123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2901 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2901  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 		 146 aa  293  4e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0749971  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0020  histidine triad (HIT) protein  48.09 
 
 		 134 aa  135  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.089911  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18650  histidine triad (HIT) family protein  49.24 
 
 		 141 aa  132  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4962  histidine triad (HIT) protein  53.91 
 
 		 138 aa  130  6e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0265226  normal  0.0774828 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4448  histidine triad (HIT) protein  55.75 
 
 		 138 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.678684 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4912  histidine triad (HIT) protein  55.75 
 
 		 138 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.363403  normal  0.678464 
 
 
-
 
NC_004310  BR0035  hypothetical protein  48.84 
 
 		 134 aa  129  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.132487  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2949  histidine triad (HIT) protein  48.12 
 
 		 142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0035  hypothetical protein  48.84 
 
 		 165 aa  129  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.871621  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2867  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 		 140 aa  129  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2626  histidine triad (HIT) protein  48.84 
 
 		 140 aa  128  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.815959 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1048  histidine triad (HIT) protein  48.06 
 
 		 137 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.136733  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2685  histidine triad (HIT) protein  50.43 
 
 		 135 aa  123  7e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.934104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0370  histidine triad (HIT) protein  45.24 
 
 		 138 aa  123  8.000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.673964 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4549  hypothetical protein  46.21 
 
 		 142 aa  123  9e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.498263  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3986  hypothetical protein  43.94 
 
 		 143 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0356527  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0109  hypothetical protein  45.31 
 
 		 147 aa  122  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.648306  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2294  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 		 139 aa  121  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.125873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51860  hypothetical protein  45.45 
 
 		 209 aa  120  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.393091  hitchhiker  0.00413081 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4078  histidine triad (HIT) protein  48.06 
 
 		 136 aa  120  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4058  histidine triad (HIT) protein  48.06 
 
 		 139 aa  119  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.688633  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4398  histidine triad (HIT) protein  46.51 
 
 		 136 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1261  histidine triad (HIT) protein  42.42 
 
 		 143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0545124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4211  histidine triad (HIT) protein  42.34 
 
 		 139 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1401  histidine triad (HIT) protein  44.44 
 
 		 143 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.541573  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1207  histidine triad (HIT) protein  46.79 
 
 		 139 aa  117  7e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3431  histidine triad (HIT) protein  46.56 
 
 		 134 aa  116  9e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01245  diadenosine tetraphosphate hydrolase and other HIT family hydrolase  47.62 
 
 		 144 aa  116  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.409214  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0461  histidine triad (HIT) protein  41.86 
 
 		 138 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1068  histidine triad (HIT) protein  45.04 
 
 		 137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7347  hypothetical protein  43.85 
 
 		 139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1667  histidine triad (HIT) protein  45.8 
 
 		 137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.619204 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0669  histidine triad (HIT) protein  44.19 
 
 		 138 aa  114  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1236  histidine triad (HIT) protein  45.87 
 
 		 139 aa  114  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0088  histidine triad (HIT) protein  43.41 
 
 		 161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.348291  normal  0.0668606 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0618  histidine triad (HIT) protein  44.19 
 
 		 139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.619143  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1686  histidine triad (HIT) protein  47.37 
 
 		 159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4417  histidine triad (HIT) protein  41.09 
 
 		 144 aa  110  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00244718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6100  histidine triad (HIT) protein  43.41 
 
 		 374 aa  110  8.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00945728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2336  histidine triad (HIT) protein  40.15 
 
 		 147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.6925  decreased coverage  0.00924855 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4008  histidine triad (HIT) protein  39.39 
 
 		 165 aa  107  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1663  histidine triad (HIT) protein  45.45 
 
 		 143 aa  106  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0109838 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1635  histidine triad (HIT) protein  45.45 
 
 		 144 aa  106  1e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235606 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1483  histidine triad (HIT) family protein  44.55 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0478904 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4849  histidine triad (HIT) protein  41.09 
 
