128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0370 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0370  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 
138 aa  277  3e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.673964 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0461  histidine triad (HIT) protein  77.54 
 
 
138 aa  214  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7347  hypothetical protein  64.18 
 
 
139 aa  183  8e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0669  histidine triad (HIT) protein  63.77 
 
 
138 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0088  histidine triad (HIT) protein  61.59 
 
 
161 aa  178  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.348291  normal  0.0668606 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0618  histidine triad (HIT) protein  58.96 
 
 
139 aa  166  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.619143  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4849  histidine triad (HIT) protein  58.96 
 
 
139 aa  164  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104991  normal  0.870904 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18650  histidine triad (HIT) family protein  49.22 
 
 
141 aa  134  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4008  histidine triad (HIT) protein  51.22 
 
 
165 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4417  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 
144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00244718  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51860  hypothetical protein  50 
 
 
209 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.393091  hitchhiker  0.00413081 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4549  hypothetical protein  51.56 
 
 
142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.498263  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1261  histidine triad (HIT) protein  46.09 
 
 
143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0545124  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4211  histidine triad (HIT) protein  46.83 
 
 
139 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1236  histidine triad (HIT) protein  46.03 
 
 
139 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2901  histidine triad (HIT) protein  45.24 
 
 
146 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0749971  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0910  Pectate lyase/Amb allergen  44.27 
 
 
155 aa  123  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000231178  decreased coverage  0.0000000980143 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2685  histidine triad (HIT) protein  46.56 
 
 
135 aa  122  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.934104  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1704  HIT family protein  43.61 
 
 
144 aa  121  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.274737  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1207  histidine triad (HIT) protein  45.24 
 
 
139 aa  120  9e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3986  hypothetical protein  45.8 
 
 
143 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0356527  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1048  histidine triad (HIT) protein  44.53 
 
 
137 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.136733  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2626  histidine triad (HIT) protein  44.85 
 
 
140 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.815959 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1401  histidine triad (HIT) protein  46.83 
 
 
143 aa  118  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.541573  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4398  histidine triad (HIT) protein  47.33 
 
 
136 aa  118  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6100  histidine triad (HIT) protein  48.44 
 
 
374 aa  118  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00945728  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5002  histidine triad (HIT) protein  47.2 
 
 
141 aa  117  4.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.503788  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2336  histidine triad (HIT) protein  42.97 
 
 
147 aa  116  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.6925  decreased coverage  0.00924855 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0020  histidine triad (HIT) protein  42.86 
 
 
134 aa  116  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.089911  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2867  histidine triad (HIT) protein  42.42 
 
 
140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1635  histidine triad (HIT) protein  48.7 
 
 
144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000235606 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4912  histidine triad (HIT) protein  47.06 
 
 
138 aa  115  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.363403  normal  0.678464 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4448  histidine triad (HIT) protein  47.06 
 
 
138 aa  115  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.678684 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4962  histidine triad (HIT) protein  48.74 
 
 
138 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0265226  normal  0.0774828 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4078  histidine triad (HIT) protein  45.04 
 
 
136 aa  114  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2441  histidine triad (HIT) protein  44.19 
 
 
140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.132009  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0035  hypothetical protein  43.85 
 
 
165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.871621  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0035  hypothetical protein  43.85 
 
 
134 aa  111  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.132487  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1483  histidine triad (HIT) family protein  41.67 
 
 
143 aa  111  3e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0478904 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1663  histidine triad (HIT) protein  41.67 
 
 
143 aa  111  3e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0109838 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1667  histidine triad (HIT) protein  43.75 
 
 
137 aa  110  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.619204 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2949  histidine triad (HIT) protein  44.53 
 
 
142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004101  histidine triad family protein  41.48 
 
 
142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000876238  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1709  histidine triad (HIT) protein  41.79 
 
 
136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00500014  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0109  hypothetical protein  43.41 
 
 
147 aa  108  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.648306  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2294  histidine triad (HIT) protein  44.62 
 
 
139 aa  108  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.125873  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01245  diadenosine tetraphosphate hydrolase and other HIT family hydrolase  42.86 
 
 
144 aa  107  4.0000000000000004e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.409214  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01367  hypothetical protein  40 
 
 
159 aa  107  8.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1662  histidine triad family protein  46.3 
 
