214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0647 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0647  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 
142 aa  291  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.780647  normal  0.90331 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4052  hypothetical protein  96.48 
 
 
142 aa  281  3.0000000000000004e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.663105 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0372  histidine triad (HIT) protein  88.65 
 
 
142 aa  258  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.423054 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0551  HIT domain-containing protein  75.52 
 
 
152 aa  224  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2122  histidine triad (HIT) protein  75.54 
 
 
147 aa  221  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.427523  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2734  histidine triad (HIT) protein  75.54 
 
 
147 aa  221  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587938  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2761  histidine triad (HIT) protein  75.54 
 
 
147 aa  221  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2652  histidine triad (HIT) protein  75.54 
 
 
147 aa  221  4e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.627712  normal  0.962372 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2785  histidine triad (HIT) protein  75.54 
 
 
147 aa  221  4e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.804661  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0184  hypothetical protein  73.43 
 
 
152 aa  220  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0843  HIT family hydrolase  73.43 
 
 
152 aa  220  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2762  HIT domain-containing protein  73.43 
 
 
152 aa  220  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0604748  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2316  HIT domain-containing protein  73.43 
 
 
152 aa  220  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.529616  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0665  HIT domain-containing protein  73.43 
 
 
152 aa  220  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0681  HIT domain-containing protein  73.43 
 
 
152 aa  220  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2396  HIT domain-containing protein  73.43 
 
 
152 aa  220  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0565  histidine triad (HIT) protein  74.82 
 
 
147 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.419431  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6061  histidine triad (HIT) protein  74.1 
 
 
147 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1505  histidine triad (HIT) protein  50.35 
 
 
146 aa  155  2e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0218  hypothetical protein  52.52 
 
 
142 aa  142  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.181658 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0368  histidine triad (HIT) protein  48.48 
 
 
144 aa  142  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.462248  normal  0.925731 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2506  histidine triad (HIT) protein  49.24 
 
 
153 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0428  histidine triad (HIT) protein  45.8 
 
 
141 aa  137  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0976831  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4120  histidine triad (HIT) protein  47.79 
 
 
143 aa  135  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0330  histidine triad (HIT) protein  48.57 
 
 
145 aa  135  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0832  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0779  histidine triad (HIT) protein  45.99 
 
 
142 aa  135  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0457  histidine triad (HIT) protein  43.88 
 
 
146 aa  134  4e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0128148  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0865  histidine triad (HIT) protein  49.3 
 
 
163 aa  134  5e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.577446  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0345  histidine triad (HIT) protein  48.85 
 
 
150 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.598088  normal  0.426855 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0794  histidine triad (HIT) protein  49.3 
 
 
158 aa  133  9e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528382  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4131  histidine triad (HIT) protein  55.56 
 
 
145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.190525  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3647  histidine triad (HIT) protein  54.87 
 
 
148 aa  131  3.9999999999999996e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.623715  normal  0.697861 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0455  hypothetical protein  46.67 
 
 
147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0119  histidine triad (HIT) protein  43.09 
 
 
140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1289  histidine triad (HIT) protein  52.68 
 
 
147 aa  125  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0230  histidine triad (HIT) protein  50.89 
 
 
139 aa  123  7e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5463  histidine triad (HIT) protein  55.86 
 
 
151 aa  121  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.189443  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2737  hypothetical protein  52.21 
 
 
147 aa  121  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0586419 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3617  histidine triad (HIT) protein  36.97 
 
 
144 aa  84.7  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2993  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 
138 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000103081  normal  0.516918 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0530  HIT family protein  44.32 
 
 
139 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.335836  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3912  histidine triad (HIT) protein  38.05 
 
 
142 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000268802  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0338  histidine triad (HIT) protein  33.09 
 
 
140 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.02755e-33 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0380  HIT family protein  36.51 
 
 
123 aa  77.8  0.00000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.754034  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0357  histidine triad (HIT) protein  31.94 
 
 
140 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00612046  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3237  histidine triad (HIT) protein  32.76 
 
 
139 aa  75.1  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1920  HIT family protein  37.11 
 
 
123 aa  72.8  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1291  HIT family protein  44.93 
 
 
122 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.691184  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3073  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase  33.33 
 
 
139 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000547688  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1691  HIT family protein  30.51 
 
