253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2652 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2652  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 		 147 aa  303  5.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.627712  normal  0.962372 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2785  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 		 147 aa  303  5.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.804661  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2761  histidine triad (HIT) protein  97.26 
 
 		 147 aa  295  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2122  histidine triad (HIT) protein  97.26 
 
 		 147 aa  295  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.427523  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2734  histidine triad (HIT) protein  97.26 
 
 		 147 aa  295  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587938  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6061  histidine triad (HIT) protein  94.56 
 
 		 147 aa  290  3e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0565  histidine triad (HIT) protein  94.56 
 
 		 147 aa  289  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.419431  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0184  hypothetical protein  85 
 
 		 152 aa  252  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0681  HIT domain-containing protein  85 
 
 		 152 aa  252  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0843  HIT family hydrolase  85 
 
 		 152 aa  252  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2396  HIT domain-containing protein  85 
 
 		 152 aa  252  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2316  HIT domain-containing protein  85 
 
 		 152 aa  252  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.529616  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0551  HIT domain-containing protein  86.33 
 
 		 152 aa  252  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0665  HIT domain-containing protein  85 
 
 		 152 aa  252  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2762  HIT domain-containing protein  85 
 
 		 152 aa  252  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0604748  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0372  histidine triad (HIT) protein  76.26 
 
 		 142 aa  226  7e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.423054 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4052  hypothetical protein  75.18 
 
 		 142 aa  224  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.663105 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0647  histidine triad (HIT) protein  75.54 
 
 		 142 aa  221  4e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.780647  normal  0.90331 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1505  histidine triad (HIT) protein  53.15 
 
 		 146 aa  162  2.0000000000000002e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2506  histidine triad (HIT) protein  61.02 
 
 		 153 aa  148  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0428  histidine triad (HIT) protein  51.13 
 
 		 141 aa  144  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0976831  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0368  histidine triad (HIT) protein  57.26 
 
 		 144 aa  144  6e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.462248  normal  0.925731 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0218  hypothetical protein  58.62 
 
 		 142 aa  143  7.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.181658 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3647  histidine triad (HIT) protein  51.39 
 
 		 148 aa  138  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.623715  normal  0.697861 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0457  histidine triad (HIT) protein  44.68 
 
 		 146 aa  136  7e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0128148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4120  histidine triad (HIT) protein  55.36 
 
 		 143 aa  132  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0455  hypothetical protein  49.64 
 
 		 147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0345  histidine triad (HIT) protein  49.62 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.598088  normal  0.426855 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0865  histidine triad (HIT) protein  48.23 
 
 		 163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.577446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0330  histidine triad (HIT) protein  48.51 
 
 		 145 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0794  histidine triad (HIT) protein  48.23 
 
 		 158 aa  130  5e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528382  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0230  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 		 139 aa  127  6e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0779  histidine triad (HIT) protein  46.32 
 
 		 142 aa  126  8.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1289  histidine triad (HIT) protein  53.1 
 
 		 147 aa  122  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0119  histidine triad (HIT) protein  42.28 
 
 		 140 aa  121  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2737  hypothetical protein  50.88 
 
 		 147 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0586419 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4131  histidine triad (HIT) protein  51.85 
 
 		 145 aa  117  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.190525  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5463  histidine triad (HIT) protein  54.05 
 
 		 151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.189443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3617  histidine triad (HIT) protein  40.78 
 
 		 144 aa  84.3  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1920  HIT family protein  38.46 
 
 		 123 aa  81.3  0.000000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0530  HIT family protein  40.2 
 
 		 139 aa  79.3  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.335836  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0380  HIT family protein  37.4 
 
 		 123 aa  79.7  0.00000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.754034  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0338  histidine triad (HIT) protein  37.9 
 
 		 140 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.02755e-33 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3912  histidine triad (HIT) protein  39.77 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000268802  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0357  histidine triad (HIT) protein  37.78 
 
 		 140 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00612046  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3237  histidine triad (HIT) protein  34.48 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2993  histidine triad (HIT) protein  38.64 
 
 		 138 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000103081  normal  0.516918 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4849  histidine triad (HIT) protein  44.83 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104991  normal  0.870904 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0088  histidine triad (HIT) protein  42.22 
 
 		 161 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.348291  normal  0.0668606 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2441  histidine triad (HIT) protein  40.23 
 
 		 140 aa  72  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.132009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1291  HIT family protein  42.86 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.691184  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0669  histidine triad (HIT) protein  41.38 
 
 		 138 aa  70.5  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3073  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase  33.33 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000547688  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0618  histidine triad (HIT) protein  40.23 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.619143  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7347  hypothetical protein  39.08 
 
 		 139 aa  67  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1537  HIT family protein  33.33 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0468  HIT family protein  33.33 
 
 		 120 aa  64.3  0.0000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.106154  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0442  HIT family protein  40 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0423  HIT family hydrolase  31.43 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1768  HIT family protein  29.7 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1691  HIT family protein  36.23 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1048  histidine triad (HIT) protein  34.26 
 
 		 137 aa  62  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.136733  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0494  hypothetical protein  30.56 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0470  hypothetical protein  28.7 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1401  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.541573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2685  histidine triad (HIT) protein  35.63 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.934104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4008  histidine triad (HIT) protein  35.63 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1667  histidine triad (HIT) protein  34.78 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.619204 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0461  histidine triad (HIT) protein  35.63 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0082  HIT family protein  29.9 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4211  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3986  hypothetical protein  32.97 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0356527  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1236  histidine triad (HIT) protein  34.48 
 
 		 139 aa  57  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1207  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02549  putative HIT family hydrolase  31.07 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1483  histidine triad (HIT) family protein  34.33 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0478904 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0370  histidine triad (HIT) protein  35.44 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.673964 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1663  histidine triad (HIT) protein  34.33 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0109838 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01367  hypothetical protein  39.13 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0406  histidine triad (HIT) protein  27.05 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1662  histidine triad family protein  40.3 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4962  histidine triad (HIT) protein  32.65 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0265226  normal  0.0774828 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4448  histidine triad (HIT) protein  38.24 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.678684 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004101  histidine triad family protein  34.44 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000876238  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4912  histidine triad (HIT) protein  38.24 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.363403  normal  0.678464 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1784  histidine triad (HIT) protein  32.86 
 
 		 190 aa  54.3  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.238238  normal  0.0568731 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3726  histidine triad (HIT) protein  25.93 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1209  histidine triad (HIT) protein  32.04 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.818472  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2174  hypothetical protein  34.12 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1138  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  30.39 
 
 		 142 aa  53.5  0.0000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0263958  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4417  histidine triad (HIT) protein  31.03 
 
 		 144 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00244718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0910  Pectate lyase/Amb allergen  26.36 
 
 		 155 aa  53.5  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000231178  decreased coverage  0.0000000980143 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2873  histidine triad (HIT) protein  25.35 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.635304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1657  histidine triad (HIT) protein  30.28 
 
 		 190 aa  53.5  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.411198  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6100  histidine triad (HIT) protein  36.78 
 
 		 374 aa  53.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00945728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2792  HIT family hydrolase  24.31 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.797227  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1704  HIT family protein  29.89 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.274737  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4398  histidine triad (HIT) protein  34.78 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1635  histidine triad (HIT) protein  32.91 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235606 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0832  histidine triad (HIT) protein  27.74 
 
 		 141 aa  52  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>