triad  34.9 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.621229  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0370  HIT family protein  34.81 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3185  histidine triad (HIT) protein  33.59 
 
 		 136 aa  73.9  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3726  histidine triad (HIT) protein  32.84 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2280  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  34.88 
 
 		 132 aa  72  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1573  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  36.45 
 
 		 139 aa  72.4  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0254  histidine triad (HIT) protein  34.15 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1342  histidine triad (HIT) protein  42 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0075  histidine triad (HIT) protein  41.6 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1333  histidine triad (HIT) protein  41 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0568524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4702  histidine triad (HIT) protein  31.06 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00557305 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1970  histidine triad (HIT) protein  33.94 
 
 		 146 aa  70.5  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.939838  hitchhiker  0.0000383714 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3968  histidine triad (HIT) protein  31.54 
 
 		 141 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0006  histidine triad (HIT) protein  36.03 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0070148  unclonable  0.000000000279381 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0620  histidine triad (HIT) protein  42 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.693859  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1342  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4476  putative histidine triad (HIT) protein  30.77 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000626279 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2926  histidine triad (HIT) protein  34.09 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2151  histidine triad (HIT) protein  41.67 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.14674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2801  histidine triad (HIT) protein  33.85 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.106273  normal  0.788809 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0781  histidine triad (HIT) protein  37.04 
 
 		 135 aa  69.3  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0596  histidine triad (HIT) protein  31.3 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4498  histidine triad (HIT) protein  37.74 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1783  histidine triad (HIT) protein  31.03 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.344857  normal  0.911997 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0075  histidine triad (HIT) protein  35.07 
 
 		 138 aa  68.2  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  0.167835 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0952  histidine triad (HIT) protein  34.95 
 
 		 143 aa  67  0.00000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000117681  hitchhiker  0.00115812 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0919  histidine triad (HIT) protein  29.1 
 
 		 140 aa  67  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.420438  normal  0.191843 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1382  HIT family protein  34.31 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0494  putative HIT-like protein  30.47 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0207  HIT family protein  34.31 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2237  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0979  HIT family protein  34.31 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.721312  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0644  histidine triad (HIT) protein  35.29 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0492  HIT family protein  34.31 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2559  HIT family protein  34.31 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.609142  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0862  histidine triad (HIT) protein  29.93 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.379989  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1579  HIT family protein  34.31 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.380866  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21440  putative HIT family protein  33.83 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.117632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0238  HIT family protein  34.31 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0608  histidine triad (HIT) protein  40.82 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2703  HIT family protein  34.31 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2024  histidine triad (HIT) protein  32.35 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2135  histidine triad (HIT) protein  32.58 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.605825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4709  histidine triad (HIT) protein  34.95 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3349  histidine triad (HIT) protein  37.5 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425203 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1263  histidine triad (HIT) protein  37.04 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000437908  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1461  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1076  histidine triad (HIT) protein  31.25 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.179252 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4665  histidine triad (HIT) protein  34.85 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0394805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2683  histidine triad (HIT) protein  35.29 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4028  histidine triad (HIT) protein  32.52 
 
 		 143 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1993  histidine triad (HIT) protein  35.04 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3954  histidine triad (HIT) protein  32.52 
 
 		 143 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4689  histidine triad (HIT) protein  37.04 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0956525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4837  histidine triad (HIT) protein  34.07 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0161096  normal  0.332557 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1284  histidine triad (HIT) protein  30.83 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>