118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5046 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_5046  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 		 143 aa  296  6e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1579  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 		 166 aa  134  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.28646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2534  HIT family protein  36.46 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.91947  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0579  histidine triad domain-containing protein  30 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0235717  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3753  histidine triad (HIT) protein  34.82 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1574  histidine triad (HIT) protein  31.86 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.650242  normal  0.227098 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2416  histidine triad (HIT) protein  33.04 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0525465  normal  0.0378675 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2807  histidine triad (HIT) protein  33.04 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4837  histidine triad (HIT) protein  33.04 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0161096  normal  0.332557 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3046  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1771  histidine triad (HIT) protein  32.99 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1376  histidine triad (HIT) protein  31.43 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1749  histidine triad (HIT) protein  31.75 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2683  histidine triad (HIT) protein  37.33 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3316  histidine triad (HIT) protein  30.43 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.33287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0096  histidine triad (HIT) protein  32.54 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2405  histidine triad (HIT) protein  31.25 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.112602  normal  0.457991 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0302  histidine triad (HIT) protein  30.16 
 
 		 128 aa  53.5  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2451  histidine triad (HIT) protein  29.06 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.94056  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0381  protein kinase C1 inhibitor  35.56 
 
 		 139 aa  52  0.000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4689  histidine triad (HIT) protein  31.25 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0956525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4709  histidine triad (HIT) protein  26.09 
 
 		 153 aa  51.6  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2024  histidine triad (HIT) protein  31.25 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4320  histidine triad (HIT) protein  31.53 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0862778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5173  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.707443 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0927  HIT family hydrolase  30.43 
 
 		 162 aa  51.2  0.000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0494  putative HIT-like protein  29.77 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2290  histidine triad (HIT) protein  32.63 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4702  histidine triad (HIT) protein  29.77 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00557305 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2890  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 139 aa  50.4  0.000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0726  histidine triad (HIT) protein  32.58 
 
 		 145 aa  50.4  0.000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1911  hypothetical protein  27.86 
 
 		 157 aa  49.7  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0579038  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1125  HIT family protein  31.25 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.20711  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1102  hypothetical protein  30.34 
 
 		 176 aa  49.7  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.545015 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0826  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15219  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1168  HIT family protein  31.25 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.247304  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0254  histidine triad (HIT) protein  30.77 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3549  histidine triad (HIT) protein  30.21 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276085  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1076  histidine triad (HIT) protein  28 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.179252 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3878  histidine triad (HIT) protein  29.17 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000287053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2926  histidine triad (HIT) protein  32.43 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1292  histidine triad (HIT) protein  28.42 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.268815  normal  0.885199 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2801  histidine triad (HIT) protein  29.17 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.106273  normal  0.788809 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4588  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 138 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2126  histidine triad (HIT) protein  32.56 
 
 		 166 aa  47.4  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712705 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4676  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 138 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0370318  normal  0.851631 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4971  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 138 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0211  histidine triad (HIT) protein  26.13 
 
 		 145 aa  47  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3422  histidine triad  27.54 
 
 		 151 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3416  histidine triad  27.54 
 
 		 151 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.621229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3351  histidine triad  27.54 
 
 		 151 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.814063 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3517  hypothetical protein  27.54 
 
 		 151 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.810284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0141  histidine triad (HIT) protein  35.29 
 
 		 144 aa  47  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0746  histidine triad (HIT) protein  31.15 
 
 		 145 aa  47  0.00009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00337572 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3108  histidine triad (HIT) protein  32.58 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1829  putative HIT family protein  29.6 
 
 		 145 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2145  histidine triad (HIT) protein  30.68 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2454  histidine triad (HIT) protein  32.58 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.832288  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1302  histidine triad (HIT) protein  27.42 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0004  histidine triad (HIT) protein  29.55 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0275782 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1531  histidine triad (HIT) protein  30.85 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0929  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  32.18 
 
 		 126 aa  45.4  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.685079  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1376  histidine triad (HIT) protein  27.96 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.341423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1583  histidine triad (HIT) protein  30.95 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4085  putative HIT family protein  31.91 
 
 		 153 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0338  histidine triad (HIT) protein  31.68 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.02755e-33 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1701  histidine triad (HIT) protein  31.03 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.377935 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5939  histidine triad (HIT) protein  29.17 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0338384  normal  0.653892 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1740  histidine triad protein  31.52 
 
 		 139 aa  45.1  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47340  putative HIT family protein  31.91 
 
 		 153 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0531  histidine triad (HIT) protein  30.77 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.406416  normal  0.0183035 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1505  histidine triad (HIT) protein  30.26 
 
 		 146 aa  44.7  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1815  histidine triad (HIT) protein  30.47 
 
 		 136 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0400003  normal  0.0526222 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3136  histidine triad (HIT) protein  27.68 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.186474  normal  0.519956 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21440  putative HIT family protein  28 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.117632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0620  histidine triad (HIT) protein  25.38 
 
 		 163 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00610052  hitchhiker  0.000000200539 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1183  histidine triad (HIT) protein  26.09 
 
 		 184 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.970277  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4498  histidine triad (HIT) protein  30.34 
 
 		 140 aa  43.9  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3102  histidine triad (HIT) protein  27.56 
 
 		 131 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.550311  normal  0.852173 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0952  histidine triad (HIT) protein  30.43 
 
 		 143 aa  43.9  0.0008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000117681  hitchhiker  0.00115812 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6333  histidine triad (HIT) protein  32.18 
 
 		 142 aa  43.9  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303729  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4052  hypothetical protein  22.73 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.663105 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0562  histidine triad (HIT) protein  31.52 
 
 		 167 aa  43.5  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1805  histidine triad (HIT) protein  23.91 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.496797 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3139  histidine triad (HIT) protein  25.2 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0448341 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2135  histidine triad (HIT) protein  32.22 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.605825  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0901  hypothetical protein  25.95 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000619328  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3629  histidine triad (HIT) protein  33.72 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0372  histidine triad (HIT) protein  26.19 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.423054 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0647  histidine triad (HIT) protein  23.64 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.780647  normal  0.90331 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3968  histidine triad (HIT) protein  25.56 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1730  histidine triad (HIT) protein  27.27 
 
 		 117 aa  42  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.020903 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1228  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  28.26 
 
 		 140 aa  42  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0892724  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3327  histidine triad (HIT) protein  27.55 
 
 		 139 aa  41.6  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.036152 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1614  histidine triad (HIT) protein  24.26 
 
 		 139 aa  42  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2345  histidine triad (HIT) protein  30.77 
 
 		 165 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1522  histidine triad (HIT) protein  30.77 
 
 		 165 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.311815  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14523  predicted protein  30.23 
 
 		 160 aa  41.2  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0565  histidine triad (HIT) protein  26.83 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.419431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2433  histidine triad (HIT) protein  30.77 
 
 		 165 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106121  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>