More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A3351 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A3517  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  317  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.810284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3422  histidine triad  100 
 
 		 151 aa  317  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3416  histidine triad  100 
 
 		 151 aa  317  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.621229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3351  histidine triad  100 
 
 		 151 aa  317  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.814063 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4709  histidine triad (HIT) protein  65.56 
 
 		 153 aa  227  3e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1911  hypothetical protein  58.55 
 
 		 157 aa  192  1e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0579038  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5152  histidine triad (HIT) protein  63.33 
 
 		 154 aa  190  5e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760188 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0302  histidine triad (HIT) protein  33.11 
 
 		 128 aa  79  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01700  HIT family protein  35.83 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127711  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1531  histidine triad (HIT) protein  40.74 
 
 		 136 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2848  histidine triad (HIT) protein  35.65 
 
 		 136 aa  75.9  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2151  histidine triad (HIT) protein  36.28 
 
 		 146 aa  75.1  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.14674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3753  histidine triad (HIT) protein  35.29 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4584  histidine triad (HIT) protein  34.9 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000842385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1740  histidine triad protein  38.24 
 
 		 139 aa  73.9  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0732  hypothetical protein  34.71 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4837  histidine triad (HIT) protein  36.13 
 
 		 140 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0161096  normal  0.332557 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0814  histidine triad (HIT) protein  38.71 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1461  histidine triad (HIT) protein  36.84 
 
 		 143 aa  72  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2926  histidine triad (HIT) protein  34.84 
 
 		 149 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1591  histidine triad (HIT) protein  32.5 
 
 		 129 aa  72  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1687  HIT family protein  35.58 
 
 		 129 aa  70.5  0.000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.833443 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1055  histidine triad (HIT) protein  33.6 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0254  histidine triad (HIT) protein  37.04 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2683  histidine triad (HIT) protein  36.79 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11288  HIT family protein  44.29 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.750453  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1151  HIT family protein  37.6 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0966  HIT family protein  37.6 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0957  HIT family protein  37.6 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4320  histidine triad (HIT) protein  35.06 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0862778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3302  HIT family protein  37.04 
 
 		 131 aa  70.1  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2900  histidine triad (HIT) protein  37.04 
 
 		 131 aa  70.1  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.276504  normal  0.0712491 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3809  histidine triad (HIT) protein  38.89 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.197548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1212  HIT family protein  37.6 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1124  HIT family protein  37.6 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2633  histidine triad (HIT) protein  33.02 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00206121  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0644  histidine triad (HIT) protein  39.81 
 
 		 140 aa  70.1  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1083  HIT family protein  37.6 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4221  HIT family protein  37.6 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.071329  normal  0.0179678 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1829  putative HIT family protein  37.62 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4689  histidine triad (HIT) protein  35.06 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0956525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21440  putative HIT family protein  37.62 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.117632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1241  histidine triad (HIT) protein  30.28 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0832  histidine triad (HIT) protein  33.85 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0962  histidine triad (HIT) protein  36.8 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0620  histidine triad (HIT) protein  36.63 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.693859  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1342  histidine triad (HIT) protein  35.64 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1333  histidine triad (HIT) protein  38.24 
 
 		 130 aa  67  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0568524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1532  histidine triad (HIT) protein  35.64 
 
 		 145 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.77898  normal  0.453293 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5173  histidine triad (HIT) protein  33.02 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.707443 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0494  putative HIT-like protein  32.82 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4676  histidine triad (HIT) protein  33.02 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0370318  normal  0.851631 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4971  histidine triad (HIT) protein  33.02 
 
 		 138 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0781  histidine triad (HIT) protein  36.75 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4588  histidine triad (HIT) protein  33.02 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2539  histidine triad (HIT) protein  30.97 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2237  histidine triad (HIT) protein  34.68 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1583  histidine triad (HIT) protein  33.02 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0978  HIT family protein  36.8 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1047  HIT family protein  36.8 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1632  HIT family protein  32.43 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0437202  hitchhiker  0.00568101 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4702  histidine triad (HIT) protein  31.3 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00557305 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1342  histidine triad (HIT) protein  35.64 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4456  histidine triad (HIT) protein  44.29 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2451  histidine triad (HIT) protein  37.31 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.94056  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1561  histidine triad (HIT) protein  32.35 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0596  histidine triad (HIT) protein  34.29 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1573  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  32.74 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2239  histidine triad (HIT) protein  44.29 
 
 		 145 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.640796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1376  histidine triad (HIT) protein  34.78 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.341423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3102  histidine triad (HIT) protein  31.79 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.550311  normal  0.852173 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1701  histidine triad (HIT) protein  33.02 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.377935 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4014  histidine triad (HIT) protein  36.75 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0004  histidine triad (HIT) protein  32.56 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0275782 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4028  histidine triad (HIT) protein  36.26 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3954  histidine triad (HIT) protein  36.26 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3549  histidine triad (HIT) protein  34.91 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276085  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3968  histidine triad (HIT) protein  36.26 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.777319  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4498  histidine triad (HIT) protein  33.91 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2280  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  35.19 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0826  histidine triad (HIT) protein  34 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15219  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0006  histidine triad (HIT) protein  33.57 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0070148  unclonable  0.000000000279381 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0746  histidine triad (HIT) protein  33.06 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00337572 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1783  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 		 148 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.344857  normal  0.911997 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06270  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  43.28 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0484184  normal  0.0161272 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1125  HIT family protein  36.27 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.20711  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1168  HIT family protein  36.27 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.247304  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2801  histidine triad (HIT) protein  33.03 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.106273  normal  0.788809 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2416  histidine triad (HIT) protein  34.43 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0525465  normal  0.0378675 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3139  histidine triad (HIT) protein  30.07 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0448341 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0211  histidine triad (HIT) protein  36.89 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2368  histidine triad (HIT) protein  29.09 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000014225 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3327  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.036152 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1970  histidine triad (HIT) protein  28.3 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.939838  hitchhiker  0.0000383714 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1302  histidine triad (HIT) protein  32.41 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3968  histidine triad (HIT) protein  32.45 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3108  histidine triad (HIT) protein  32.56 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1805  histidine triad (HIT) protein  36.9 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.496797 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0075  histidine triad (HIT) protein  35.04 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  0.167835 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2454  histidine triad (HIT) protein  32.56 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.832288  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>