138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0669 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0669  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 		 138 aa  276  5e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0088  histidine triad (HIT) protein  89.13 
 
 		 161 aa  251  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.348291  normal  0.0668606 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7347  hypothetical protein  84.33 
 
 		 139 aa  236  9e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4849  histidine triad (HIT) protein  82.01 
 
 		 139 aa  227  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104991  normal  0.870904 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0618  histidine triad (HIT) protein  78.1 
 
 		 139 aa  224  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.619143  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0461  histidine triad (HIT) protein  68.12 
 
 		 138 aa  188  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0370  histidine triad (HIT) protein  63.77 
 
 		 138 aa  182  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.673964 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1261  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 		 143 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0545124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4417  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 		 144 aa  134  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00244718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51860  hypothetical protein  50 
 
 		 209 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.393091  hitchhiker  0.00413081 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4549  hypothetical protein  49.22 
 
 		 142 aa  130  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.498263  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4008  histidine triad (HIT) protein  49.22 
 
 		 165 aa  130  9e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18650  histidine triad (HIT) family protein  49.25 
 
 		 141 aa  128  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1401  histidine triad (HIT) protein  46.51 
 
 		 143 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.541573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4211  histidine triad (HIT) protein  46.83 
 
 		 139 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1667  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 		 137 aa  125  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.619204 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1207  histidine triad (HIT) protein  46.03 
 
 		 139 aa  123  6e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1048  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 		 137 aa  123  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.136733  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2685  histidine triad (HIT) protein  46.56 
 
 		 135 aa  123  8.000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.934104  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3986  hypothetical protein  46.03 
 
 		 143 aa  122  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0356527  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1236  histidine triad (HIT) protein  45.24 
 
 		 139 aa  121  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1635  histidine triad (HIT) protein  49.15 
 
 		 144 aa  120  7e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235606 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0910  Pectate lyase/Amb allergen  50.45 
 
 		 155 aa  117  4.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000231178  decreased coverage  0.0000000980143 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1704  HIT family protein  42.75 
 
 		 144 aa  116  9e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.274737  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1663  histidine triad (HIT) protein  46.61 
 
 		 143 aa  115  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0109838 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4398  histidine triad (HIT) protein  45.8 
 
 		 136 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1483  histidine triad (HIT) family protein  45.76 
 
 		 143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0478904 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6100  histidine triad (HIT) protein  45.31 
 
 		 374 aa  115  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00945728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2626  histidine triad (HIT) protein  47.66 
 
 		 140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.815959 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2901  histidine triad (HIT) protein  44.19 
 
 		 146 aa  114  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0749971  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4078  histidine triad (HIT) protein  45.8 
 
 		 136 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2949  histidine triad (HIT) protein  47.29 
 
 		 142 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2441  histidine triad (HIT) protein  49.12 
 
 		 140 aa  113  6.9999999999999995e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.132009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0020  histidine triad (HIT) protein  41.41 
 
 		 134 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.089911  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01245  diadenosine tetraphosphate hydrolase and other HIT family hydrolase  43.38 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.409214  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4962  histidine triad (HIT) protein  51.38 
 
 		 138 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0265226  normal  0.0774828 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2174  hypothetical protein  42.75 
 
 		 141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1662  histidine triad family protein  43.85 
 
 		 147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0035  hypothetical protein  43.41 
 
 		 165 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.871621  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4912  histidine triad (HIT) protein  50.91 
 
 		 138 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.363403  normal  0.678464 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4448  histidine triad (HIT) protein  50.91 
 
 		 138 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.678684 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2867  histidine triad (HIT) protein  39.85 
 
 		 140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2294  histidine triad (HIT) protein  51.3 
 
 		 139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.125873  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0035  hypothetical protein  44.44 
 
 		 134 aa  109  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.132487  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01367  hypothetical protein  42.22 
 
 		 159 aa  108  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0494  hypothetical protein  39.02 
 
 		 137 aa  107  5e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2336  histidine triad (HIT) protein  39.84 
 
 		 147 aa  107  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.6925  decreased coverage  0.00924855 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004101  histidine triad family protein  42.22 
 
 		 142 aa  107  6e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000876238  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0470  hypothetical protein  39.84 
 
 		 143 aa  106  9.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5002  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 		 141 aa  105  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.503788  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0687  hypothetical protein  44.83 
 
 		 147 aa  105  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1709  histidine triad (HIT) protein  42.02 
 
 		 136 aa  103  6e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00500014  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0109  hypothetical protein  47.83 
 
 		 147 aa  103  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.648306  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4058  histidine triad (HIT) protein  40.31 
 
 		 139 aa  103  8e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.688633  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3431  histidine triad (HIT) protein  38.93 
 
 		 134 aa  103  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1068  histidine triad (HIT) protein  38.06 
 
 		 137 aa  101  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1686  histidine triad (HIT) protein  42.73 
 
 		 159 aa  97.8  5e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1085  histidine triad (HIT) protein  44.25 
 
 		 139 aa  96.7  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.986739 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02549  putative HIT family hydrolase  41.9 
 
 		 111 aa  93.6  8e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2919  histidine triad (HIT) protein  42.59 
 
 		 141 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3650  histidine triad (HIT) protein  29.69 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3617  histidine triad (HIT) protein  35.58 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0530  HIT family protein  33.33 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.335836  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3237  histidine triad (HIT) protein  33.88 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0184  hypothetical protein  40.23 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0843  HIT family hydrolase  40.23 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2762  HIT domain-containing protein  40.23 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0604748  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2316  HIT domain-containing protein  40.23 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.529616  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0665  HIT domain-containing protein  40.23 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0681  HIT domain-containing protein  40.23 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2396  HIT domain-containing protein  40.23 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0551  HIT domain-containing protein  40.23 
 
 		 152 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2122  histidine triad (HIT) protein  40.86 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.427523  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2734  histidine triad (HIT) protein  40.86 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587938  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2761  histidine triad (HIT) protein  40.86 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0428  histidine triad (HIT) protein  38.2 
 
 		 141 aa  70.5  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0976831  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2785  histidine triad (HIT) protein  41.38 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.804661  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2652  histidine triad (HIT) protein  41.38 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.627712  normal  0.962372 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6061  histidine triad (HIT) protein  41.38 
 
 		 147 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1508  hypothetical protein  36.05 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3912  histidine triad (HIT) protein  31.67 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000268802  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0565  histidine triad (HIT) protein  39.78 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.419431  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0338  histidine triad (HIT) protein  32.5 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.02755e-33 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1291  HIT family protein  38.46 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.691184  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4120  histidine triad (HIT) protein  38.46 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2993  histidine triad (HIT) protein  31.96 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000103081  normal  0.516918 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0368  histidine triad (HIT) protein  37.08 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.462248  normal  0.925731 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4131  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.190525  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2737  hypothetical protein  40.91 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0586419 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3073  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase  29.46 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000547688  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0380  HIT family protein  43.08 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.754034  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1920  HIT family protein  37.5 
 
 		 123 aa  64.3  0.0000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4052  hypothetical protein  37.5 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.663105 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0357  histidine triad (HIT) protein  32.26 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00612046  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0119  histidine triad (HIT) protein  28.69 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1505  histidine triad (HIT) protein  35.51 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0218  hypothetical protein  37.36 
 
 		 142 aa  63.5  0.0000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.181658 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0442  HIT family protein  31.19 
 
 		 120 aa  63.5  0.0000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0345  histidine triad (HIT) protein  39.33 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.598088  normal  0.426855 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1289  histidine triad (HIT) protein  40.91 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>