 
147 aa  104  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0470  hypothetical protein  38.21 
 
 
143 aa  102  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0687  hypothetical protein  43.85 
 
 
147 aa  101  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4058  histidine triad (HIT) protein  40.31 
 
 
139 aa  100  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.688633  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2174  hypothetical protein  38.52 
 
 
141 aa  100  5e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1686  histidine triad (HIT) protein  36.36 
 
 
159 aa  100  9e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3431  histidine triad (HIT) protein  43.97 
 
 
134 aa  99.8  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0494  hypothetical protein  36.59 
 
 
137 aa  98.2  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1068  histidine triad (HIT) protein  38.81 
 
 
137 aa  97.8  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1085  histidine triad (HIT) protein  40.88 
 
 
139 aa  94  7e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.986739 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02549  putative HIT family hydrolase  44.66 
 
 
111 aa  93.2  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2919  histidine triad (HIT) protein  39.68 
 
 
141 aa  85.1  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3617  histidine triad (HIT) protein  31.2 
 
 
144 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3237  histidine triad (HIT) protein  31.5 
 
 
139 aa  72.8  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3650  histidine triad (HIT) protein  35.87 
 
 
151 aa  70.9  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3912  histidine triad (HIT) protein  28.78 
 
 
142 aa  66.6  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000268802  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0428  histidine triad (HIT) protein  34.21 
 
 
141 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0976831  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2993  histidine triad (HIT) protein  30.16 
 
 
138 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000103081  normal  0.516918 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0530  HIT family protein  29.2 
 
 
139 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.335836  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0455  hypothetical protein  37.5 
 
 
147 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0368  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 
144 aa  65.5  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.462248  normal  0.925731 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0338  histidine triad (HIT) protein  27.72 
 
 
140 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.02755e-33 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2506  histidine triad (HIT) protein  28.37 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1508  hypothetical protein  36.17 
 
 
130 aa  64.7  0.0000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4052  hypothetical protein  36.36 
 
 
142 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.663105 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2737  hypothetical protein  38 
 
 
147 aa  62.8  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0586419 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3073  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase  28.57 
 
 
139 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000547688  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0779  histidine triad (HIT) protein  35.92 
 
 
142 aa  62  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0457  histidine triad (HIT) protein  37.63 
 
 
146 aa  62.8  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0128148  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0647  histidine triad (HIT) protein  36.36 
 
 
142 aa  62  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.780647  normal  0.90331 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0184  hypothetical protein  35.96 
 
 
152 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0843  HIT family hydrolase  35.96 
 
 
152 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2762  HIT domain-containing protein  35.96 
 
 
152 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0604748  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2316  HIT domain-containing protein  35.96 
 
 
152 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.529616  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0665  HIT domain-containing protein  35.96 
 
 
152 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0681  HIT domain-containing protein  35.96 
 
 
152 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2396  HIT domain-containing protein  35.96 
 
 
152 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0330  histidine triad (HIT) protein  37.08 
 
 
145 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0832  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0357  histidine triad (HIT) protein  26.73 
 
 
140 aa  61.6  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00612046  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0551  HIT domain-containing protein  35.96 
 
 
152 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0380  HIT family protein  39.74 
 
 
123 aa  60.8  0.000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.754034  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0345  histidine triad (HIT) protein  35.58 
 
 
150 aa  60.5  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.598088  normal  0.426855 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0218  hypothetical protein  33.06 
 
 
142 aa  60.5  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.181658 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0865  histidine triad (HIT) protein  41.46 
 
 
163 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.577446  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0794  histidine triad (HIT) protein  41.46 
 
 
158 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528382  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1920  HIT family protein  34.62 
 
 
123 aa  59.7  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4131  histidine triad (HIT) protein  37.5 
 
 
145 aa  58.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.190525  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1505  histidine triad (HIT) protein  31.67 
 
 
146 aa  59.3  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0119  histidine triad (HIT) protein  30.08 
 
 
140 aa  58.9  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1289  histidine triad (HIT) protein  37.5 
 
 
147 aa  58.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3647  histidine triad (HIT) protein  40.96 
 
 
148 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.623715  normal  0.697861 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1691  HIT family protein  27.71 
 
 
124 aa  58.2  0.00000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>