122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004101 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_004101  histidine triad family protein  100 
 
 		 142 aa  293  6e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000876238  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01367  hypothetical protein  93.66 
 
 		 159 aa  280  5.000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1662  histidine triad family protein  74.45 
 
 		 147 aa  221  2e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2174  hypothetical protein  53.19 
 
 		 141 aa  167  5e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0910  Pectate lyase/Amb allergen  48.85 
 
 		 155 aa  142  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000231178  decreased coverage  0.0000000980143 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1709  histidine triad (HIT) protein  47.33 
 
 		 136 aa  133  7.000000000000001e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00500014  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6100  histidine triad (HIT) protein  52.78 
 
 		 374 aa  132  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00945728  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1704  HIT family protein  45.99 
 
 		 144 aa  126  9.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.274737  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1207  histidine triad (HIT) protein  45.38 
 
 		 139 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2336  histidine triad (HIT) protein  43.18 
 
 		 147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.6925  decreased coverage  0.00924855 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2685  histidine triad (HIT) protein  44.19 
 
 		 135 aa  124  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.934104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1635  histidine triad (HIT) protein  50.46 
 
 		 144 aa  124  6e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235606 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1236  histidine triad (HIT) protein  44.62 
 
 		 139 aa  123  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4211  histidine triad (HIT) protein  43.85 
 
 		 139 aa  122  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1483  histidine triad (HIT) family protein  51.85 
 
 		 143 aa  122  2e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0478904 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4417  histidine triad (HIT) protein  43.07 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00244718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1663  histidine triad (HIT) protein  51.85 
 
 		 143 aa  122  2e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0109838 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51860  hypothetical protein  44.7 
 
 		 209 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.393091  hitchhiker  0.00413081 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3986  hypothetical protein  44.7 
 
 		 143 aa  121  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0356527  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1048  histidine triad (HIT) protein  42.75 
 
 		 137 aa  120  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.136733  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4549  hypothetical protein  46.21 
 
 		 142 aa  120  9e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.498263  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18650  histidine triad (HIT) family protein  44.7 
 
 		 141 aa  119  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0687  hypothetical protein  49.09 
 
 		 147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1401  histidine triad (HIT) protein  44.7 
 
 		 143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.541573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7347  hypothetical protein  45.19 
 
 		 139 aa  116  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1667  histidine triad (HIT) protein  39.55 
 
 		 137 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.619204 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1261  histidine triad (HIT) protein  41.67 
 
 		 143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0545124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1068  histidine triad (HIT) protein  41.79 
 
 		 137 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4849  histidine triad (HIT) protein  43.7 
 
 		 139 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104991  normal  0.870904 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4008  histidine triad (HIT) protein  41.67 
 
 		 165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0461  histidine triad (HIT) protein  44.03 
 
 		 138 aa  111  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1085  histidine triad (HIT) protein  40.6 
 
 		 139 aa  110  5e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.986739 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4912  histidine triad (HIT) protein  46.79 
 
 		 138 aa  110  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.363403  normal  0.678464 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4448  histidine triad (HIT) protein  46.79 
 
 		 138 aa  110  6e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.678684 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4398  histidine triad (HIT) protein  40.6 
 
 		 136 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0370  histidine triad (HIT) protein  41.48 
 
 		 138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.673964 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0618  histidine triad (HIT) protein  43.28 
 
 		 139 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.619143  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2949  histidine triad (HIT) protein  39.39 
 
 		 142 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2294  histidine triad (HIT) protein  46.36 
 
 		 139 aa  107  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.125873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0669  histidine triad (HIT) protein  42.22 
 
 		 138 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4962  histidine triad (HIT) protein  46.79 
 
 		 138 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0265226  normal  0.0774828 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4078  histidine triad (HIT) protein  38.35 
 
 		 136 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0088  histidine triad (HIT) protein  43.28 
 
 		 161 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.348291  normal  0.0668606 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0020  histidine triad (HIT) protein  39.69 
 