 
124 aa  67  0.00000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2441  histidine triad (HIT) protein  36.78 
 
 
140 aa  66.2  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.132009  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0423  HIT family hydrolase  30.83 
 
 
124 aa  64.7  0.0000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1537  HIT family protein  31.31 
 
 
123 aa  64.7  0.0000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0461  histidine triad (HIT) protein  38.64 
 
 
138 aa  64.7  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0468  HIT family protein  31.96 
 
 
120 aa  63.5  0.0000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.106154  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0442  HIT family protein  31.96 
 
 
120 aa  63.5  0.0000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1138  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  27.42 
 
 
142 aa  63.5  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0263958  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0370  histidine triad (HIT) protein  36.36 
 
 
138 aa  62  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.673964 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0669  histidine triad (HIT) protein  37.5 
 
 
138 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0088  histidine triad (HIT) protein  36.36 
 
 
161 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.348291  normal  0.0668606 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7347  hypothetical protein  35.23 
 
 
139 aa  61.6  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1768  HIT family protein  27.64 
 
 
122 aa  60.5  0.000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1261  histidine triad (HIT) protein  32.95 
 
 
143 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0545124  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18650  histidine triad (HIT) family protein  34.09 
 
 
141 aa  58.9  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4417  histidine triad (HIT) protein  32.95 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00244718  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0618  histidine triad (HIT) protein  35.23 
 
 
139 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.619143  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2685  histidine triad (HIT) protein  31.82 
 
 
135 aa  58.2  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.934104  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4008  histidine triad (HIT) protein  34.09 
 
 
165 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3986  hypothetical protein  30.68 
 
 
143 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0356527  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4849  histidine triad (HIT) protein  35.23 
 
 
139 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104991  normal  0.870904 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1401  histidine triad (HIT) protein  31.11 
 
 
143 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.541573  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0082  HIT family protein  34.62 
 
 
126 aa  57  0.00000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0702  hydrolase, HIT family  26.06 
 
 
144 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1048  histidine triad (HIT) protein  32.61 
 
 
137 aa  57  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.136733  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1667  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 
137 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.619204 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0556  HIT (histidine triad) family protein  26.06 
 
 
144 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000140034  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4912  histidine triad (HIT) protein  32.97 
 
 
138 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.363403  normal  0.678464 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1236  histidine triad (HIT) protein  30.68 
 
 
139 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4448  histidine triad (HIT) protein  32.97 
 
 
138 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.678684 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2539  histidine triad (HIT) protein  30.82 
 
 
139 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4211  histidine triad (HIT) protein  29.55 
 
 
139 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1207  histidine triad (HIT) protein  29.55 
 
 
139 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6100  histidine triad (HIT) protein  34.09 
 
 
374 aa  55.1  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00945728  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0612  HIT family protein  29.81 
 
 
145 aa  54.3  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000194995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0645  HIT family protein  29.81 
 
 
144 aa  54.3  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710246  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4657  HIT family protein  24.65 
 
 
144 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000190744  hitchhiker  3.0087100000000003e-24 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0774  HIT family protein  27.78 
 
 
144 aa  53.5  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000367298  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4962  histidine triad (HIT) protein  30.77 
 
 
138 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0265226  normal  0.0774828 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2873  histidine triad (HIT) protein  26.36 
 
 
141 aa  53.1  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.635304  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0381  protein kinase C1 inhibitor  30 
 
 
139 aa  53.5  0.000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51860  hypothetical protein  30.17 
 
 
209 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.393091  hitchhiker  0.00413081 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02549  putative HIT family hydrolase  27.27 
 
 
111 aa  53.1  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0406  histidine triad (HIT) protein  26.45 
 
 
140 aa  52.8  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2174  hypothetical protein  29.2 
 
 
141 aa  53.5  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4549  hypothetical protein  32.95 
 
 
142 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.498263  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0557  hydrolase HIT family  28.85 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000022236  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0494  hypothetical protein  30.23 
 
 
137 aa  52.4  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004101  histidine triad family protein  29.9 
 
 
142 aa  52  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000876238  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2901  histidine triad (HIT) protein  28.1 
 
 
146 aa  52.8  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0749971  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1663  histidine triad (HIT) protein  27.36 
 
 
143 aa  52  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0109838 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>