273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3237 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_3237  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 
139 aa  291  3e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3912  histidine triad (HIT) protein  67.16 
 
 
142 aa  200  7e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000268802  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0530  HIT family protein  67.91 
 
 
139 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.335836  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2993  histidine triad (HIT) protein  65.41 
 
 
138 aa  191  3e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000103081  normal  0.516918 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0338  histidine triad (HIT) protein  61.65 
 
 
140 aa  189  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.02755e-33 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3617  histidine triad (HIT) protein  61.65 
 
 
144 aa  186  5.999999999999999e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0357  histidine triad (HIT) protein  60.15 
 
 
140 aa  185  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00612046  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3073  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase  62.69 
 
 
139 aa  183  9e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000547688  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0901  hypothetical protein  36.36 
 
 
151 aa  86.3  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000619328  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0618  histidine triad (HIT) protein  32.61 
 
 
139 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.619143  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1138  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  38.3 
 
 
142 aa  82.8  0.000000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0263958  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4120  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 
143 aa  82  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004101  histidine triad family protein  38.18 
 
 
142 aa  81.6  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000876238  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2761  histidine triad (HIT) protein  35.34 
 
 
147 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2506  histidine triad (HIT) protein  37.04 
 
 
153 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0047  histidine triad (HIT) protein  30.41 
 
 
164 aa  79.7  0.00000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2122  histidine triad (HIT) protein  35.34 
 
 
147 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.427523  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2734  histidine triad (HIT) protein  35.34 
 
 
147 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587938  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0565  histidine triad (HIT) protein  35.34 
 
 
147 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.419431  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2174  hypothetical protein  37.63 
 
 
141 aa  78.6  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01367  hypothetical protein  38.24 
 
 
159 aa  77.8  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0088  histidine triad (HIT) protein  34.71 
 
 
161 aa  77.4  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.348291  normal  0.0668606 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0665  HIT domain-containing protein  33.62 
 
 
152 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2762  HIT domain-containing protein  33.62 
 
 
152 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0604748  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1667  histidine triad (HIT) protein  43.96 
 
 
137 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.619204 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0184  hypothetical protein  33.62 
 
 
152 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0843  HIT family hydrolase  33.62 
 
 
152 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0681  HIT domain-containing protein  33.62 
 
 
152 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2396  HIT domain-containing protein  33.62 
 
 
152 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2316  HIT domain-containing protein  33.62 
 
 
152 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.529616  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0559  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase  37.82 
 
 
128 aa  77  0.00000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.344449 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0779  histidine triad (HIT) protein  35.29 
 
 
142 aa  77.4  0.00000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0457  histidine triad (HIT) protein  39.08 
 
 
146 aa  76.3  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0128148  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2336  histidine triad (HIT) protein  35.51 
 
 
147 aa  76.6  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.6925  decreased coverage  0.00924855 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0551  HIT domain-containing protein  33.62 
 
 
152 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2785  histidine triad (HIT) protein  34.48 
 
 
147 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.804661  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2652  histidine triad (HIT) protein  34.48 
 
 
147 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.627712  normal  0.962372 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6061  histidine triad (HIT) protein  40.51 
 
 
147 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4052  hypothetical protein  32.76 
 
 
142 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.663105 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1048  histidine triad (HIT) protein  34.81 
 
 
137 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.136733  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0647  histidine triad (HIT) protein  32.76 
 
 
142 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.780647  normal  0.90331 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1505  histidine triad (HIT) protein  36.61 
 
 
146 aa  75.1  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4849  histidine triad (HIT) protein  35 
 
 
139 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104991  normal  0.870904 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0119  histidine triad (HIT) protein  36.36 
 
 
140 aa  74.7  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0494  hypothetical protein  36.26 
 
 
137 aa  74.7  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0470  hypothetical protein  36.26 
 
 
143 aa  73.9  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7347  hypothetical protein  32.79 
 
 
139 aa  73.9  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3647  histidine triad (HIT) protein  37.38 
 
 
148 aa  73.9  0.0000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.623715  normal  0.697861 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2737  hypothetical protein  32.73 
 
 
147 aa  73.6  0.0000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0586419 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1662  histidine triad family protein  36.36 
 
 
147 aa  73.6  0.0000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0230  histidine triad (HIT) protein  36.96 
 
