270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_3073 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_3073  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase  100 
 
 		 139 aa  294  3e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000547688  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0530  HIT family protein  69.12 
 
 		 139 aa  205  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.335836  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3912  histidine triad (HIT) protein  66.91 
 
 		 142 aa  205  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000268802  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2993  histidine triad (HIT) protein  67.16 
 
 		 138 aa  201  3e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000103081  normal  0.516918 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3617  histidine triad (HIT) protein  61.94 
 
 		 144 aa  185  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3237  histidine triad (HIT) protein  62.69 
 
 		 139 aa  183  9e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0338  histidine triad (HIT) protein  56.52 
 
 		 140 aa  179  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.02755e-33 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0357  histidine triad (HIT) protein  55.8 
 
 		 140 aa  176  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00612046  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1138  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  43.62 
 
 		 142 aa  90.9  6e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0263958  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0230  histidine triad (HIT) protein  34.45 
 
 		 139 aa  83.6  9e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0901  hypothetical protein  36.36 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000619328  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1236  histidine triad (HIT) protein  35.83 
 
 		 139 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0559  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase  38.94 
 
 		 128 aa  80.9  0.000000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.344449 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0218  hypothetical protein  35 
 
 		 142 aa  80.1  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.181658 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1207  histidine triad (HIT) protein  35.64 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4120  histidine triad (HIT) protein  32.76 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0865  histidine triad (HIT) protein  36.52 
 
 		 163 aa  78.2  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.577446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0047  histidine triad (HIT) protein  38.1 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0457  histidine triad (HIT) protein  35.71 
 
 		 146 aa  77.4  0.00000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0128148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0794  histidine triad (HIT) protein  36.52 
 
 		 158 aa  77.4  0.00000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528382  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2506  histidine triad (HIT) protein  34.15 
 
 		 153 aa  77  0.00000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4211  histidine triad (HIT) protein  34.69 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3986  hypothetical protein  29.84 
 
 		 143 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0356527  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4417  histidine triad (HIT) protein  32.67 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00244718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0119  histidine triad (HIT) protein  32.43 
 
 		 140 aa  74.7  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0779  histidine triad (HIT) protein  34.88 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0470  hypothetical protein  31.91 
 
 		 143 aa  73.6  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0372  histidine triad (HIT) protein  34.19 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.423054 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0494  hypothetical protein  31.91 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0461  histidine triad (HIT) protein  31.25 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2737  hypothetical protein  30.43 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0586419 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1505  histidine triad (HIT) protein  35.16 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18650  histidine triad (HIT) family protein  30.97 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3647  histidine triad (HIT) protein  31.2 
 
 		 148 aa  70.5  0.000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.623715  normal  0.697861 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0565  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.419431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1401  histidine triad (HIT) protein  28.81 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.541573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6061  histidine triad (HIT) protein  32.48 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4052  hypothetical protein  33.33 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.663105 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2122  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 147 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.427523  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2734  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 147 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587938  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2761  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 147 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2336  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.6925  decreased coverage  0.00924855 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0406  histidine triad (HIT) protein  27.94 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0551  HIT domain-containing protein  32.43 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0368  histidine triad (HIT) protein  31.69 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.462248  normal  0.925731 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2785  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.804661  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2652  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.627712  normal  0.962372 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4549  hypothetical protein  30.53 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.498263  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0647  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.780647  normal  0.90331 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1261  histidine triad (HIT) protein  32.99 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0545124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004101  histidine triad family protein  31.4 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000876238  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0618  histidine triad (HIT) protein  29.7 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.619143  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4849  histidine triad (HIT) protein  31.96 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104991  normal  0.870904 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0681  HIT domain-containing protein  31.53 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0184  hypothetical protein  31.53 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0843  HIT family hydrolase  31.53 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2396  HIT domain-containing protein  31.53 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2316  HIT domain-containing protein  31.53 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.529616  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0665  HIT domain-containing protein  31.53 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2762  HIT domain-containing protein  31.53 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0604748  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2441  histidine triad (HIT) protein  31.96 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.132009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1289  histidine triad (HIT) protein  32.74 
 
 		 147 aa  67.4  0.00000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0088  histidine triad (HIT) protein  29.9 
 
 		 161 aa  67  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.348291  normal  0.0668606 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0428  histidine triad (HIT) protein  31.86 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0976831  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51860  hypothetical protein  32.67 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.393091  hitchhiker  0.00413081 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1667  histidine triad (HIT) protein  32.99 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.619204 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7347  hypothetical protein  29.09 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4008  histidine triad (HIT) protein  32 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4131  histidine triad (HIT) protein  32.73 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.190525  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1048  histidine triad (HIT) protein  31.96 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.136733  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01367  hypothetical protein  31.71 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0455  hypothetical protein  31.3 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1704  HIT family protein  32.65 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.274737  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0669  histidine triad (HIT) protein  29.46 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0345  histidine triad (HIT) protein  32.73 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.598088  normal  0.426855 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1209  histidine triad (HIT) protein  34.23 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.818472  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1662  histidine triad family protein  31.9 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0330  histidine triad (HIT) protein  32.73 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3431  histidine triad (HIT) protein  34.02 
 
 		 134 aa  63.5  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1635  histidine triad (HIT) protein  32.99 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235606 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6100  histidine triad (HIT) protein  31.25 
 
 		 374 aa  63.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00945728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0370  histidine triad (HIT) protein  28.57 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.673964 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0910  Pectate lyase/Amb allergen  29.81 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000231178  decreased coverage  0.0000000980143 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1068  histidine triad (HIT) protein  35.05 
 
 		 137 aa  62  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2174  hypothetical protein  30.53 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4872  histidine triad (HIT) protein  34.23 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4078  histidine triad (HIT) protein  30.63 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1709  histidine triad (HIT) protein  29.9 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00500014  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5002  histidine triad (HIT) protein  32.28 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.503788  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4398  histidine triad (HIT) protein  30.63 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5463  histidine triad (HIT) protein  32.73 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.189443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4962  histidine triad (HIT) protein  30.53 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0265226  normal  0.0774828 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2949  histidine triad (HIT) protein  27.2 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2848  histidine triad (HIT) protein  32.17 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04560  histidine triad (HIT) protein  32.71 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0966  HIT family protein  33.01 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0957  HIT family protein  33.01 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4221  HIT family protein  33.01 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.071329  normal  0.0179678 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1083  HIT family protein  33.01 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1004  histidine triad (HIT) protein  30.91 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>