136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1207 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1207  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 		 139 aa  284  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1236  histidine triad (HIT) protein  97.84 
 
 		 139 aa  278  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4211  histidine triad (HIT) protein  94.24 
 
 		 139 aa  268  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4008  histidine triad (HIT) protein  71.94 
 
 		 165 aa  210  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4417  histidine triad (HIT) protein  74.42 
 
 		 144 aa  206  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00244718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1401  histidine triad (HIT) protein  70.54 
 
 		 143 aa  199  9e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.541573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1261  histidine triad (HIT) protein  66.91 
 
 		 143 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0545124  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3986  hypothetical protein  67.44 
 
 		 143 aa  189  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0356527  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18650  histidine triad (HIT) family protein  66.67 
 
 		 141 aa  188  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51860  hypothetical protein  60.43 
 
 		 209 aa  180  7e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.393091  hitchhiker  0.00413081 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4549  hypothetical protein  59.12 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.498263  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0687  hypothetical protein  53.08 
 
 		 147 aa  143  7.0000000000000006e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1704  HIT family protein  51.18 
 
 		 144 aa  142  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.274737  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2949  histidine triad (HIT) protein  49.23 
 
 		 142 aa  137  4.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1709  histidine triad (HIT) protein  50.38 
 
 		 136 aa  137  7e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00500014  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6100  histidine triad (HIT) protein  46.43 
 
 		 374 aa  136  8.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00945728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2336  histidine triad (HIT) protein  46.56 
 
 		 147 aa  135  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.6925  decreased coverage  0.00924855 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4849  histidine triad (HIT) protein  45.31 
 
 		 139 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104991  normal  0.870904 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0910  Pectate lyase/Amb allergen  43.97 
 
 		 155 aa  130  3.9999999999999996e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000231178  decreased coverage  0.0000000980143 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0618  histidine triad (HIT) protein  46.03 
 
 		 139 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.619143  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1068  histidine triad (HIT) protein  49.22 
 
 		 137 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004101  histidine triad family protein  45.38 
 
 		 142 aa  126  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000876238  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0088  histidine triad (HIT) protein  45.24 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.348291  normal  0.0668606 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1635  histidine triad (HIT) protein  47.66 
 
 		 144 aa  124  5e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235606 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1085  histidine triad (HIT) protein  46.92 
 
 		 139 aa  124  5e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.986739 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0669  histidine triad (HIT) protein  46.03 
 
 		 138 aa  123  6e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4398  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 		 136 aa  124  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3431  histidine triad (HIT) protein  50.93 
 
 		 134 aa  122  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01367  hypothetical protein  44.62 
 
 		 159 aa  123  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1048  histidine triad (HIT) protein  43.08 
 
 		 137 aa  122  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.136733  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7347  hypothetical protein  44.19 
 
 		 139 aa  121  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1483  histidine triad (HIT) family protein  45.65 
 
 		 143 aa  121  3e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0478904 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0461  histidine triad (HIT) protein  46.51 
 
 		 138 aa  121  3e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1663  histidine triad (HIT) protein  45.65 
 
 		 143 aa  121  3e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0109838 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2685  histidine triad (HIT) protein  44.09 
 
 		 135 aa  120  5e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.934104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0370  histidine triad (HIT) protein  45.24 
 
 		 138 aa  120  9e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.673964 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0109  hypothetical protein  45.45 
 
 		 147 aa  120  9e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.648306  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0494  hypothetical protein  37.23 
 
 		 137 aa  119  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4078  histidine triad (HIT) protein  48.44 
 
 		 136 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1662  histidine triad family protein  46.09 
 
 		 147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2901  histidine triad (HIT) protein  46.79 
 
 		 146 aa  117  7e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0749971  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4912  histidine triad (HIT) protein  49.07 
 
 		 138 aa  117  7e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.363403  normal  0.678464 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4448  histidine triad (HIT) protein  49.07 
 
 		 138 aa  117  7e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.678684 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4962  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 		 138 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0265226  normal  0.0774828 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2867  histidine triad (HIT) protein  48.62 
 
 		 140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2626  histidine triad (HIT) protein  48.15 
 
 		 140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.815959 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1667  histidine triad (HIT) protein  42.31 
 
 		 137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.619204 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01245  diadenosine tetraphosphate hydrolase and other HIT family hydrolase  43.18 
 
 		 144 aa  113  6.9999999999999995e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.409214  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0035  hypothetical protein  41.41 
 
 		 134 aa  112  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.132487  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0035  hypothetical protein  41.41 
 
 		 165 aa  112  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.871621  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0020  histidine triad (HIT) protein  45.37 
 
 		 134 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.089911  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0470  hypothetical protein  36.36 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5002  histidine triad (HIT) protein  45.83 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.503788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2294  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 		 139 aa  110  6e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.125873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2174  hypothetical protein  45.05 
 
 		 141 aa  110  9e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4058  histidine triad (HIT) protein  39.84 
 
 		 139 aa  108  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.688633  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2441  histidine triad (HIT) protein  40.71 
 
 		 140 aa  95.5  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.132009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3650  histidine triad (HIT) protein  34.06 
 
 		 151 aa  92  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2919  histidine triad (HIT) protein  38.28 
 
 		 141 aa  90.5  7e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02549  putative HIT family hydrolase  41.75 
 
 		 111 aa  87.4  6e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1686  histidine triad (HIT) protein  35.51 
 
 		 159 aa  83.2  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3617  histidine triad (HIT) protein  33.08 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3073  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase  35.64 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000547688  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3237  histidine triad (HIT) protein  33.72 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0218  hypothetical protein  38.89 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.181658 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0530  HIT family protein  29.92 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.335836  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2993  histidine triad (HIT) protein  31.68 
 
 		 138 aa  67  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000103081  normal  0.516918 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1508  hypothetical protein  36.78 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0230  histidine triad (HIT) protein  37.11 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0457  histidine triad (HIT) protein  34.44 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0128148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4120  histidine triad (HIT) protein  33.71 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0865  histidine triad (HIT) protein  35.96 
 
 		 163 aa  64.7  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.577446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3912  histidine triad (HIT) protein  28.71 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000268802  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0794  histidine triad (HIT) protein  35.96 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528382  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0338  histidine triad (HIT) protein  31.4 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.02755e-33 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0357  histidine triad (HIT) protein  31.4 
 
 		 140 aa  62  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00612046  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2506  histidine triad (HIT) protein  32.97 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1505  histidine triad (HIT) protein  32.58 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4131  histidine triad (HIT) protein  35.48 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.190525  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0184  hypothetical protein  34.48 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0843  HIT family hydrolase  34.48 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2762  HIT domain-containing protein  34.48 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0604748  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2316  HIT domain-containing protein  34.48 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.529616  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0665  HIT domain-containing protein  34.48 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0681  HIT domain-containing protein  34.48 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2396  HIT domain-containing protein  34.48 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0551  HIT domain-containing protein  34.48 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1691  HIT family protein  25.89 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1291  HIT family protein  31.65 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.691184  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1289  histidine triad (HIT) protein  34.09 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0119  histidine triad (HIT) protein  28.69 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0559  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase  33.71 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.344449 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2122  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 147 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.427523  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2734  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 147 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587938  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2761  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 147 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4052  hypothetical protein  29.55 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.663105 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2785  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.804661  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0779  histidine triad (HIT) protein  32.95 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2652  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.627712  normal  0.962372 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0345  histidine triad (HIT) protein  34.09 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.598088  normal  0.426855 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>