 
139 aa  72.8  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0370  histidine triad (HIT) protein  31.5 
 
 
138 aa  72.8  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.673964 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0865  histidine triad (HIT) protein  33.03 
 
 
163 aa  72.8  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.577446  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0669  histidine triad (HIT) protein  33.88 
 
 
138 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0372  histidine triad (HIT) protein  31.39 
 
 
142 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.423054 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0330  histidine triad (HIT) protein  33.91 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0832  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0109  hypothetical protein  39 
 
 
147 aa  73.2  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.648306  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4211  histidine triad (HIT) protein  34.88 
 
 
139 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6100  histidine triad (HIT) protein  37.5 
 
 
374 aa  72.8  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00945728  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0218  hypothetical protein  36.78 
 
 
142 aa  72.8  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.181658 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0345  histidine triad (HIT) protein  33.04 
 
 
150 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.598088  normal  0.426855 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0794  histidine triad (HIT) protein  33.03 
 
 
158 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528382  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1236  histidine triad (HIT) protein  30.91 
 
 
139 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0368  histidine triad (HIT) protein  30.5 
 
 
144 aa  72  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.462248  normal  0.925731 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0406  histidine triad (HIT) protein  29.75 
 
 
140 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4131  histidine triad (HIT) protein  41.77 
 
 
145 aa  70.9  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.190525  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1289  histidine triad (HIT) protein  41.77 
 
 
147 aa  70.9  0.000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4008  histidine triad (HIT) protein  33.64 
 
 
165 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1207  histidine triad (HIT) protein  33.72 
 
 
139 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0455  hypothetical protein  32.5 
 
 
147 aa  70.5  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0910  Pectate lyase/Amb allergen  34.83 
 
 
155 aa  70.5  0.000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000231178  decreased coverage  0.0000000980143 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4962  histidine triad (HIT) protein  39.08 
 
 
138 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0265226  normal  0.0774828 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3986  hypothetical protein  30.28 
 
 
143 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0356527  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0428  histidine triad (HIT) protein  31.19 
 
 
141 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0976831  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0461  histidine triad (HIT) protein  34.65 
 
 
138 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2441  histidine triad (HIT) protein  31.67 
 
 
140 aa  69.3  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.132009  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1401  histidine triad (HIT) protein  31.63 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.541573  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4417  histidine triad (HIT) protein  33.72 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00244718  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4912  histidine triad (HIT) protein  39.08 
 
 
138 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.363403  normal  0.678464 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4448  histidine triad (HIT) protein  39.08 
 
 
138 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.678684 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1261  histidine triad (HIT) protein  36.47 
 
 
143 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0545124  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4398  histidine triad (HIT) protein  34.92 
 
 
136 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2949  histidine triad (HIT) protein  34.02 
 
 
142 aa  67.4  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4078  histidine triad (HIT) protein  35.51 
 
 
136 aa  66.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18650  histidine triad (HIT) family protein  36.47 
 
 
141 aa  65.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4549  hypothetical protein  37.08 
 
 
142 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.498263  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51860  hypothetical protein  37.08 
 
 
209 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.393091  hitchhiker  0.00413081 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1704  HIT family protein  35.79 
 
 
144 aa  65.5  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.274737  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2345  histidine triad (HIT) protein  36.36 
 
 
165 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5002  histidine triad (HIT) protein  32.56 
 
 
141 aa  63.5  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.503788  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02549  putative HIT family hydrolase  30.77 
 
 
111 aa  63.5  0.0000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2867  histidine triad (HIT) protein  36.26 
 
 
140 aa  63.2  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2145  histidine triad (HIT) protein  30.43 
 
 
146 aa  62.4  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538577  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2685  histidine triad (HIT) protein  32.29 
 
 
135 aa  62.8  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.934104  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2433  histidine triad (HIT) protein  35.23 
 
 
165 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106121  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1709  histidine triad (HIT) protein  32.95 
 
 
136 aa  62.4  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00500014  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3431  histidine triad (HIT) protein  36.67 
 
 
134 aa  61.2  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1028  histidine triad (HIT) protein  34.15 
 
 
158 aa  61.6  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0201667  normal  0.147797 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2290  histidine triad (HIT) protein  36.05 
 
 
164 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0845631  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1635  histidine triad (HIT) protein  32.58 
 
 
144 aa  60.8  0.000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000235606 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>