 		 134 aa  104  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.089911  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2441  histidine triad (HIT) protein  49.06 
 
 		 140 aa  103  7e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.132009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2626  histidine triad (HIT) protein  38.06 
 
 		 140 aa  102  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.815959 
 
 
-
 
NC_004310  BR0035  hypothetical protein  38.17 
 
 		 134 aa  100  5e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.132487  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0035  hypothetical protein  38.17 
 
 		 165 aa  100  6e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.871621  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0109  hypothetical protein  37.88 
 
 		 147 aa  100  7e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.648306  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2901  histidine triad (HIT) protein  40.46 
 
 		 146 aa  99.4  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0749971  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01245  diadenosine tetraphosphate hydrolase and other HIT family hydrolase  40.32 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.409214  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1686  histidine triad (HIT) protein  39.45 
 
 		 159 aa  95.9  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0494  hypothetical protein  38.18 
 
 		 137 aa  94.7  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4058  histidine triad (HIT) protein  37.88 
 
 		 139 aa  94.4  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.688633  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0470  hypothetical protein  38.18 
 
 		 143 aa  92.8  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02549  putative HIT family hydrolase  45.92 
 
 		 111 aa  93.2  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2919  histidine triad (HIT) protein  41.09 
 
 		 141 aa  92.4  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3431  histidine triad (HIT) protein  39.47 
 
 		 134 aa  92.4  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5002  histidine triad (HIT) protein  34.78 
 
 		 141 aa  92  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.503788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2867  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 		 140 aa  89  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3650  histidine triad (HIT) protein  38.74 
 
 		 151 aa  83.6  8e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3237  histidine triad (HIT) protein  38.18 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2993  histidine triad (HIT) protein  37.5 
 
 		 138 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000103081  normal  0.516918 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3912  histidine triad (HIT) protein  34.78 
 
 		 142 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000268802  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0530  HIT family protein  37.5 
 
 		 139 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.335836  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0457  histidine triad (HIT) protein  35.78 
 
 		 146 aa  70.5  0.000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0128148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3617  histidine triad (HIT) protein  32.77 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2506  histidine triad (HIT) protein  35.04 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3073  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase  31.4 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000547688  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0338  histidine triad (HIT) protein  38.89 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.02755e-33 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0357  histidine triad (HIT) protein  34.21 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00612046  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0423  HIT family hydrolase  34.04 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1505  histidine triad (HIT) protein  32.77 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0468  HIT family protein  31.87 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.106154  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0442  HIT family protein  31.87 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1537  HIT family protein  31.87 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0406  histidine triad (HIT) protein  27.05 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1768  HIT family protein  32.91 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1920  HIT family protein  33.72 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4131  histidine triad (HIT) protein  40.23 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.190525  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0779  histidine triad (HIT) protein  45.59 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0218  hypothetical protein  37.78 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.181658 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0230  histidine triad (HIT) protein  37.08 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1691  HIT family protein  32.53 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0865  histidine triad (HIT) protein  31.75 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.577446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0794  histidine triad (HIT) protein  37.5 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528382  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3647  histidine triad (HIT) protein  31.9 
 
 		 148 aa  57  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.623715  normal  0.697861 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0380  HIT family protein  30.23 
 
 		 123 aa  57  0.00000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.754034  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4120  histidine triad (HIT) protein  32.58 
 
 		 143 aa  57  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0082  HIT family protein  32.97 
 
 		 126 aa  57  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2737  hypothetical protein  38.55 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0586419 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0119  histidine triad (HIT) protein  32 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0565  histidine triad (HIT) protein  38.24 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.419431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2122  histidine triad (HIT) protein  34.44 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.427523  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2734  histidine triad (HIT) protein  34.44 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587938  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2761  histidine triad (HIT) protein  34.44 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2785  histidine triad (HIT) protein  34.44 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.804661  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1138  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  34.55 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0263958  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2652  histidine triad (HIT) protein  34.44 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.627712  normal  0.962372 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6061  histidine triad (HIT) protein  48.94 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>