 		 139 aa  104  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104991  normal  0.870904 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1709  histidine triad (HIT) protein  45.87 
 
 		 136 aa  102  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00500014  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1662  histidine triad family protein  42.97 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0687  hypothetical protein  40.94 
 
 		 147 aa  99.8  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004101  histidine triad family protein  40.46 
 
 		 142 aa  99.4  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000876238  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1085  histidine triad (HIT) protein  46.73 
 
 		 139 aa  100  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.986739 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5002  histidine triad (HIT) protein  38.81 
 
 		 141 aa  99  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.503788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0910  Pectate lyase/Amb allergen  36.03 
 
 		 155 aa  98.2  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000231178  decreased coverage  0.0000000980143 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01367  hypothetical protein  39.69 
 
 		 159 aa  98.6  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2441  histidine triad (HIT) protein  39.55 
 
 		 140 aa  96.7  9e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.132009  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1704  HIT family protein  33.59 
 
 		 144 aa  91.3  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.274737  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2174  hypothetical protein  41.35 
 
 		 141 aa  91.3  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0494  hypothetical protein  33.33 
 
 		 137 aa  85.5  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02549  putative HIT family hydrolase  38.46 
 
 		 111 aa  85.9  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0470  hypothetical protein  32.56 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2919  histidine triad (HIT) protein  35.38 
 
 		 141 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3650  histidine triad (HIT) protein  28.7 
 
 		 151 aa  72  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3617  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0218  hypothetical protein  34.04 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.181658 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0468  HIT family protein  24.77 
 
 		 120 aa  57.8  0.00000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.106154  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3237  histidine triad (HIT) protein  35.96 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0442  HIT family protein  24.77 
 
 		 120 aa  57.8  0.00000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1537  HIT family protein  25 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1691  HIT family protein  28.41 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0559  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase  30.53 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.344449 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0338  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.02755e-33 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1508  hypothetical protein  30.59 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3912  histidine triad (HIT) protein  34.48 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000268802  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0119  histidine triad (HIT) protein  30.17 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0779  histidine triad (HIT) protein  35 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2993  histidine triad (HIT) protein  33.04 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000103081  normal  0.516918 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0423  HIT family hydrolase  28.41 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0368  histidine triad (HIT) protein  32.76 
 
 		 144 aa  53.5  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.462248  normal  0.925731 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0530  HIT family protein  32.58 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.335836  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0428  histidine triad (HIT) protein  33.62 
 
 		 141 aa  52.8  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0976831  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3073  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase  31.76 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000547688  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1768  HIT family protein  29.49 
 
 		 122 aa  53.5  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1920  HIT family protein  31.18 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4052  hypothetical protein  28.1 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.663105 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0647  histidine triad (HIT) protein  28.1 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.780647  normal  0.90331 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0357  histidine triad (HIT) protein  32.18 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00612046  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0380  HIT family protein  28.43 
 
 		 123 aa  51.2  0.000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.754034  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4120  histidine triad (HIT) protein  31.63 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2737  hypothetical protein  33.64 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0586419 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4131  histidine triad (HIT) protein  36.14 
 
 		 145 aa  50.4  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.190525  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1505  histidine triad (HIT) protein  32.22 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0406  histidine triad (HIT) protein  21.19 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0230  histidine triad (HIT) protein  30.09 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0372  histidine triad (HIT) protein  28.26 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.423054 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5463  histidine triad (HIT) protein  31.15 
 
 		 151 aa  47.4  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.189443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0457  histidine triad (HIT) protein  32.94 
 
 		 146 aa  47.8  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0128148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3647  histidine triad (HIT) protein  33.04 
 
 		 148 aa  47.4  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.623715  normal  0.697861 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0345  histidine triad (HIT) protein  30.77 
 
 		 150 aa  47  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.598088  normal  0.426855 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0330  histidine triad (HIT) protein  29.91 
 
 		 145 aa  47  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2316  HIT domain-containing protein  28 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.529616  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0665  HIT domain-containing protein  28 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>